Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 AC125484.1-201ENSMUST00000223218 234 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 4932414N04Rik-204ENSMUST00000128259 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Nlrp1a-201ENSMUST00000048514 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Gm37099-201ENSMUST00000191902 3451 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Nbas-201ENSMUST00000042953 7234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 A830010M20Rik-204ENSMUST00000112671 6756 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Gm26764-201ENSMUST00000181175 2596 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Gm14444-201ENSMUST00000109069 919 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Gm12186-201ENSMUST00000119050 945 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Gm5963-201ENSMUST00000143451 236 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Gm24751-201ENSMUST00000157844 102 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Gm28703-201ENSMUST00000185312 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 AC099934.5-201ENSMUST00000222699 945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 9430031K09Rik-201ENSMUST00000222913 925 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Fam183b-201ENSMUST00000060581 493 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Olfr739-201ENSMUST00000075261 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Gm5715-201ENSMUST00000196854 1465 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Vmn2r100-201ENSMUST00000166081 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Gm37254-201ENSMUST00000193542 3901 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 AC156569.1-201ENSMUST00000222020 3841 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Pbrm1-202ENSMUST00000022474 4843 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Gm5942-201ENSMUST00000120046 439 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 4930505K14Rik-201ENSMUST00000155504 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 4430402I18Rik-203ENSMUST00000160542 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Gm3259-205ENSMUST00000185432 1077 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Gm43020-201ENSMUST00000197178 372 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Olfr854-202ENSMUST00000212872 939 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Sprr3-201ENSMUST00000058142 1222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Olfr1494-202ENSMUST00000207836 2100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Gm5039-202ENSMUST00000218054 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Gm10436-201ENSMUST00000071580 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Olfr819-202ENSMUST00000216322 3930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Kynu-201ENSMUST00000028223 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Cenpj-201ENSMUST00000065302 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Kat6a-202ENSMUST00000110696 9041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Mir1193-201ENSMUST00000116761 121 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Gm14656-201ENSMUST00000120342 502 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Gm22940-201ENSMUST00000158560 155 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Gm9569-201ENSMUST00000187492 787 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Gm28181-201ENSMUST00000191460 687 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Gm9317-201ENSMUST00000197055 862 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Gm4574-201ENSMUST00000207804 542 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 AC160962.1-203ENSMUST00000225167 1105 ntAPPRIS P5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Olfr876-201ENSMUST00000086064 1048 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
NischQ80TM9 Gm14929-201ENSMUST00000152079 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NischQ80TM9 B930086L07Rik-201ENSMUST00000209529 3738 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
NischQ80TM9 Kcnma1-204ENSMUST00000112423 3664 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
NischQ80TM9 Arhgap15-201ENSMUST00000055776 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NischQ80TM9 Robo2-210ENSMUST00000226478 8059 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
NischQ80TM9 Gm37764-201ENSMUST00000194664 2150 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
NischQ80TM9 Evi5-201ENSMUST00000112642 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NischQ80TM9 A830008E24Rik-202ENSMUST00000190485 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NischQ80TM9 Dnah17-204ENSMUST00000132685 13612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
NischQ80TM9 Pcdh15-215ENSMUST00000131321 6926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NischQ80TM9 Ktn1-214ENSMUST00000188553 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
NischQ80TM9 Olfr31-202ENSMUST00000206009 4017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
NischQ80TM9 Gm14831-201ENSMUST00000120253 409 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
NischQ80TM9 Gm14410-202ENSMUST00000133301 1113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NischQ80TM9 Gm12214-201ENSMUST00000151643 417 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NischQ80TM9 Gm17152-201ENSMUST00000172430 535 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
NischQ80TM9 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
NischQ80TM9 Gm11007-201ENSMUST00000177700 195 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NischQ80TM9 Gm2007-201ENSMUST00000177981 195 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NischQ80TM9 Gm2004-203ENSMUST00000179349 195 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NischQ80TM9 AC164618.1-201ENSMUST00000225769 592 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
NischQ80TM9 AC183096.1-201ENSMUST00000226392 130 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
NischQ80TM9 Apcs-201ENSMUST00000027824 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NischQ80TM9 Olfr670-201ENSMUST00000050482 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NischQ80TM9 Gm12290-201ENSMUST00000145095 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NischQ80TM9 Klf7-202ENSMUST00000114086 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NischQ80TM9 Olfr965-203ENSMUST00000215164 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NischQ80TM9 Stk3-205ENSMUST00000226555 2730 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NischQ80TM9 Pax6os1-202ENSMUST00000149133 1464 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NischQ80TM9 Gm44250-201ENSMUST00000203092 4229 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
NischQ80TM9 AC187103.2-201ENSMUST00000223605 1617 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
NischQ80TM9 Ank3-240ENSMUST00000183169 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NischQ80TM9 Olfr731-204ENSMUST00000214388 5438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NischQ80TM9 Trbv20-201ENSMUST00000103277 335 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NischQ80TM9 Gm13172-201ENSMUST00000118685 256 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
NischQ80TM9 Fyttd1-202ENSMUST00000120345 648 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NischQ80TM9 Skint1-205ENSMUST00000162885 603 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NischQ80TM9 Gm17333-201ENSMUST00000169531 378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NischQ80TM9 Gm29478-201ENSMUST00000191272 688 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NischQ80TM9 Gm37492-201ENSMUST00000191948 376 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
NischQ80TM9 Gm21885-202ENSMUST00000208510 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NischQ80TM9 Gm45604-201ENSMUST00000209665 550 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NischQ80TM9 Olfr726-206ENSMUST00000217025 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NischQ80TM9 4930533N22Rik-202ENSMUST00000206684 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NischQ80TM9 Msr1-202ENSMUST00000170091 3636 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NischQ80TM9 A2ml1-201ENSMUST00000060574 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NischQ80TM9 Snhg14-214ENSMUST00000191191 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NischQ80TM9 F13a1-201ENSMUST00000037491 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NischQ80TM9 Gm43370-201ENSMUST00000196437 284 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
NischQ80TM9 Olfr489-ps1-201ENSMUST00000210404 967 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
NischQ80TM9 AC102435.1-201ENSMUST00000222199 908 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NischQ80TM9 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
NischQ80TM9 U90926-201ENSMUST00000031356 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NischQ80TM9 n-R5s168-201ENSMUST00000083948 104 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms