Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Gtf2h1-202ENSMUST00000107644 2187 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
LmnaP48678 Mipol1-203ENSMUST00000130447 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
LmnaP48678 Mipol1-208ENSMUST00000153137 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
LmnaP48678 AC162181.1-201ENSMUST00000221643 3728 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
LmnaP48678 Tsix-201ENSMUST00000152916 4306 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
LmnaP48678 Impg2-204ENSMUST00000160116 3992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
LmnaP48678 Gm3752-201ENSMUST00000164366 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
LmnaP48678 Gm37254-201ENSMUST00000193542 3901 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
LmnaP48678 Asap1-206ENSMUST00000175799 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
LmnaP48678 Gm9874-202ENSMUST00000194957 1464 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
LmnaP48678 AC116476.1-201ENSMUST00000226274 2318 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
LmnaP48678 Obox3-206ENSMUST00000174443 1979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
LmnaP48678 Olfr385-202ENSMUST00000215689 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
LmnaP48678 Klra1-201ENSMUST00000032288 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
LmnaP48678 Ino80d-201ENSMUST00000097718 13675 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
LmnaP48678 Zscan18-201ENSMUST00000046245 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
LmnaP48678 Gm37730-201ENSMUST00000192432 2211 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
LmnaP48678 Olfr1348-209ENSMUST00000213549 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
LmnaP48678 Slc22a6-201ENSMUST00000010250 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
LmnaP48678 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
LmnaP48678 E030032P16Rik-201ENSMUST00000198813 2931 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
LmnaP48678 Pde1c-207ENSMUST00000168944 2126 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
LmnaP48678 Zfp457-201ENSMUST00000049705 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
LmnaP48678 Slmap-204ENSMUST00000112330 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
LmnaP48678 AC124556.1-201ENSMUST00000218256 1319 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
LmnaP48678 Daw1-202ENSMUST00000065436 1349 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
LmnaP48678 1700024B05Rik-202ENSMUST00000168972 1573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
LmnaP48678 Olfr1480-204ENSMUST00000207987 1804 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
LmnaP48678 Igkv1-132-201ENSMUST00000103305 362 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
LmnaP48678 Gm14510-201ENSMUST00000116165 1092 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
LmnaP48678 Gm14050-201ENSMUST00000117052 346 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
LmnaP48678 Olfr1146-ps1-201ENSMUST00000117180 943 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
LmnaP48678 4930448K20Rik-201ENSMUST00000120570 998 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
LmnaP48678 Gm12880-201ENSMUST00000120652 494 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
LmnaP48678 Gm14362-201ENSMUST00000121679 273 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
LmnaP48678 Olfr1021-ps1-201ENSMUST00000121914 1042 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
LmnaP48678 Gm15096-201ENSMUST00000121918 878 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
LmnaP48678 Gm10913-201ENSMUST00000133732 463 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
LmnaP48678 Gm15254-201ENSMUST00000149567 273 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
LmnaP48678 Gm25395-201ENSMUST00000157343 272 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
LmnaP48678 Gm16290-201ENSMUST00000161175 474 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
LmnaP48678 Gm16027-201ENSMUST00000161618 758 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
LmnaP48678 Gm9071-201ENSMUST00000165915 474 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
LmnaP48678 Gm22242-201ENSMUST00000175224 118 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
LmnaP48678 Gm17660-202ENSMUST00000178967 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
LmnaP48678 Gm25942-201ENSMUST00000180080 110 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
LmnaP48678 Ranbp2-ps6-201ENSMUST00000183722 381 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
LmnaP48678 Gm28363-201ENSMUST00000186341 673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
LmnaP48678 Gm37556-201ENSMUST00000193877 468 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
LmnaP48678 Rps4x-ps-201ENSMUST00000199852 793 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
LmnaP48678 Gm44982-201ENSMUST00000208795 471 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
LmnaP48678 AC147240.1-201ENSMUST00000218767 431 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
LmnaP48678 Gm2436-201ENSMUST00000219562 774 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
LmnaP48678 Gm19154-201ENSMUST00000223330 940 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
LmnaP48678 AC124395.1-201ENSMUST00000225940 707 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
LmnaP48678 AC123061.2-201ENSMUST00000226234 802 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
LmnaP48678 Muc16-201ENSMUST00000034653 1035 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
LmnaP48678 Olfr835-201ENSMUST00000059315 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
LmnaP48678 Glipr1l1-201ENSMUST00000073617 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
LmnaP48678 Scimp-201ENSMUST00000074572 617 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
LmnaP48678 Gm15732-201ENSMUST00000079794 480 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
LmnaP48678 Gm16020-201ENSMUST00000084281 210 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
LmnaP48678 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
LmnaP48678 Teddm1b-201ENSMUST00000055314 2527 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
LmnaP48678 AC165273.1-201ENSMUST00000222780 2452 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
LmnaP48678 G6pc2-202ENSMUST00000112317 1749 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
LmnaP48678 Gm12021-201ENSMUST00000121061 1746 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
LmnaP48678 Gm38168-201ENSMUST00000191717 1493 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
LmnaP48678 Gm37572-202ENSMUST00000194043 1493 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
LmnaP48678 Olfr488-202ENSMUST00000211508 4624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
LmnaP48678 Olfr488-203ENSMUST00000215173 4605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
LmnaP48678 Cenpw-202ENSMUST00000216853 4143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
LmnaP48678 Gm36660-201ENSMUST00000218323 3871 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
LmnaP48678 Cyp2b23-201ENSMUST00000077356 2189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
LmnaP48678 Gm14418-201ENSMUST00000108955 1415 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Irgm2-203ENSMUST00000209079 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Zfp760-201ENSMUST00000073312 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Olfr1226-205ENSMUST00000216445 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Vmn1r90-208ENSMUST00000227788 7018 ntAPPRIS P2 BASIC7.09□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Olfr691-202ENSMUST00000213290 2327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Gm26655-203ENSMUST00000181095 2078 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
LmnaP48678 4933406F09Rik-204ENSMUST00000181409 2078 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Gm26680-203ENSMUST00000181701 2078 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Gm26630-204ENSMUST00000181759 2078 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Gm26650-204ENSMUST00000181881 2078 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
LmnaP48678 AC174797.3-203ENSMUST00000225749 2078 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Ctsq-201ENSMUST00000021888 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Elmod2-201ENSMUST00000053902 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Orc2-202ENSMUST00000114325 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Cep192-201ENSMUST00000025425 8093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Gm14912-201ENSMUST00000120166 1773 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Bbs12-201ENSMUST00000057975 2433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Dock7-214ENSMUST00000205650 6297 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Trdv2-2-201ENSMUST00000103678 397 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Magea6-202ENSMUST00000112562 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Slc35a5-202ENSMUST00000114600 679 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Gm15901-201ENSMUST00000117663 941 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Gm11501-201ENSMUST00000118039 581 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Gm12937-201ENSMUST00000118333 448 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Gm13503-201ENSMUST00000119017 446 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.8 ms