Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Gm45485-201ENSMUST00000211229 357 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Gm7607-201ENSMUST00000214920 518 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 AC123830.1-201ENSMUST00000217156 609 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Olfr1133-202ENSMUST00000217368 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 3110043J17Rik-201ENSMUST00000219153 760 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 AC122301.1-201ENSMUST00000219625 507 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 AC168056.2-201ENSMUST00000223591 269 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Klra7-203ENSMUST00000088011 921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Olfr1217-201ENSMUST00000099799 1105 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Gm43024-201ENSMUST00000196770 4352 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Inpp4b-209ENSMUST00000172031 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Ccna2-205ENSMUST00000196316 2001 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Ints12-201ENSMUST00000029650 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 D7Ertd443e-202ENSMUST00000106129 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Olfr843-203ENSMUST00000214267 7071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Smarca2-220ENSMUST00000207054 2333 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Aspn-201ENSMUST00000021820 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Gm37677-201ENSMUST00000194520 7634 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Btf3l4-204ENSMUST00000102742 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Glcci1-206ENSMUST00000162567 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Zscan4-ps3-201ENSMUST00000210559 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Ear-ps2-201ENSMUST00000100689 466 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Casp8ap2-202ENSMUST00000108178 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 BC117090-201ENSMUST00000114850 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Rpl38-ps2-201ENSMUST00000117356 213 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Gm8129-201ENSMUST00000118230 213 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Atp5l2-ps-201ENSMUST00000120130 312 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Gm22959-201ENSMUST00000122514 303 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 1700071M16Rik-201ENSMUST00000164150 537 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Pfdn5-208ENSMUST00000170627 330 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Rps11-ps1-201ENSMUST00000171632 475 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Gm18343-201ENSMUST00000172802 604 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Gm27636-201ENSMUST00000184528 122 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Gm29277-201ENSMUST00000185226 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Gm29089-201ENSMUST00000186209 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Gm37203-201ENSMUST00000191618 385 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Gm43973-201ENSMUST00000203562 210 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Gm34096-201ENSMUST00000211296 530 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Olfr852-ps1-201ENSMUST00000212273 226 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Gm39336-201ENSMUST00000214933 260 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 AC123944.2-201ENSMUST00000215290 382 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 AC154264.1-201ENSMUST00000216064 386 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 AC132324.1-201ENSMUST00000221855 584 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 AC159293.2-201ENSMUST00000222289 424 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Olfr16-201ENSMUST00000038432 1050 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Rnase2a-201ENSMUST00000061936 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Olfr664-201ENSMUST00000072887 966 ntAPPRIS P5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Snora44-201ENSMUST00000082670 129 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Gm23511-201ENSMUST00000083084 164 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Gm10221-201ENSMUST00000088299 309 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Gm23058-201ENSMUST00000093703 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 2700062C07Rik-201ENSMUST00000097646 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Vmn1r184-206ENSMUST00000228145 5888 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Slc22a27-201ENSMUST00000075619 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Gm2366-201ENSMUST00000180753 3982 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Gm37890-201ENSMUST00000195610 3992 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Rfc1-202ENSMUST00000203471 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Usp26-201ENSMUST00000069509 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Gm37686-201ENSMUST00000194099 2309 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Rif1-201ENSMUST00000112693 8509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Mdga2-211ENSMUST00000222623 1449 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Tnfrsf26-201ENSMUST00000055723 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 B230206I08Rik-201ENSMUST00000207479 3191 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Olfr767-202ENSMUST00000213579 5493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Olfr1252-203ENSMUST00000216203 3243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Mndal-204ENSMUST00000188804 2026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 A430027C01Rik-201ENSMUST00000194599 1644 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Hspa13-201ENSMUST00000046283 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Olfr344-202ENSMUST00000215879 7675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Trim12c-201ENSMUST00000059037 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Zfp738-203ENSMUST00000137496 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Lrp1b-208ENSMUST00000167270 10071 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 R3hdm1-201ENSMUST00000036288 4795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Btbd35f7-201ENSMUST00000105007 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Olfr357-202ENSMUST00000213218 5367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Igkv16-104-201ENSMUST00000103323 378 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Gm23746-201ENSMUST00000104229 125 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Rpl36a-201ENSMUST00000113211 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Csn1s2b-203ENSMUST00000113279 745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Psmb6-ps-201ENSMUST00000117520 713 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Gm14560-201ENSMUST00000118672 375 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Olfr1069-ps1-201ENSMUST00000120755 965 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Mettl5os-201ENSMUST00000129114 667 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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Abcf3Q8K268 AI662270-201ENSMUST00000142709 304 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 4930547E08Rik-201ENSMUST00000143559 541 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Gm23224-201ENSMUST00000158122 271 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Gm17546-201ENSMUST00000168960 733 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Vmn1r139-202ENSMUST00000173668 753 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 1810026B05Rik-201ENSMUST00000183916 432 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 9530003O04Rik-201ENSMUST00000192663 908 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Gm8325-202ENSMUST00000193411 182 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Obox4-ps32-201ENSMUST00000196512 537 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Nts-201ENSMUST00000020040 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Gm43036-201ENSMUST00000200594 373 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Gm44074-201ENSMUST00000204562 337 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Gm19168-201ENSMUST00000218804 1091 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 Mrpl42-203ENSMUST00000218893 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Abcf3Q8K268 AC165092.2-201ENSMUST00000224681 368 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
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