Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gm2892-201ENSMUST00000145537 711 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Gm23824-201ENSMUST00000158741 276 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Airn-203ENSMUST00000159791 485 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Magea9-ps-202ENSMUST00000167328 899 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Olfr758-ps1-201ENSMUST00000173901 841 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Gm27970-201ENSMUST00000184854 407 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Gm28783-201ENSMUST00000188872 359 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Gm38041-201ENSMUST00000194445 661 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Gm43276-201ENSMUST00000199712 364 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Gm44442-201ENSMUST00000204298 422 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Gm44604-201ENSMUST00000205475 496 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Gm44768-201ENSMUST00000205719 393 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Gm45226-201ENSMUST00000206602 288 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 AC134254.2-201ENSMUST00000221262 170 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 CT025667.1-201ENSMUST00000225872 382 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 AC116591.1-201ENSMUST00000227919 351 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 AC170810.1-201ENSMUST00000228267 672 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Defb2-201ENSMUST00000006745 305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Olfr781-202ENSMUST00000204108 1304 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Vmn1r228-201ENSMUST00000072410 1443 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Tenm4-203ENSMUST00000107166 13172 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Ncr1-201ENSMUST00000006792 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Gm43176-201ENSMUST00000199653 2989 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Gm9314-201ENSMUST00000199881 1528 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 D130004A15Rik-201ENSMUST00000201492 1577 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Olfr172-202ENSMUST00000214139 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Gm14643-201ENSMUST00000144412 1848 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Zfp433-201ENSMUST00000085664 1800 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Morc2b-202ENSMUST00000131954 3857 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Gm3286-202ENSMUST00000200932 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Vmn1r81-202ENSMUST00000227080 13256 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Orc3-202ENSMUST00000108142 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Gm30948-201ENSMUST00000195683 4827 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Gm4924-203ENSMUST00000210381 3330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Ear-ps2-201ENSMUST00000100689 466 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Traj16-201ENSMUST00000103725 61 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Gm24789-201ENSMUST00000104282 131 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Gm22019-201ENSMUST00000104359 96 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Gm6429-201ENSMUST00000117144 475 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Gm16423-201ENSMUST00000120078 947 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Gm11579-201ENSMUST00000145502 845 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Gm14093-201ENSMUST00000145579 364 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Vps50-203ENSMUST00000170873 3687 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Cd180-204ENSMUST00000171267 1787 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Gm9587-201ENSMUST00000172449 454 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Gm20612-201ENSMUST00000176318 236 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Obox4-ps14-201ENSMUST00000177198 1127 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Obox4-ps15-201ENSMUST00000178057 1140 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Obox4-ps19-201ENSMUST00000178284 1140 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Obox4-ps20-201ENSMUST00000179591 1140 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Obox4-ps21-201ENSMUST00000179856 1140 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 2310010J17Rik-201ENSMUST00000181189 490 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Gm27036-201ENSMUST00000182465 980 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Gm27409-201ENSMUST00000184727 80 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Gm3605-201ENSMUST00000185858 440 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Gm28740-201ENSMUST00000186142 215 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Gm18728-201ENSMUST00000186155 753 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Gm28881-201ENSMUST00000187710 470 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Gm21256-202ENSMUST00000188881 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Gm28891-202ENSMUST00000189333 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Gm21094-202ENSMUST00000189577 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Gm29198-201ENSMUST00000190102 1512 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Trbv22-201ENSMUST00000191697 291 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Gm19777-201ENSMUST00000191940 358 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Gm37340-201ENSMUST00000193124 759 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Gm37725-201ENSMUST00000193965 2125 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Igkv4-75-201ENSMUST00000197204 359 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Gm35013-201ENSMUST00000197218 832 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Gm2142-201ENSMUST00000197899 589 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Gm44224-201ENSMUST00000204131 1463 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Gm44277-201ENSMUST00000205128 649 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Gm45196-201ENSMUST00000206751 825 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Gm29791-201ENSMUST00000207144 380 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Gm17988-201ENSMUST00000208796 535 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Gm33601-201ENSMUST00000210001 961 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Gm19936-201ENSMUST00000216414 838 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Olfr228-202ENSMUST00000217292 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Ctsq-201ENSMUST00000021888 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Gm9321-201ENSMUST00000221179 778 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 AC117202.1-201ENSMUST00000227007 445 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 4930430A15Rik-201ENSMUST00000028577 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Hyal5-201ENSMUST00000031689 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Olfr794-201ENSMUST00000059957 963 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 F730035P03Rik-201ENSMUST00000065741 917 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Atf2-206ENSMUST00000112016 3943 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Usp48Q3V0C5 Il18r1-201ENSMUST00000087983 2826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Usp48Q3V0C5 Gm12043-201ENSMUST00000131570 2788 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Usp48Q3V0C5 Gm43719-201ENSMUST00000200088 2199 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp48Q3V0C5 Gm19272-201ENSMUST00000184133 1753 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp48Q3V0C5 Gm43921-201ENSMUST00000204296 1792 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp48Q3V0C5 Gm45117-201ENSMUST00000207250 1774 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp48Q3V0C5 Cdh9-202ENSMUST00000228307 3539 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp48Q3V0C5 Klkb1-201ENSMUST00000026907 5249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp48Q3V0C5 Gm24230-201ENSMUST00000104313 129 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp48Q3V0C5 Gm15016-201ENSMUST00000117300 720 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp48Q3V0C5 Gm2318-201ENSMUST00000119623 639 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp48Q3V0C5 Gm14322-202ENSMUST00000119838 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp48Q3V0C5 Gm15452-201ENSMUST00000119877 240 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp48Q3V0C5 Gm11481-201ENSMUST00000120069 255 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms