Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Vmn1r80-206ENSMUST00000228028 6918 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm37099-201ENSMUST00000191902 3451 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Olfr1389-202ENSMUST00000216641 3707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Ankrd34c-201ENSMUST00000060700 5457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Pdc-202ENSMUST00000185698 3335 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Slc28a2-203ENSMUST00000110525 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm43654-201ENSMUST00000200664 3417 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Pde1a-204ENSMUST00000102653 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Btbd35f21-201ENSMUST00000105017 1943 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Btbd35f27-201ENSMUST00000178143 1943 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Btbd35f16-201ENSMUST00000185755 1949 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Kera-201ENSMUST00000105286 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Txndc8-201ENSMUST00000102897 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm9733-201ENSMUST00000108361 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Olfr1146-ps1-201ENSMUST00000117180 943 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm13451-201ENSMUST00000117649 592 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm8424-201ENSMUST00000117716 988 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm5401-201ENSMUST00000122444 365 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm12162-201ENSMUST00000123422 154 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 1700116B05Rik-201ENSMUST00000173461 414 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm20545-201ENSMUST00000174739 210 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm22254-201ENSMUST00000179186 110 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm29161-201ENSMUST00000188250 699 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm37610-201ENSMUST00000191867 620 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm10292-202ENSMUST00000193165 585 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm33206-201ENSMUST00000193544 454 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm44171-201ENSMUST00000203701 2109 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm6261-201ENSMUST00000204707 760 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Olfr494-201ENSMUST00000209743 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Olfr494-202ENSMUST00000210291 947 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 AC153800.1-201ENSMUST00000219212 365 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 AC134439.2-201ENSMUST00000221950 467 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 AC154623.1-201ENSMUST00000224348 805 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm25818-201ENSMUST00000083282 164 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Olfr1474-201ENSMUST00000096202 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Prrc2c-202ENSMUST00000182149 11289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Rgs7-207ENSMUST00000195324 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Vmn2r99-201ENSMUST00000176107 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm30524-201ENSMUST00000204271 2300 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Olfr1191-ps1-201ENSMUST00000120598 4677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 1700022I11Rik-201ENSMUST00000030163 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Btbd35f4-201ENSMUST00000105011 1491 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Npat-201ENSMUST00000035850 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm18853-201ENSMUST00000183629 3596 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Olfr901-202ENSMUST00000216502 2639 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Acsm3-205ENSMUST00000106529 3295 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm37226-201ENSMUST00000191644 3255 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Sptssb-201ENSMUST00000051239 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Zbtb38-212ENSMUST00000152594 7406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Olfr1087-202ENSMUST00000214141 3861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Msr1-202ENSMUST00000170091 3636 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm37400-201ENSMUST00000193148 3605 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm9611-201ENSMUST00000100698 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Trav15n-1-201ENSMUST00000103590 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gnrh1-201ENSMUST00000111095 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm6027-201ENSMUST00000121467 756 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm3633-202ENSMUST00000163102 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Trav15d-1-dv6d-1-202ENSMUST00000186370 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm29137-201ENSMUST00000190301 520 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm29007-201ENSMUST00000190633 679 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm37243-201ENSMUST00000193407 595 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 1700065J11Rik-201ENSMUST00000201560 424 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm45083-201ENSMUST00000205216 712 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 AC138284.2-201ENSMUST00000213982 567 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm40692-201ENSMUST00000220411 491 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm7822-201ENSMUST00000222433 581 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 AC163631.1-201ENSMUST00000225041 598 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Erich6b-201ENSMUST00000022579 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 AC113031.3-201ENSMUST00000226552 190 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 CT030238.1-201ENSMUST00000228393 442 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm5045-201ENSMUST00000027054 810 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Mir188-201ENSMUST00000083464 68 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Olfr640-201ENSMUST00000084799 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Fat1-203ENSMUST00000189017 14651 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Xrn1-209ENSMUST00000190665 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 AC115970.1-201ENSMUST00000218910 1758 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Flrt2-201ENSMUST00000057324 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Zfp644-201ENSMUST00000045466 5569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm33594-201ENSMUST00000209502 1333 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Dsc1-202ENSMUST00000224432 4085 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Fam135a-206ENSMUST00000187369 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Hmcn1-202ENSMUST00000137197 16554 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm26743-201ENSMUST00000180913 1726 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Vmn1r173-203ENSMUST00000227987 9233 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Ppm1k-201ENSMUST00000042766 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Epha3-201ENSMUST00000064405 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm22273-201ENSMUST00000104040 132 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm15012-201ENSMUST00000119176 106 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm14046-201ENSMUST00000119389 509 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm14175-201ENSMUST00000119835 241 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Olfr343-ps1-201ENSMUST00000121883 303 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm14582-201ENSMUST00000141697 1189 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 4930547E08Rik-201ENSMUST00000143559 541 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm14637-201ENSMUST00000156516 444 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Gm23250-201ENSMUST00000157444 267 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Pkp1P97350 Klrb1a-202ENSMUST00000171306 989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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