Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Gm23692-201ENSMUST00000101881 160 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 Hspe1-ps5-201ENSMUST00000118080 297 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 Gm13007-201ENSMUST00000121866 365 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 Gm13077-201ENSMUST00000121941 484 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 4933416E14Rik-201ENSMUST00000130841 491 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 Gm13838-201ENSMUST00000132130 531 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 A630023P12Rik-204ENSMUST00000142879 524 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 4933430M04Rik-201ENSMUST00000152726 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 Gm25865-201ENSMUST00000158247 104 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 Gm26907-201ENSMUST00000181794 729 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 Gm27543-201ENSMUST00000183562 177 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 4930519F24Rik-201ENSMUST00000185764 579 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 Gm30097-201ENSMUST00000193581 447 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 Gm37676-201ENSMUST00000195496 507 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 BC037156-201ENSMUST00000196993 430 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 Gm7825-201ENSMUST00000204046 416 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 Gm45422-201ENSMUST00000211476 246 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 Gm45722-201ENSMUST00000213075 466 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 AC123064.1-201ENSMUST00000218950 406 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
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Pcsk9Q80W65 3110043J17Rik-201ENSMUST00000219153 760 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 AC102435.1-205ENSMUST00000221064 1097 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 AC170999.2-201ENSMUST00000226223 264 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 Cd226-202ENSMUST00000097496 911 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 Gm12633-201ENSMUST00000117742 1705 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 Gm37181-201ENSMUST00000192513 1727 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 Zfp932-202ENSMUST00000112536 2509 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
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Pcsk9Q80W65 Gm15337-201ENSMUST00000135378 3888 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 Olfr1357-202ENSMUST00000203305 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 Gm37890-201ENSMUST00000195610 3992 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 Vmn2r2-202ENSMUST00000177151 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 Smc5-206ENSMUST00000226111 3265 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 AC117769.3-201ENSMUST00000225814 1664 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 1700017N19Rik-201ENSMUST00000041162 1691 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 Zscan4b-201ENSMUST00000168158 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 Dach2-204ENSMUST00000113380 2894 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 Nlrp4a-201ENSMUST00000068767 4259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 Ints12-201ENSMUST00000029650 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 AA792892-201ENSMUST00000097477 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 Gm26300-201ENSMUST00000102282 94 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 Homer1-208ENSMUST00000109495 813 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 Olfr1083-ps-201ENSMUST00000117704 943 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 Gm13435-201ENSMUST00000120111 1023 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 Gm11255-201ENSMUST00000120448 1180 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 Gm11714-201ENSMUST00000136927 876 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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Pcsk9Q80W65 Gm37760-201ENSMUST00000194726 3841 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 Gm44603-201ENSMUST00000206820 367 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 Gm44893-201ENSMUST00000207259 443 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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Pcsk9Q80W65 AC124687.2-201ENSMUST00000221927 1228 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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Pcsk9Q80W65 Acsm3-203ENSMUST00000106527 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 Otc-202ENSMUST00000115528 2997 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 Olfr617-203ENSMUST00000216516 3083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 Bclaf1-201ENSMUST00000043881 5437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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Pcsk9Q80W65 Gm17791-201ENSMUST00000185660 1501 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 Olfr738-203ENSMUST00000214853 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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Pcsk9Q80W65 Kcnu1-201ENSMUST00000098858 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 Adgb-206ENSMUST00000208717 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 Olfr457-203ENSMUST00000204324 4275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 Spag5-201ENSMUST00000045026 3887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 Dsc1-201ENSMUST00000038710 3775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 Dpp10-202ENSMUST00000112606 15297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 Gm7416-201ENSMUST00000117448 1487 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 Hbb-bh2-201ENSMUST00000106866 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 Gm12807-201ENSMUST00000121546 962 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 Crem-206ENSMUST00000124747 973 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 4933416I08Rik-201ENSMUST00000125315 703 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 Hnf1aos2-201ENSMUST00000138108 442 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 Gm14223-201ENSMUST00000146060 517 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 A630095N17Rik-201ENSMUST00000179573 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 Gm18800-202ENSMUST00000188688 1105 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 Gm4322-201ENSMUST00000191094 336 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 Gm37631-201ENSMUST00000192275 364 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 Gm43408-201ENSMUST00000198263 440 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 Gm19065-202ENSMUST00000203910 1165 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 Gm44604-201ENSMUST00000205475 496 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 Scoc-209ENSMUST00000212905 798 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 Olfr151-202ENSMUST00000221099 929 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 Prl2c2-203ENSMUST00000221612 596 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 Pik3c2g-201ENSMUST00000032353 1206 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Pcsk9Q80W65 Olfr655-201ENSMUST00000057385 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms