Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Vmn1r149-201ENSMUST00000165916 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm17223-201ENSMUST00000171413 481 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm4187-201ENSMUST00000172551 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm4133-201ENSMUST00000172989 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm21959-201ENSMUST00000178439 452 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm5849-201ENSMUST00000180151 351 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 4930445N18Rik-201ENSMUST00000180631 886 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm7135-201ENSMUST00000187538 675 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm5734-201ENSMUST00000189787 913 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm37884-201ENSMUST00000191857 818 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Olfr1311-201ENSMUST00000208536 943 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm36423-204ENSMUST00000222446 541 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 AC158511.1-201ENSMUST00000223622 764 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 AC161609.1-201ENSMUST00000225878 474 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 AC116724.1-201ENSMUST00000227900 972 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Anxa10-202ENSMUST00000034054 1222 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Vaultrc5-201ENSMUST00000083211 143 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm25139-201ENSMUST00000083247 210 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Mir412-201ENSMUST00000083636 80 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Olfr810-201ENSMUST00000091986 1006 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm10780-201ENSMUST00000099459 285 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Hbp1-201ENSMUST00000167458 2733 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Fap-201ENSMUST00000000402 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Ankar-203ENSMUST00000212573 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Epha7-203ENSMUST00000108191 6615 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Chrm3-201ENSMUST00000063093 1770 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Cfap61-207ENSMUST00000138774 3308 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 AC163032.1-201ENSMUST00000220671 2970 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm19950-204ENSMUST00000208167 4196 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm12633-201ENSMUST00000117742 1705 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm13928-201ENSMUST00000120326 1732 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Olfr945-202ENSMUST00000216698 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm20125-201ENSMUST00000185722 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Nt5c3-202ENSMUST00000101367 1519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Vmn1r90-202ENSMUST00000226264 7796 ntAPPRIS P2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Olfr701-203ENSMUST00000217739 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Lrrc4c-202ENSMUST00000135431 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm28672-201ENSMUST00000188727 1490 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Vmn1r6-207ENSMUST00000228285 7950 ntAPPRIS P2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm9700-201ENSMUST00000193786 1617 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Cpa6-201ENSMUST00000035577 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Uba6-201ENSMUST00000039373 6590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Zfy1-202ENSMUST00000189888 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm12734-201ENSMUST00000120228 948 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 n-R5s24-201ENSMUST00000122518 117 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 3110004A20Rik-201ENSMUST00000123904 385 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Ptprtos-201ENSMUST00000151688 630 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm12472-201ENSMUST00000153232 1140 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm27039-201ENSMUST00000182438 962 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Snhg6-205ENSMUST00000182819 816 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm28103-201ENSMUST00000188392 416 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 1700031M16Rik-204ENSMUST00000189724 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm28137-201ENSMUST00000191478 416 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 C030032O16Rik-201ENSMUST00000196427 716 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm42625-201ENSMUST00000198611 922 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm18599-201ENSMUST00000206729 1125 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Olfr1439-ps1-201ENSMUST00000207089 824 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm44893-201ENSMUST00000207259 443 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 AC153548.2-201ENSMUST00000219770 885 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 AC154323.1-201ENSMUST00000228329 1231 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Olfr792-201ENSMUST00000076575 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Olfr1206-201ENSMUST00000077302 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Mir342-201ENSMUST00000083502 99 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Mir30b-201ENSMUST00000083542 96 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 n-R5s13-201ENSMUST00000093707 119 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Vmn1r171-201ENSMUST00000078458 1581 ntAPPRIS P2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Olfr419-202ENSMUST00000214725 2685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Vmn1r71-202ENSMUST00000226874 5194 ntAPPRIS P2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm43027-201ENSMUST00000202906 3691 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Olfr1499-202ENSMUST00000216659 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Vmn2r33-201ENSMUST00000165921 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Olfr1261-204ENSMUST00000216953 3176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Txlng-202ENSMUST00000112314 3348 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Vmn1r80-206ENSMUST00000228028 6918 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Vmn2r95-201ENSMUST00000166327 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm39043-201ENSMUST00000207602 2081 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Olfr350-203ENSMUST00000215100 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm37854-201ENSMUST00000192149 1463 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Far2-202ENSMUST00000111607 3395 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Olfr979-202ENSMUST00000215523 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Matr3-201ENSMUST00000166793 6262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps100-201ENSMUST00000221238 1702 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Vmn1r13-202ENSMUST00000226892 5156 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Olfr829-202ENSMUST00000212229 2590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 B4galt4-203ENSMUST00000114710 837 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm16394-201ENSMUST00000117289 675 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm11433-201ENSMUST00000118318 228 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm12162-201ENSMUST00000123422 154 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm15892-201ENSMUST00000152627 439 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm23115-201ENSMUST00000158480 108 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm10087-201ENSMUST00000167650 330 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm44501-201ENSMUST00000167713 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm17333-201ENSMUST00000169531 378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm24111-201ENSMUST00000175491 97 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps6-201ENSMUST00000176317 1101 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Pkib-209ENSMUST00000177325 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm9499-201ENSMUST00000180888 964 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm27234-201ENSMUST00000183362 581 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm27148-201ENSMUST00000185086 160 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
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