Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Gm42671-201ENSMUST00000198013 1604 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Olfr1166-201ENSMUST00000099833 1628 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Ktn1-216ENSMUST00000189533 3941 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Fam107b-209ENSMUST00000226435 3602 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 1700019J19Rik-202ENSMUST00000213583 1856 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Olfr644-202ENSMUST00000213184 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Gm12281-201ENSMUST00000119536 298 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Gm14065-201ENSMUST00000120848 585 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Gm14095-201ENSMUST00000134264 516 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Gm25655-201ENSMUST00000158465 290 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Pkib-209ENSMUST00000177325 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Gm26579-201ENSMUST00000181656 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Gm27820-201ENSMUST00000183628 175 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 BE692007-201ENSMUST00000186054 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Gm20877-202ENSMUST00000191358 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Gm34882-201ENSMUST00000193245 974 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Gm43464-201ENSMUST00000198003 317 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Gm44463-201ENSMUST00000198895 137 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 4930487D11Rik-201ENSMUST00000201983 295 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Gm34224-201ENSMUST00000204606 364 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Gm44796-201ENSMUST00000205272 626 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Snhg1-211ENSMUST00000206155 605 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 CAAA01216754.4-201ENSMUST00000216416 802 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Olfr518-202ENSMUST00000217803 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 AC153548.2-201ENSMUST00000219770 885 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 AC160031.1-201ENSMUST00000219914 522 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 AC138330.1-201ENSMUST00000220690 1127 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Gm8672-201ENSMUST00000221200 332 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Gm46369-201ENSMUST00000221577 401 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 CT954323.2-201ENSMUST00000222056 213 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Dhrs9-201ENSMUST00000063690 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Gm37779-201ENSMUST00000194221 3380 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Olfr191-202ENSMUST00000215647 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Fbxl13-201ENSMUST00000051358 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Gm42600-201ENSMUST00000202081 3588 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Gm44827-201ENSMUST00000207963 2229 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Bbox1-201ENSMUST00000046233 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Cntnap5b-201ENSMUST00000086738 4027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Gm37370-201ENSMUST00000191996 1410 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 C230071H17Rik-201ENSMUST00000196044 2973 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Ankrd49-202ENSMUST00000214456 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Pfkfb2-202ENSMUST00000066863 4425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Olfr889-202ENSMUST00000217286 5673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Olfr1171-ps1-202ENSMUST00000150178 1398 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Ascc3-206ENSMUST00000219226 1357 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Vmn1r11-203ENSMUST00000228235 2376 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Lpp-203ENSMUST00000115314 14854 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Gm19514-201ENSMUST00000206856 4489 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Bclaf1-201ENSMUST00000043881 5437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Herc2-202ENSMUST00000164095 15261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Spam1-201ENSMUST00000031693 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Pls3-202ENSMUST00000114057 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Ezh1-201ENSMUST00000100417 3636 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Abcb11-201ENSMUST00000102709 5025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Igkv3-2-201ENSMUST00000103403 378 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Lrrc69-202ENSMUST00000108276 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Olfr1083-ps-201ENSMUST00000117704 943 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Gm14831-201ENSMUST00000120253 409 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Eif1-ps3-201ENSMUST00000121450 342 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Gm16254-201ENSMUST00000131528 730 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Gm12472-201ENSMUST00000153232 1140 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Gm24477-201ENSMUST00000157438 103 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Gm22870-201ENSMUST00000157501 112 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Fabp7-202ENSMUST00000165013 880 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Gm22852-201ENSMUST00000177899 101 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Pou6f2-206ENSMUST00000184299 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Mir6412-201ENSMUST00000184477 97 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Gm27781-201ENSMUST00000185185 92 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 4930440C22Rik-202ENSMUST00000190754 512 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 1700047N06Rik-201ENSMUST00000194474 920 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 AC174780.1-201ENSMUST00000199415 1107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Gm43919-201ENSMUST00000204303 364 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Gm44622-201ENSMUST00000209128 1033 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Olfr663-201ENSMUST00000209914 959 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Gm20946-201ENSMUST00000212367 461 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Gm19936-201ENSMUST00000216414 838 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 AC166323.1-201ENSMUST00000217756 367 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Vmn2r-ps92-201ENSMUST00000220242 388 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 AC123705.4-202ENSMUST00000221602 697 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 AC131745.1-201ENSMUST00000223660 330 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Tpbpb-202ENSMUST00000223698 746 ntAPPRIS P2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Prl7a1-203ENSMUST00000224852 1283 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 AC165260.4-201ENSMUST00000225924 724 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Olfr1133-201ENSMUST00000099855 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Ubtfl1-203ENSMUST00000169398 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Cnot4-207ENSMUST00000202417 3296 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 AC154640.4-201ENSMUST00000226647 4640 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Gm16070-202ENSMUST00000149914 2146 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Gm43164-201ENSMUST00000202529 2128 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Olfr1115-204ENSMUST00000217196 2109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Dnah8-201ENSMUST00000170651 14583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Amd1-201ENSMUST00000099945 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Gm12185-202ENSMUST00000094476 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Vmn1r57-202ENSMUST00000227798 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Gm17101-201ENSMUST00000169520 1588 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Tlr13-201ENSMUST00000040065 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Actn1Q7TPR4 Btla-201ENSMUST00000063654 3235 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms