Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Gm12850-201ENSMUST00000119210 436 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Rps11-ps2-201ENSMUST00000121547 456 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Gm22959-201ENSMUST00000122514 303 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Parp4-201ENSMUST00000161553 6387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Gm7152-201ENSMUST00000163570 605 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Gm18343-201ENSMUST00000172802 604 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Gm4665-201ENSMUST00000183244 561 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Gm29086-201ENSMUST00000186774 222 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Gm29085-201ENSMUST00000187108 225 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Gm8498-201ENSMUST00000188227 974 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Gm37947-201ENSMUST00000192740 894 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Gm8325-202ENSMUST00000193411 182 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Gm37308-201ENSMUST00000194684 100 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 2900060B14Rik-201ENSMUST00000203191 616 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Gm45075-201ENSMUST00000208426 649 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Gm45382-201ENSMUST00000210607 151 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Gm7639-201ENSMUST00000212608 484 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Scoc-209ENSMUST00000212905 798 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 3110043J17Rik-201ENSMUST00000219153 760 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 AC165164.1-202ENSMUST00000219324 649 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 AC154635.1-201ENSMUST00000221433 400 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Lcn12-201ENSMUST00000028312 716 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Olfr1102-201ENSMUST00000055129 1063 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Olfr248-201ENSMUST00000075329 1010 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Gm7995-201ENSMUST00000089789 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Zkscan8-204ENSMUST00000224362 6954 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Cbx5-201ENSMUST00000108813 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Gm10635-201ENSMUST00000217201 3721 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Ckap5-201ENSMUST00000046769 6511 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Vmn1r90-206ENSMUST00000227566 6901 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 AC124446.1-201ENSMUST00000221027 2644 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Gm12022-201ENSMUST00000143311 1340 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Zpld1-202ENSMUST00000143914 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Vmn1r-ps73-201ENSMUST00000173130 2120 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Adgb-205ENSMUST00000179956 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Mdn1-211ENSMUST00000178134 17959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Olfr303-204ENSMUST00000215733 3914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Ryr3-210ENSMUST00000208151 15370 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Mfn1-202ENSMUST00000118286 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Gm28710-202ENSMUST00000211738 2987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Arhgap12-202ENSMUST00000077128 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 AC125095.1-201ENSMUST00000228387 2020 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Vmn2r88-202ENSMUST00000159674 3098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Sri-202ENSMUST00000088786 2504 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Phc3-209ENSMUST00000168645 10976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 AC151971.5-202ENSMUST00000215946 3188 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Vmn1r218-203ENSMUST00000227050 10364 ntAPPRIS P2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Gm16200-201ENSMUST00000120385 331 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Gm13593-201ENSMUST00000121329 692 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Astx4d-201ENSMUST00000123136 1149 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Astx3-201ENSMUST00000123508 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Tctex1d1-203ENSMUST00000125417 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Prl2c5-202ENSMUST00000126540 971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Gm26372-201ENSMUST00000157831 236 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Gm23224-201ENSMUST00000158122 271 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Gm25445-201ENSMUST00000158996 299 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Gm15795-201ENSMUST00000160969 553 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Gm8837-201ENSMUST00000161037 1107 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Gm17732-201ENSMUST00000163259 821 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Gm6673-201ENSMUST00000166114 700 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 A730017C20Rik-206ENSMUST00000175830 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Astx4a-201ENSMUST00000177683 1149 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Astx1c-201ENSMUST00000177724 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Astx4c-201ENSMUST00000178390 1149 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Gm21693-201ENSMUST00000178531 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Astx1b-201ENSMUST00000178608 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Astx2-201ENSMUST00000179135 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Astx4b-201ENSMUST00000179359 1149 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Gm21677-201ENSMUST00000179508 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Astx1a-201ENSMUST00000179529 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Astx5-201ENSMUST00000179723 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Gm3376-201ENSMUST00000180202 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Gm21708-201ENSMUST00000180310 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Gm1972-201ENSMUST00000181606 964 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Zcchc10-201ENSMUST00000018383 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Gm3605-201ENSMUST00000185858 440 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Gm28075-201ENSMUST00000189179 354 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Gm29409-202ENSMUST00000189623 901 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 4930434B07Rik-201ENSMUST00000190254 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Gm37610-201ENSMUST00000191867 620 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Csn1s2b-204ENSMUST00000197301 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Gm7733-201ENSMUST00000199038 919 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Olfr1310-201ENSMUST00000207169 1009 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 4930598N05Rik-205ENSMUST00000208693 873 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Gm39384-201ENSMUST00000213703 743 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 AC125041.1-201ENSMUST00000218264 876 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Gm1000-201ENSMUST00000220520 801 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Gm30239-202ENSMUST00000223193 631 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Olfr352-201ENSMUST00000065416 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Rpl21-ps6-201ENSMUST00000074828 468 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Olfr191-201ENSMUST00000078517 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Gm37834-201ENSMUST00000194517 3035 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Gm5844-201ENSMUST00000119417 2191 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Scn1a-204ENSMUST00000112371 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Gm37092-201ENSMUST00000193381 1518 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Platr21-201ENSMUST00000126339 3511 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Vmn1r37-202ENSMUST00000226311 1305 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Macf1-204ENSMUST00000106213 18957 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Gm20756-202ENSMUST00000201324 1565 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Taf4bG5E8Z2 Gm44660-201ENSMUST00000207134 2465 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms