Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm23789-201ENSMUST00000122536 301 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm3077-201ENSMUST00000165903 627 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Vmn1r-ps79-201ENSMUST00000173508 963 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Vmn1r-ps70-201ENSMUST00000173675 963 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PtprmP28828 4930598F16Rik-201ENSMUST00000187352 761 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm38163-201ENSMUST00000194112 482 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm43020-201ENSMUST00000197178 372 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm45007-201ENSMUST00000206237 366 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Desi2-202ENSMUST00000069568 1193 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm4724-201ENSMUST00000109045 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Olfr1493-ps1-202ENSMUST00000208667 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PtprmP28828 4930467D21Rik-201ENSMUST00000180634 2530 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm38351-201ENSMUST00000195466 2518 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Slfn14-201ENSMUST00000163961 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Nfatc3-202ENSMUST00000211991 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PtprmP28828 4930516K23Rik-201ENSMUST00000074064 6133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Naip2-203ENSMUST00000167986 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm42715-201ENSMUST00000189629 12746 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Olfr845-203ENSMUST00000215572 3446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm19368-201ENSMUST00000221258 4424 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PtprmP28828 AC142245.1-201ENSMUST00000226611 1505 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm43314-201ENSMUST00000196744 2231 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Frmpd4-202ENSMUST00000112146 8153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm22269-201ENSMUST00000104002 130 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PtprmP28828 4930404H24Rik-201ENSMUST00000109783 331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm15603-201ENSMUST00000119252 492 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm12693-201ENSMUST00000121965 483 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm15350-201ENSMUST00000135138 569 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm3159-201ENSMUST00000164038 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm28129-201ENSMUST00000186273 537 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm28692-202ENSMUST00000189645 621 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm30280-201ENSMUST00000192214 262 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Trbv11-201ENSMUST00000194354 260 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm20940-201ENSMUST00000197308 360 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm33758-201ENSMUST00000199230 407 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Klra14-ps-202ENSMUST00000203601 1104 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PtprmP28828 AC125041.1-201ENSMUST00000218264 876 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PtprmP28828 AC138765.1-201ENSMUST00000228657 385 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Vmn1r210-202ENSMUST00000226180 3116 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm37181-201ENSMUST00000192513 1727 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Sox5-201ENSMUST00000038815 7243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Aftph-205ENSMUST00000146722 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PtprmP28828 AC154227.1-201ENSMUST00000228809 2467 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Prdm11-202ENSMUST00000111274 11678 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PtprmP28828 4930544L04Rik-202ENSMUST00000211181 3204 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Nedd9-201ENSMUST00000021794 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Ifi208-202ENSMUST00000169857 1767 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Elf1-202ENSMUST00000110835 3888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Sox6-204ENSMUST00000166877 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm44843-201ENSMUST00000208320 1396 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Olfr726-206ENSMUST00000217025 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Cyld-206ENSMUST00000209559 4476 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Olfr270-204ENSMUST00000215127 3145 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Nckap5-201ENSMUST00000057846 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Olfr167-202ENSMUST00000214315 7435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Ksr2-202ENSMUST00000180430 13125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Psmc6-201ENSMUST00000022380 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Hapln1-201ENSMUST00000022108 5715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm12717-201ENSMUST00000118427 983 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Defa-ps14-201ENSMUST00000121373 418 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PtprmP28828 1700007M16Rik-201ENSMUST00000129075 435 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm14710-201ENSMUST00000146082 1066 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Rpl31-ps24-201ENSMUST00000181350 379 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm11394-201ENSMUST00000181421 517 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Cox6b2-202ENSMUST00000182048 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm27781-201ENSMUST00000185185 92 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm21461-201ENSMUST00000200382 863 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Olfr854-202ENSMUST00000212872 939 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PtprmP28828 CT030195.1-201ENSMUST00000223887 378 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PtprmP28828 AC121978.1-201ENSMUST00000228357 380 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PtprmP28828 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Ceacam11-201ENSMUST00000094799 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Naip6-201ENSMUST00000042220 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm45324-201ENSMUST00000211193 5638 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gprc6a-202ENSMUST00000218684 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Fndc3c1-201ENSMUST00000039447 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PtprmP28828 5430401H09Rik-202ENSMUST00000218836 2620 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm2099-202ENSMUST00000223310 3341 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Lamp3-201ENSMUST00000081880 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm13582-201ENSMUST00000146034 2655 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Utp20-201ENSMUST00000004470 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gal3st2c-201ENSMUST00000097632 9667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Vmn2r61-201ENSMUST00000166131 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Impg1-201ENSMUST00000085289 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm44242-201ENSMUST00000204212 2721 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm12711-201ENSMUST00000131249 340 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm24520-201ENSMUST00000179510 110 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm26652-201ENSMUST00000180592 373 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm26992-201ENSMUST00000182089 468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm28390-201ENSMUST00000185212 700 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprmP28828 C4bp-ps1-201ENSMUST00000189393 706 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm43144-201ENSMUST00000198256 485 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm45628-201ENSMUST00000210849 274 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Gm5750-201ENSMUST00000218711 801 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprmP28828 AC154592.1-201ENSMUST00000225784 574 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Olfr860-201ENSMUST00000086482 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PtprmP28828 Pot1a-201ENSMUST00000115327 2447 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms