Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm33571-201ENSMUST00000193271 657 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm8874-201ENSMUST00000196826 286 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RxraP28700 Mir142-201ENSMUST00000198092 64 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm4742-201ENSMUST00000200261 771 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm43629-201ENSMUST00000201782 704 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm20997-201ENSMUST00000205148 231 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm44876-201ENSMUST00000205394 670 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RxraP28700 Snhg1-211ENSMUST00000206155 605 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RxraP28700 Olfr712-ps1-201ENSMUST00000207690 950 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm19921-201ENSMUST00000210505 703 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm7706-202ENSMUST00000211278 590 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm39384-201ENSMUST00000213703 743 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RxraP28700 AC069561.4-201ENSMUST00000215291 572 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm19174-201ENSMUST00000216944 956 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm8672-201ENSMUST00000221200 332 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RxraP28700 Tmed10-203ENSMUST00000222585 619 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RxraP28700 AC156802.1-201ENSMUST00000223623 579 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RxraP28700 AC167013.2-202ENSMUST00000227035 333 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RxraP28700 Prl2c1-201ENSMUST00000054932 681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RxraP28700 Vmn1r225-201ENSMUST00000061660 897 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm16335-201ENSMUST00000077495 309 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RxraP28700 Olfr847-201ENSMUST00000079620 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RxraP28700 Rpl35a-ps7-201ENSMUST00000080603 333 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm10221-201ENSMUST00000088299 309 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RxraP28700 Olfr1200-201ENSMUST00000099811 1011 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RxraP28700 Dnah2-202ENSMUST00000108659 13704 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RxraP28700 1700017N19Rik-204ENSMUST00000188736 1709 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RxraP28700 Flrt2-201ENSMUST00000057324 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RxraP28700 AC155941.5-201ENSMUST00000218925 1505 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RxraP28700 Olfr736-203ENSMUST00000213755 2338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm7680-201ENSMUST00000216198 1348 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm26523-201ENSMUST00000180713 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RxraP28700 Btbd35f21-201ENSMUST00000105017 1943 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.53
RxraP28700 Btbd35f27-201ENSMUST00000178143 1943 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.53
RxraP28700 Btbd35f2-201ENSMUST00000179991 1949 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.53
RxraP28700 Btbd35f16-201ENSMUST00000185755 1949 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm13084-201ENSMUST00000075045 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
RxraP28700 Zfp229-203ENSMUST00000182603 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm37018-201ENSMUST00000192441 3869 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm42736-201ENSMUST00000200723 1353 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm43567-201ENSMUST00000197581 1978 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm3636-201ENSMUST00000100904 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 Traj7-201ENSMUST00000103733 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm14403-202ENSMUST00000108947 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm14444-202ENSMUST00000109070 1281 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm3173-201ENSMUST00000112776 519 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm14744-201ENSMUST00000114039 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 Hmgn2l6-201ENSMUST00000115986 267 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm11781-201ENSMUST00000118328 472 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm14831-201ENSMUST00000120253 409 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm12482-201ENSMUST00000120435 630 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm24383-201ENSMUST00000122691 333 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm4660-201ENSMUST00000131499 403 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 4930577H14Rik-201ENSMUST00000151367 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm14637-201ENSMUST00000156516 444 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm23662-201ENSMUST00000158046 111 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm3173-202ENSMUST00000164603 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm3264-201ENSMUST00000166410 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm3173-203ENSMUST00000166848 396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm8108-201ENSMUST00000167397 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 Rab11a-206ENSMUST00000169058 462 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 Vmn1r170-201ENSMUST00000170166 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 Vmn1r158-201ENSMUST00000174643 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm3005-201ENSMUST00000178060 444 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm21693-201ENSMUST00000178531 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm21677-201ENSMUST00000179508 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm3376-201ENSMUST00000180202 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm21708-201ENSMUST00000180310 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm27155-201ENSMUST00000183716 898 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm27855-201ENSMUST00000184122 128 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm7266-201ENSMUST00000187999 405 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm38280-201ENSMUST00000192610 158 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm38097-201ENSMUST00000192936 439 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm43315-201ENSMUST00000198120 313 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 Trav23-201ENSMUST00000199137 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm6639-204ENSMUST00000199182 800 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm43596-201ENSMUST00000202818 884 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 Clec2j-202ENSMUST00000203658 606 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm44332-201ENSMUST00000203712 433 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm4374-201ENSMUST00000204929 424 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm3912-203ENSMUST00000211024 367 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 Olfr529-ps1-201ENSMUST00000211097 928 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm45485-201ENSMUST00000211229 357 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 AC153968.2-201ENSMUST00000215579 1140 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 AC124732.4-201ENSMUST00000220930 1274 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 AC107711.2-203ENSMUST00000227827 762 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 AC133654.1-201ENSMUST00000228411 672 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 AC154838.1-201ENSMUST00000228944 911 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 Olfr813-201ENSMUST00000064893 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 Olfr482-201ENSMUST00000081184 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 Rpl36a-ps1-201ENSMUST00000081987 449 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm24144-201ENSMUST00000082632 111 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 Olfr1321-201ENSMUST00000088876 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 Olfr497-202ENSMUST00000213521 2396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm10635-201ENSMUST00000217201 3721 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 Senp7-203ENSMUST00000089362 4825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 Vmn1r80-206ENSMUST00000228028 6918 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 Fastkd2-201ENSMUST00000027103 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm43462-201ENSMUST00000200265 3648 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RxraP28700 Olfr109-202ENSMUST00000214668 5861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
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