Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Ranbp2-ps2-201ENSMUST00000184379 370 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm18700-201ENSMUST00000185791 553 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm28595-201ENSMUST00000186223 437 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm44265-201ENSMUST00000203631 465 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Lair1-209ENSMUST00000205296 412 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Klk1b23-ps-201ENSMUST00000206347 345 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm44787-202ENSMUST00000208339 1069 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 5430437J10Rik-201ENSMUST00000211750 1234 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 AC110381.1-201ENSMUST00000218987 586 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 AC116589.1-201ENSMUST00000220634 327 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 AC116589.3-202ENSMUST00000221770 649 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 AC116589.6-201ENSMUST00000222252 649 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 AC123917.1-201ENSMUST00000228063 1048 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Glod5-201ENSMUST00000033503 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Sprr2a3-201ENSMUST00000090872 682 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Olfr111-201ENSMUST00000097325 1041 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r104-201ENSMUST00000168050 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rabgef1Q9JM13 Gm10280-201ENSMUST00000212238 2006 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Clk4-202ENSMUST00000109111 1427 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Tmem156-204ENSMUST00000212080 1411 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm32568-201ENSMUST00000212782 1421 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm18878-201ENSMUST00000223071 1443 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Olfr947-ps1-203ENSMUST00000215471 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Tgif1-211ENSMUST00000186358 1455 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Olfr972-203ENSMUST00000216167 1522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Olfr430-203ENSMUST00000214390 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm10033-204ENSMUST00000213012 7778 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Olfr364-ps1-201ENSMUST00000104995 1766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 A330076H08Rik-202ENSMUST00000207694 1836 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Pias1-201ENSMUST00000098651 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm30655-202ENSMUST00000222732 2808 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm15475-201ENSMUST00000137673 3757 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm2309-201ENSMUST00000149994 1941 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm42892-201ENSMUST00000196227 3973 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm45520-201ENSMUST00000210109 2031 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Olfr690-202ENSMUST00000211006 2048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Olfr259-203ENSMUST00000215828 4095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Olfr1494-202ENSMUST00000207836 2100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Naip2-203ENSMUST00000167986 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm26742-201ENSMUST00000181829 3340 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Clca3b-201ENSMUST00000159989 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r213-203ENSMUST00000228031 3367 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Fanci-201ENSMUST00000036865 4645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 4930555F03Rik-202ENSMUST00000126285 3604 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Igkv4-90-201ENSMUST00000103334 352 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Crisp4-202ENSMUST00000115340 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm8534-201ENSMUST00000118553 766 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm16100-201ENSMUST00000120489 231 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm16016-201ENSMUST00000120831 550 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm4886-201ENSMUST00000121874 1176 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm13237-201ENSMUST00000122151 635 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm12778-201ENSMUST00000122341 333 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Rpl39-ps-201ENSMUST00000142604 355 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 4933407I08Rik-201ENSMUST00000151215 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm22076-201ENSMUST00000158601 84 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm19203-201ENSMUST00000174049 939 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Tnfsf10-202ENSMUST00000174840 989 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm11168-201ENSMUST00000177722 684 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm23568-201ENSMUST00000177960 92 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 9330182O14Rik-201ENSMUST00000179120 423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm24829-201ENSMUST00000179245 92 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm10719-203ENSMUST00000179272 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm21729-201ENSMUST00000180058 664 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm21853-201ENSMUST00000180071 664 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm27602-201ENSMUST00000183861 111 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Mir6911-201ENSMUST00000184241 69 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm28628-201ENSMUST00000187006 264 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm29495-201ENSMUST00000189319 664 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm8403-201ENSMUST00000189712 1298 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm29341-201ENSMUST00000190179 370 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Ighv1-14-201ENSMUST00000194015 402 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm33973-201ENSMUST00000195148 534 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm18971-201ENSMUST00000197240 374 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm43035-201ENSMUST00000197626 517 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm42543-201ENSMUST00000198756 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm43675-201ENSMUST00000199468 1184 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm44411-201ENSMUST00000204172 349 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm33501-202ENSMUST00000209983 706 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm33586-201ENSMUST00000210768 892 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm30676-202ENSMUST00000214464 793 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 AC134528.1-201ENSMUST00000219156 387 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 1700030L22Rik-202ENSMUST00000222223 704 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm18620-201ENSMUST00000222295 324 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 AC131747.1-201ENSMUST00000226159 793 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 AC164436.1-201ENSMUST00000227074 772 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 AC168062.1-201ENSMUST00000228048 769 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r70-201ENSMUST00000055847 897 ntAPPRIS P2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm14851-201ENSMUST00000077452 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 1700084J12Rik-201ENSMUST00000079057 734 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 n-R5s217-201ENSMUST00000083341 116 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Olfr1254-201ENSMUST00000099764 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Fmn1-202ENSMUST00000099576 11817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Zfp933-201ENSMUST00000105718 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm45262-201ENSMUST00000209917 1463 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm5157-201ENSMUST00000185914 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Olfr508-201ENSMUST00000072914 1635 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Nebl-213ENSMUST00000177966 1690 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm15228-201ENSMUST00000142044 3440 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm43190-201ENSMUST00000187850 1779 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88 ms