Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Il13ra2-201ENSMUST00000033646 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Ppip5k2-205ENSMUST00000171129 3425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm37926-201ENSMUST00000191922 2424 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Olfr813-202ENSMUST00000204622 2410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm23014-201ENSMUST00000104144 130 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm24792-201ENSMUST00000104286 128 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm3086-201ENSMUST00000110560 620 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Itpa-ps3-201ENSMUST00000119034 395 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Cep97-204ENSMUST00000121129 989 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 4930563I02Rik-202ENSMUST00000154835 971 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm22819-201ENSMUST00000157445 303 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm23673-201ENSMUST00000157474 298 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm3084-201ENSMUST00000169967 598 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r-ps60-201ENSMUST00000173467 852 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm20519-201ENSMUST00000173684 359 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Vmn2r-ps124-201ENSMUST00000176236 903 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Ssxb8-202ENSMUST00000185125 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm28784-201ENSMUST00000187817 1011 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm20561-201ENSMUST00000188131 292 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Mrgprb9-ps-201ENSMUST00000188739 892 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm18864-201ENSMUST00000194518 1051 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm43370-201ENSMUST00000196437 284 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm38562-201ENSMUST00000199398 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm42761-201ENSMUST00000201899 738 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm43580-201ENSMUST00000202892 284 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm32507-201ENSMUST00000209552 437 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Olfr1297-201ENSMUST00000099612 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 BB019430-202ENSMUST00000218015 1320 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm42676-201ENSMUST00000197609 2686 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r200-205ENSMUST00000228726 5525 ntAPPRIS P2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Bmpr1b-204ENSMUST00000106232 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Slc35a5-201ENSMUST00000023344 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Olfr387-ps1-201ENSMUST00000134773 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Hc-201ENSMUST00000028233 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm3259-202ENSMUST00000160045 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm2309-201ENSMUST00000149994 1941 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 B230217J21Rik-201ENSMUST00000218349 3896 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Olfr373-203ENSMUST00000215198 3923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm29515-201ENSMUST00000188273 2077 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Zfp933-201ENSMUST00000105718 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Zfp113-201ENSMUST00000049393 6470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 AC154630.1-201ENSMUST00000215334 2440 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Rmi1-204ENSMUST00000225815 2447 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Mme-205ENSMUST00000194134 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Vmn2r-ps54-202ENSMUST00000150147 2952 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 AC153144.1-201ENSMUST00000221759 3139 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm25420-201ENSMUST00000104216 127 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Cdh17-202ENSMUST00000108303 3287 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Cbx3-ps3-201ENSMUST00000118595 550 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm23954-201ENSMUST00000157213 353 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm29084-201ENSMUST00000185587 1452 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm28786-201ENSMUST00000187228 172 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Lrriq3-203ENSMUST00000194376 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm44674-201ENSMUST00000206159 415 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Abca15-204ENSMUST00000207220 567 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm17994-201ENSMUST00000209260 533 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Tpt1-ps4-201ENSMUST00000210908 503 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm7529-201ENSMUST00000213753 1897 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Olfr1295-203ENSMUST00000217772 5539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 1700015C15Rik-201ENSMUST00000221465 374 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 AC121804.2-201ENSMUST00000222531 316 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 AC154562.1-201ENSMUST00000226140 966 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Tsga13-201ENSMUST00000048580 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm94-201ENSMUST00000096570 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Rhbdd1-202ENSMUST00000140020 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r204-202ENSMUST00000228195 2936 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm10165-201ENSMUST00000217666 2380 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Zmynd11-201ENSMUST00000062658 3796 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Postn-204ENSMUST00000117373 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Celf2-201ENSMUST00000002176 7718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm23481-201ENSMUST00000104173 131 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm12005-201ENSMUST00000121451 379 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm15263-201ENSMUST00000121556 642 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm14564-201ENSMUST00000122159 294 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm15530-201ENSMUST00000122206 555 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Rpl26-ps5-201ENSMUST00000122220 439 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm2165-201ENSMUST00000124609 1118 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm14553-201ENSMUST00000126711 1118 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm14410-202ENSMUST00000133301 1113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm2101-204ENSMUST00000137421 1118 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm3669-205ENSMUST00000144018 1118 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Ptprtos-201ENSMUST00000151688 630 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm23279-201ENSMUST00000157912 97 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 4930445B16Rik-201ENSMUST00000170085 1123 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm11007-201ENSMUST00000177700 195 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm2007-201ENSMUST00000177981 195 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm2004-203ENSMUST00000179349 195 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Il20-202ENSMUST00000188581 465 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm29138-201ENSMUST00000191444 348 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm37632-201ENSMUST00000191811 1142 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm8823-201ENSMUST00000193158 433 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm43350-201ENSMUST00000196382 711 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Igkv12-40-201ENSMUST00000199208 347 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm44237-201ENSMUST00000205183 936 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 AC158511.1-201ENSMUST00000223622 764 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Olfr168-201ENSMUST00000078554 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Olfr552-201ENSMUST00000098223 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm10636-201ENSMUST00000197639 2419 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Eif2s2-205ENSMUST00000166171 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms