Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Mir7037-201ENSMUST00000184414 65 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm42663-201ENSMUST00000199883 351 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 AC152979.3-201ENSMUST00000217720 479 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 AC161114.1-201ENSMUST00000218223 474 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 AC154724.1-201ENSMUST00000225782 821 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 AC133517.2-201ENSMUST00000226820 690 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 4930583I09Rik-201ENSMUST00000024896 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm4963-201ENSMUST00000072718 378 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Olfr664-201ENSMUST00000072887 966 ntAPPRIS P5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Mir337-201ENSMUST00000083592 97 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Olfr894-201ENSMUST00000093866 949 ntAPPRIS P2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 4933439N06Rik-201ENSMUST00000203062 1365 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Jchain-201ENSMUST00000087033 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm3115-201ENSMUST00000166928 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm10436-201ENSMUST00000071580 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 BC003331-204ENSMUST00000097547 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Zfp874b-201ENSMUST00000019572 3744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gabra6-201ENSMUST00000020703 2436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 AC169985.1-201ENSMUST00000223648 2439 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Chd9-202ENSMUST00000109614 11565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Ugt2b1-201ENSMUST00000031183 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Dctn4-201ENSMUST00000025505 3738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Abca16-202ENSMUST00000120490 5088 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Cfap61-207ENSMUST00000138774 3308 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Nlgn1-202ENSMUST00000108308 4272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Kcnma1-204ENSMUST00000112423 3664 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Cd44-202ENSMUST00000060516 3495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm30332-201ENSMUST00000204221 2345 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Rptn-201ENSMUST00000045912 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Spaca1-203ENSMUST00000108148 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Ap3s1-ps1-201ENSMUST00000117113 579 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm13867-201ENSMUST00000120844 395 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 4933416E14Rik-201ENSMUST00000130841 491 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 2210408F21Rik-203ENSMUST00000133510 429 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm23673-201ENSMUST00000157474 298 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Obox3-ps8-201ENSMUST00000177182 960 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm4791-201ENSMUST00000178065 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Ap3s1-ps2-201ENSMUST00000178107 579 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm7976-201ENSMUST00000181507 1242 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Rian-217ENSMUST00000183266 687 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm27543-201ENSMUST00000183562 177 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Mir7012-201ENSMUST00000183900 64 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 4930519F24Rik-201ENSMUST00000185764 579 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm28061-201ENSMUST00000189085 807 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm28389-201ENSMUST00000190090 697 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm8480-201ENSMUST00000190350 698 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm36983-201ENSMUST00000192280 1102 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Ighv1-3-201ENSMUST00000192764 302 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm20056-201ENSMUST00000194813 519 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Igkv12-40-201ENSMUST00000199208 347 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm42983-201ENSMUST00000199879 815 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm19617-201ENSMUST00000202977 308 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm18007-201ENSMUST00000205019 844 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm6145-201ENSMUST00000209522 710 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm30313-201ENSMUST00000216806 597 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 CT025625.1-201ENSMUST00000217786 460 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 AC132384.6-201ENSMUST00000218976 1206 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 AC121137.1-201ENSMUST00000225272 602 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 AC154527.3-201ENSMUST00000225519 989 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Lcn12-201ENSMUST00000028312 716 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Cox6b2-201ENSMUST00000063324 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm10112-201ENSMUST00000075226 354 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Vmn1r33-201ENSMUST00000079678 1036 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Ccdc68-202ENSMUST00000080050 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm26063-201ENSMUST00000083378 107 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm22741-201ENSMUST00000083438 165 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Olfr1407-ps1-201ENSMUST00000085885 797 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Olfr547-201ENSMUST00000098229 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm14296-201ENSMUST00000099007 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 2210418O10Rik-201ENSMUST00000099009 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Zscan4-ps1-201ENSMUST00000165848 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 AC154227.1-201ENSMUST00000228809 2467 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Lpp-202ENSMUST00000078988 15440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Ckap5-201ENSMUST00000046769 6511 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 A830019P07Rik-201ENSMUST00000178904 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 C130073E24Rik-202ENSMUST00000211313 14112 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Vmn1r71-206ENSMUST00000228098 7165 ntAPPRIS P2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm43696-201ENSMUST00000199385 6071 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm29098-201ENSMUST00000186104 1498 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm28130-201ENSMUST00000186321 1498 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm28089-202ENSMUST00000187266 1498 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm29204-202ENSMUST00000187384 1498 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm28753-201ENSMUST00000187804 1498 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm28518-203ENSMUST00000188788 1498 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm29131-202ENSMUST00000189485 1498 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm28284-202ENSMUST00000190221 1498 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm28764-203ENSMUST00000191194 1498 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Spata1-206ENSMUST00000197980 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm43282-201ENSMUST00000201848 2157 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 4930435E12Rik-201ENSMUST00000122078 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Kcnh8-201ENSMUST00000039366 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Nlrp4a-204ENSMUST00000146907 3479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Olfr635-202ENSMUST00000209473 8565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Ighv9-4-201ENSMUST00000103482 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Traj25-201ENSMUST00000103716 57 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm14575-201ENSMUST00000117210 560 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm11742-201ENSMUST00000119903 233 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm14619-201ENSMUST00000120480 168 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm13489-201ENSMUST00000121234 971 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
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