Protein–RNA interactions for Protein: Q3USL1

Klhdc9, Kelch domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc9Q3USL1 Gm15061-201ENSMUST00000121076 1046 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Gm25861-201ENSMUST00000158251 109 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Aste1-207ENSMUST00000176940 1151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Gm5558-201ENSMUST00000178933 495 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Gm27016-201ENSMUST00000183294 715 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Gm28840-203ENSMUST00000187128 975 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Gm23925-202ENSMUST00000188429 132 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Olfr1228-201ENSMUST00000190757 1094 ntAPPRIS P2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Gm6051-201ENSMUST00000201529 352 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Gm4714-201ENSMUST00000203395 279 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Gm45722-201ENSMUST00000213075 466 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Olfr1077-ps1-201ENSMUST00000213225 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 CR974592.1-201ENSMUST00000220422 574 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 AC151902.1-201ENSMUST00000227800 375 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 AC131178.1-201ENSMUST00000228649 492 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Zfp287-201ENSMUST00000005399 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Olfr1467-201ENSMUST00000054687 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Desi2-202ENSMUST00000069568 1193 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Dnah12-202ENSMUST00000073309 611 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Naip3-201ENSMUST00000118082 4208 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 9830107B12Rik-201ENSMUST00000063481 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 P2ry12-202ENSMUST00000170388 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Tcerg1-201ENSMUST00000025375 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 5430401H09Rik-202ENSMUST00000218836 2620 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Gm30524-201ENSMUST00000204271 2300 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 Nfia-201ENSMUST00000052018 9249 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 Olfr1301-202ENSMUST00000207590 4820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 Gm43121-201ENSMUST00000199065 1305 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 Dnah5-201ENSMUST00000067048 15637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 Ubr4-212ENSMUST00000165860 15798 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 Gm42496-201ENSMUST00000197976 3241 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 Olfr62-203ENSMUST00000217013 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 Gm44171-201ENSMUST00000203701 2109 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 Cnga1-205ENSMUST00000201463 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 C130079G13Rik-201ENSMUST00000049476 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 Lingo2-210ENSMUST00000164772 3562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 Gm12717-201ENSMUST00000118427 983 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 4930448K20Rik-201ENSMUST00000120570 998 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 Olfr404-ps1-201ENSMUST00000121065 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 Gm6027-201ENSMUST00000121467 756 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 Gm22343-201ENSMUST00000122648 286 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 Gm10087-201ENSMUST00000167650 330 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 Gm21860-201ENSMUST00000177893 309 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 Gm21748-201ENSMUST00000179623 309 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 Gm18802-201ENSMUST00000186270 888 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 Gm28129-201ENSMUST00000186273 537 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 Gm43350-201ENSMUST00000196382 711 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 5430434I15Rik-201ENSMUST00000197658 1257 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 Gm18330-201ENSMUST00000199246 547 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 Gm18660-201ENSMUST00000199542 629 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 Gm42643-201ENSMUST00000200504 279 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 Gm17999-201ENSMUST00000211568 542 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 Gm32171-201ENSMUST00000217419 1043 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 RMST_1.1-205ENSMUST00000218060 997 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 AC139758.1-201ENSMUST00000226573 930 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 Vmn1r231-201ENSMUST00000061278 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 Mrgprb2-201ENSMUST00000052730 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 Brwd3-205ENSMUST00000150434 11619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 Zfp808-204ENSMUST00000221772 1379 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 Vmn1r200-204ENSMUST00000227326 5449 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 Gm6871-202ENSMUST00000110214 1638 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 Olfr685-202ENSMUST00000209409 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 Zfhx4-203ENSMUST00000175866 11287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 Gm44751-201ENSMUST00000208302 4387 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 Olfr518-202ENSMUST00000217803 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 Gm20362-201ENSMUST00000204808 2072 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 A830019L24Rik-202ENSMUST00000198056 3165 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 Trim30b-201ENSMUST00000106831 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 Vmn1r89-205ENSMUST00000227276 1417 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 Prrc2c-201ENSMUST00000028016 8815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 Mug-ps1-201ENSMUST00000186891 4386 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 Gm20707-201ENSMUST00000176201 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 Olfr1443-203ENSMUST00000215134 3995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 Olfr591-202ENSMUST00000216581 4802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 Gm23608-201ENSMUST00000104545 128 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 Gm12131-201ENSMUST00000117479 359 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 Gm15206-201ENSMUST00000119143 454 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 Gm15530-201ENSMUST00000122206 555 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 4930547E08Rik-201ENSMUST00000143559 541 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 Gm15445-201ENSMUST00000146700 603 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 Gm16019-201ENSMUST00000149538 261 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 Gm16114-201ENSMUST00000161930 300 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 Vmn2r-ps124-201ENSMUST00000176236 903 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 Gm37005-201ENSMUST00000193281 1164 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 Gm42912-201ENSMUST00000197195 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 Gm44402-201ENSMUST00000203677 238 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 Gm19096-201ENSMUST00000209705 766 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 Gm45702-201ENSMUST00000211856 644 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 Gm30676-201ENSMUST00000214000 1165 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 4930480M12Rik-201ENSMUST00000221084 550 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 Gm9472-201ENSMUST00000221625 526 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 Iapp-201ENSMUST00000041993 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 Snora30-201ENSMUST00000083325 130 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 Cenpj-201ENSMUST00000065302 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 Gm27008-201ENSMUST00000182400 1360 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Klhdc9Q3USL1 Olfr1279-203ENSMUST00000216697 3385 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms