Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm45524-201ENSMUST00000211374 1250 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 AC124732.4-201ENSMUST00000220930 1274 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 n-R5s62-201ENSMUST00000082780 96 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm23508-201ENSMUST00000083079 72 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Stxbp3-ps-201ENSMUST00000090527 758 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Chrna6-201ENSMUST00000033882 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Nipal1-201ENSMUST00000087212 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Epha3-201ENSMUST00000064405 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Zfp120-203ENSMUST00000109931 4033 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 C230071H17Rik-201ENSMUST00000196044 2973 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Slc39a12-202ENSMUST00000114731 2648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Foxr2-201ENSMUST00000096265 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Olfr1173-201ENSMUST00000099830 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 AC154573.1-201ENSMUST00000225913 4659 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Vmn1r20-202ENSMUST00000227909 3709 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Olfr1449-203ENSMUST00000214079 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Rbm46os-201ENSMUST00000131274 3261 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Ktn1-215ENSMUST00000189101 3761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Gm39043-201ENSMUST00000207602 2081 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 D030025E07Rik-203ENSMUST00000197413 2346 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 AY512915-203ENSMUST00000159937 3650 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Vmn1r196-204ENSMUST00000228382 6525 ntAPPRIS P2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
Grik3B1AS29 Olfr1310-202ENSMUST00000213559 4897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Cept1-201ENSMUST00000039153 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Olfr684-202ENSMUST00000215552 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Olfr684-204ENSMUST00000217136 3182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm14988-201ENSMUST00000117224 1548 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm22266-201ENSMUST00000104011 138 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm24350-201ENSMUST00000104163 133 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm14756-201ENSMUST00000116395 240 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm11550-201ENSMUST00000118210 699 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm4910-201ENSMUST00000119605 366 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm11679-201ENSMUST00000121830 779 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 n-R5s24-201ENSMUST00000122518 117 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Olfr1134-202ENSMUST00000135875 1291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 1700093J21Rik-201ENSMUST00000143671 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm11846-201ENSMUST00000155156 515 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 1700116B05Rik-201ENSMUST00000173461 414 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm20417-201ENSMUST00000174784 425 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Mir5112-201ENSMUST00000174897 60 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Tceanc-203ENSMUST00000180322 1080 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm8941-201ENSMUST00000181451 899 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm34176-201ENSMUST00000192621 474 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm30097-201ENSMUST00000193581 447 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm44074-201ENSMUST00000204562 337 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 A730082K24Rik-201ENSMUST00000205365 465 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 AC159379.1-201ENSMUST00000218192 620 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 AC153840.1-201ENSMUST00000219685 313 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 AC160031.1-201ENSMUST00000219914 522 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 AC154851.1-201ENSMUST00000221591 655 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm4963-201ENSMUST00000072718 378 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Olfr1503-ps1-201ENSMUST00000076614 803 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Vmn1r216-201ENSMUST00000080253 1059 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm23514-201ENSMUST00000082827 130 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Olfr878-201ENSMUST00000086061 1065 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Olfr1134-201ENSMUST00000099857 1102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Vmn1r80-206ENSMUST00000228028 6918 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Serpinb9e-201ENSMUST00000071873 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Wdr17-209ENSMUST00000150488 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Orc2-202ENSMUST00000114325 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm21292-201ENSMUST00000171947 1563 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 P2ry12-202ENSMUST00000170388 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Ireb2-201ENSMUST00000034843 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Vmn1r57-202ENSMUST00000227798 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Vmn1r1-202ENSMUST00000227586 3766 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Olfr424-202ENSMUST00000214751 1642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm45644-201ENSMUST00000210255 2740 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 6430511E19Rik-201ENSMUST00000192772 3835 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Eya4-201ENSMUST00000074366 3488 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm7206-201ENSMUST00000117730 508 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm12985-201ENSMUST00000118376 183 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm5754-201ENSMUST00000118774 892 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 H3f3c-201ENSMUST00000119459 411 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm12685-201ENSMUST00000121702 214 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm12162-201ENSMUST00000123422 154 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 4933416E14Rik-201ENSMUST00000130841 491 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Bloc1s1-202ENSMUST00000131271 475 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Grip1os1-202ENSMUST00000135940 1192 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm25389-201ENSMUST00000157340 286 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 5330439A09Rik-201ENSMUST00000162770 1117 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm27543-201ENSMUST00000183562 177 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm18350-201ENSMUST00000187395 955 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 2310043L19Rik-201ENSMUST00000189507 698 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm19029-201ENSMUST00000189923 564 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm34716-201ENSMUST00000194060 621 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm30353-202ENSMUST00000195486 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm9173-201ENSMUST00000198054 400 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm43315-201ENSMUST00000198120 313 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm2011-203ENSMUST00000203750 435 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Olfr588-ps1-202ENSMUST00000210115 912 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm18850-201ENSMUST00000211578 388 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm45910-201ENSMUST00000212493 1003 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Spata19-202ENSMUST00000214158 627 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Olfr931-ps1-201ENSMUST00000214941 549 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 AC153961.2-201ENSMUST00000218877 164 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 AC158633.1-201ENSMUST00000219892 649 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm2099-201ENSMUST00000220979 412 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 AC153153.2-201ENSMUST00000223572 411 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 CU024892.1-201ENSMUST00000224869 515 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 1700129C05Rik-201ENSMUST00000022548 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms