Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 n-R5s61-201ENSMUST00000122711 118 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 1700061J23Rik-201ENSMUST00000141678 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Crem-222ENSMUST00000144496 978 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Gm13219-202ENSMUST00000152599 685 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Gm24175-201ENSMUST00000158931 129 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Atp2b4-208ENSMUST00000167348 243 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Vmn1r57-201ENSMUST00000170780 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Obox4-ps14-201ENSMUST00000177198 1127 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Gm27234-201ENSMUST00000183362 581 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Ssxb8-202ENSMUST00000185125 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Olfr1055-202ENSMUST00000188023 939 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Gm37560-201ENSMUST00000194289 1000 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Gm43794-201ENSMUST00000200971 692 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Gm44307-201ENSMUST00000204466 764 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 AC134439.1-201ENSMUST00000220923 600 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Gm40394-201ENSMUST00000221321 633 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 AC122295.1-201ENSMUST00000223476 388 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 AC161884.2-201ENSMUST00000224513 227 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 AC134864.1-201ENSMUST00000226326 511 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Vmn1r193-204ENSMUST00000228303 6653 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Olfr1423-202ENSMUST00000214472 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Ptprd-218ENSMUST00000174180 5694 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm3127-202ENSMUST00000171866 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Vmn2r28-201ENSMUST00000086297 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Olfr1188-202ENSMUST00000217131 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Zfp78-201ENSMUST00000086323 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Psd3-205ENSMUST00000098696 11316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Ugt2b5-201ENSMUST00000067790 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 9830107B12Rik-201ENSMUST00000063481 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Mdn1-211ENSMUST00000178134 17959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Vmn1r171-201ENSMUST00000078458 1581 ntAPPRIS P2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Slc19a3-201ENSMUST00000045560 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm15182-201ENSMUST00000120832 1676 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Vmn1r27-203ENSMUST00000228530 3115 ntAPPRIS P2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm19950-204ENSMUST00000208167 4196 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Tcrg-V3-201ENSMUST00000103559 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 1700123O12Rik-204ENSMUST00000146783 577 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Usp49Q6P9L4 Atxn3-204ENSMUST00000160251 998 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Usp49Q6P9L4 Gm37381-201ENSMUST00000192427 899 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Usp49Q6P9L4 4930434O05Rik-201ENSMUST00000203259 387 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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Usp49Q6P9L4 Gm45908-201ENSMUST00000212977 1177 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 1700011B04Rik-211ENSMUST00000222690 394 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 CT030182.2-201ENSMUST00000223569 620 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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Usp49Q6P9L4 Vmn1r175-202ENSMUST00000228383 2878 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Cyp2c38-201ENSMUST00000035488 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Nlrp1b-202ENSMUST00000108514 3541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gria4-204ENSMUST00000212533 5207 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Spef2-201ENSMUST00000041840 4247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Vmn2r-ps130-201ENSMUST00000175853 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Vmn2r-ps129-201ENSMUST00000177509 2568 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Trim38-201ENSMUST00000074067 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm42520-201ENSMUST00000199642 1502 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Fat2-201ENSMUST00000068853 14528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Usp49Q6P9L4 Gm35842-201ENSMUST00000207859 4464 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gp6-202ENSMUST00000206928 5900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Nop58-215ENSMUST00000191142 9507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Vmn2r124-201ENSMUST00000176802 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 9330175M20Rik-201ENSMUST00000189867 2552 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Serpinb5-201ENSMUST00000086701 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Mme-205ENSMUST00000194134 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm26563-202ENSMUST00000181152 1931 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Platr25-202ENSMUST00000220733 2859 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Agbl2-208ENSMUST00000170320 4507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm24789-201ENSMUST00000104282 131 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm22468-201ENSMUST00000116680 120 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm26248-201ENSMUST00000116700 121 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm26137-201ENSMUST00000116701 121 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm26190-201ENSMUST00000116704 121 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm24617-201ENSMUST00000116705 121 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm25778-201ENSMUST00000116713 121 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm25774-201ENSMUST00000116717 121 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm22102-201ENSMUST00000116730 121 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Mir1188-201ENSMUST00000116756 120 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm23177-201ENSMUST00000116784 121 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm24193-201ENSMUST00000116801 121 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm24744-201ENSMUST00000116833 121 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm24427-201ENSMUST00000116896 121 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm22346-201ENSMUST00000116918 121 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm23606-201ENSMUST00000116938 121 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm22029-201ENSMUST00000116940 121 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm26298-201ENSMUST00000116956 121 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm23844-201ENSMUST00000116959 121 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm24484-201ENSMUST00000117009 121 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm25347-201ENSMUST00000117026 121 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm22112-201ENSMUST00000117032 121 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm9432-201ENSMUST00000117810 759 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm12677-201ENSMUST00000118668 426 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm11975-201ENSMUST00000118772 481 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm14554-201ENSMUST00000119548 661 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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