Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm26910-201ENSMUST00000180450 698 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Snhg14-201ENSMUST00000185272 726 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 4930598F16Rik-201ENSMUST00000187352 761 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Ly6c2-203ENSMUST00000188214 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm37517-201ENSMUST00000194004 1289 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Trbv11-201ENSMUST00000194354 260 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm42708-201ENSMUST00000196332 905 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 1700012D16Rik-201ENSMUST00000197231 577 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gbp2-ps-201ENSMUST00000198870 1269 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Igkv12-40-201ENSMUST00000199208 347 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm8999-201ENSMUST00000204951 969 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc72-201ENSMUST00000020853 660 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm7688-201ENSMUST00000212857 337 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 AC156504.1-201ENSMUST00000214608 157 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm18226-201ENSMUST00000215261 521 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 AC165164.1-202ENSMUST00000219324 649 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 AC158803.2-201ENSMUST00000219452 679 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 AC163621.3-201ENSMUST00000221738 1033 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 CT009600.2-201ENSMUST00000226638 481 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 AC124709.3-201ENSMUST00000227294 171 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm6065-201ENSMUST00000081336 492 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm26449-201ENSMUST00000082452 104 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Scgb2b27-201ENSMUST00000085620 512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1116-201ENSMUST00000090717 924 ntAPPRIS P2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm42440-201ENSMUST00000197906 2284 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 B3galt1-201ENSMUST00000042456 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1377-203ENSMUST00000216101 1990 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm13100-201ENSMUST00000117157 1439 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Olfr91-203ENSMUST00000217372 3809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm38240-201ENSMUST00000195110 2487 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Tcp1-ps1-201ENSMUST00000120941 1466 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm11743-201ENSMUST00000117385 1735 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Glra3-201ENSMUST00000000275 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Scaper-205ENSMUST00000217647 4370 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Olfr622-202ENSMUST00000213536 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Klhl13-205ENSMUST00000115319 3349 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm24350-201ENSMUST00000104163 133 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm22661-201ENSMUST00000104192 132 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm25917-201ENSMUST00000104267 130 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 1110059G10Rik-202ENSMUST00000118422 723 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Olfr590-ps1-201ENSMUST00000118801 898 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm7657-201ENSMUST00000118851 666 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm15603-201ENSMUST00000119252 492 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm12422-201ENSMUST00000121431 302 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm11349-201ENSMUST00000122209 1116 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm15300-201ENSMUST00000122324 279 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Olfr406-201ENSMUST00000133561 1101 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm14974-201ENSMUST00000139112 804 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm13708-201ENSMUST00000145170 390 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm26346-201ENSMUST00000157525 329 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm23762-201ENSMUST00000158348 106 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm15898-201ENSMUST00000162213 627 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm17366-201ENSMUST00000167629 187 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm9597-201ENSMUST00000171913 602 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm27512-201ENSMUST00000175328 126 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm27854-201ENSMUST00000175578 244 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s209-201ENSMUST00000179494 119 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 1700101I11Rik-201ENSMUST00000181594 896 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm9127-201ENSMUST00000188041 985 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm37430-201ENSMUST00000193039 196 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 1700023G09Rik-202ENSMUST00000194671 308 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm37308-201ENSMUST00000194684 100 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Il6-202ENSMUST00000195978 651 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 AC157822.1-201ENSMUST00000196643 80 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Il6-204ENSMUST00000199765 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 1110060G06Rik-201ENSMUST00000200372 499 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm39197-201ENSMUST00000212069 457 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm7439-201ENSMUST00000214053 835 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 AC122395.1-201ENSMUST00000214666 374 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 AC104906.1-201ENSMUST00000218122 913 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm17177-202ENSMUST00000222007 990 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 A930023M06Rik-201ENSMUST00000223270 1093 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 AC164295.1-201ENSMUST00000224861 186 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s156-201ENSMUST00000083377 105 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm20287-201ENSMUST00000172848 2367 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm17791-201ENSMUST00000185660 1501 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Has2-201ENSMUST00000050544 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Frmpd3-201ENSMUST00000044702 3141 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Usp9x-201ENSMUST00000089302 11887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Postn-202ENSMUST00000081564 2670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1341-202ENSMUST00000214131 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Sbno1-201ENSMUST00000065263 10071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Pof1b-201ENSMUST00000039887 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm7195-201ENSMUST00000190869 1707 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Olfr646-202ENSMUST00000214099 3778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm37527-201ENSMUST00000192406 3547 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Olfr933-202ENSMUST00000216238 4475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Tnfrsf26-202ENSMUST00000208124 3062 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Atrx-202ENSMUST00000113573 10275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Hgf-203ENSMUST00000196645 2189 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm44248-201ENSMUST00000203079 1549 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gpr65-201ENSMUST00000075072 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm3636-201ENSMUST00000100904 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 9230009I02Rik-201ENSMUST00000101255 1148 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Trbv12-1-201ENSMUST00000103267 389 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Hbb-bh2-201ENSMUST00000106866 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm3173-201ENSMUST00000112776 519 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r-ps2-201ENSMUST00000118464 834 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm13259-201ENSMUST00000120792 456 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms