Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Gm28201-201ENSMUST00000189989 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Gm29446-201ENSMUST00000190887 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Olfr539-202ENSMUST00000218865 11486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Gm10855-201ENSMUST00000100426 2541 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Gm17203-201ENSMUST00000164379 4017 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Csnk1g1-213ENSMUST00000206528 1740 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Gm14403-201ENSMUST00000108940 774 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Gm14711-201ENSMUST00000117056 217 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Gm11372-201ENSMUST00000117348 570 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Gm12230-201ENSMUST00000118301 454 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Serpinb1-ps1-201ENSMUST00000118548 586 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Gm12890-201ENSMUST00000120885 373 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Vmn1r-ps116-201ENSMUST00000121544 292 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Runx2os3-201ENSMUST00000160203 738 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Gm15689-201ENSMUST00000160604 1159 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Trbv10-201ENSMUST00000168322 289 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Gm22548-201ENSMUST00000174899 78 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Ranbp2-ps7-201ENSMUST00000183924 384 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Ranbp2-ps9-201ENSMUST00000184566 382 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Gm29082-201ENSMUST00000185207 448 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Gm29060-201ENSMUST00000185339 457 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Gm28887-201ENSMUST00000186065 294 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Gm28664-201ENSMUST00000186118 457 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Gm29296-201ENSMUST00000188146 320 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Gm29209-201ENSMUST00000188176 457 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Gm29090-201ENSMUST00000188526 457 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Gm29587-201ENSMUST00000189898 332 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Gm3351-201ENSMUST00000193454 505 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Trbv8-201ENSMUST00000194020 285 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Gm43729-201ENSMUST00000196949 499 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Gm43501-201ENSMUST00000202513 107 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Gm44149-201ENSMUST00000204256 226 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Gm44770-201ENSMUST00000205395 1264 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Fxyd1-207ENSMUST00000205778 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Gm45171-201ENSMUST00000206360 736 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 AC101677.1-201ENSMUST00000218590 158 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 4921501I09Rik-201ENSMUST00000220337 384 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Olfr267-201ENSMUST00000059608 944 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Olfr561-201ENSMUST00000098217 1071 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Gm16204-201ENSMUST00000117864 1897 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Olfr1239-203ENSMUST00000217181 1516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Gm42885-201ENSMUST00000200763 4214 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Olfr1155-203ENSMUST00000215903 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Dlg1-206ENSMUST00000115205 4364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Gm43176-201ENSMUST00000199653 2989 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Lrrtm4-206ENSMUST00000136421 4435 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Crispld1-202ENSMUST00000159958 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Gm10184-201ENSMUST00000086423 1939 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Hnrnpc-207ENSMUST00000227536 1301 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Psd4-202ENSMUST00000102942 11265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Ctnna2-206ENSMUST00000162273 3277 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Gm14643-201ENSMUST00000144412 1848 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Ect2l-201ENSMUST00000095817 2900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Maml2-201ENSMUST00000034401 2098 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Pkn2-206ENSMUST00000173830 2808 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Tgfbr1-203ENSMUST00000107725 1713 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Cdhr3-201ENSMUST00000095774 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Impg2-204ENSMUST00000160116 3992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Slc22a26-202ENSMUST00000120522 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Ifi207-202ENSMUST00000127730 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Fcrl5-203ENSMUST00000178261 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Gm36099-201ENSMUST00000221946 1798 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Fcrl5-201ENSMUST00000049926 1791 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Asxl2-201ENSMUST00000092003 11934 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Gm24935-201ENSMUST00000103770 110 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Gm26079-201ENSMUST00000104066 133 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Gm26289-201ENSMUST00000104169 131 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 n-R5s16-201ENSMUST00000104555 119 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Sub1-202ENSMUST00000110504 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Gm13137-201ENSMUST00000118035 345 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Gm13379-201ENSMUST00000118053 621 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Gm14159-201ENSMUST00000119832 451 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Gm12229-201ENSMUST00000120487 468 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Olfr408-ps1-201ENSMUST00000121710 941 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Gm15096-201ENSMUST00000121918 878 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 AA645442-201ENSMUST00000156020 285 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Gm24847-201ENSMUST00000158032 108 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Gm23583-201ENSMUST00000158533 289 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Gm27030-201ENSMUST00000182551 464 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Gm18700-201ENSMUST00000185791 553 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Gm3605-201ENSMUST00000185858 440 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Gm37493-201ENSMUST00000193167 433 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Gm38084-201ENSMUST00000193488 437 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Gm20926-201ENSMUST00000194457 696 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Gm37865-201ENSMUST00000194996 437 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Gm43116-201ENSMUST00000199789 195 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Ghrl-202ENSMUST00000203363 400 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Gm20751-201ENSMUST00000210260 1270 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Gm2829-201ENSMUST00000213121 499 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 AC154296.2-201ENSMUST00000214696 545 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Gm18903-201ENSMUST00000215343 480 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 4930529N20Rik-201ENSMUST00000220538 639 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 9130015A21Rik-201ENSMUST00000221491 651 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 AC168062.1-201ENSMUST00000228048 769 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Olfr715b-201ENSMUST00000081044 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Gm26176-201ENSMUST00000083795 105 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Smg9Q9DB90 Thnsl1-203ENSMUST00000102952 1679 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms