Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm11516-201ENSMUST00000118450 1582 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
VdrP48281 9930038B18Rik-201ENSMUST00000151816 3966 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
VdrP48281 4930544L04Rik-202ENSMUST00000211181 3204 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
VdrP48281 AC022775.1-201ENSMUST00000228163 2698 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
VdrP48281 Alcam-203ENSMUST00000164728 1885 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
VdrP48281 Stra6l-202ENSMUST00000107782 4009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
VdrP48281 Vmn2r-ps139-201ENSMUST00000190764 2057 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
VdrP48281 B530045E10Rik-202ENSMUST00000189035 3138 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
VdrP48281 Gm17094-201ENSMUST00000169881 3334 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
VdrP48281 Zgrf1-203ENSMUST00000196141 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
VdrP48281 Heph-203ENSMUST00000113838 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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VdrP48281 Homer1-209ENSMUST00000109496 772 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
VdrP48281 Gm25507-201ENSMUST00000116981 144 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
VdrP48281 Gm13614-201ENSMUST00000117306 503 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
VdrP48281 Gm15951-201ENSMUST00000118377 400 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
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VdrP48281 Gm14517-201ENSMUST00000119040 337 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
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VdrP48281 Gm12827-201ENSMUST00000132690 660 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
VdrP48281 Gm15527-202ENSMUST00000144094 770 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
VdrP48281 E130111B04Rik-201ENSMUST00000156781 450 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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VdrP48281 Gm26381-201ENSMUST00000174895 92 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
VdrP48281 Mir5101-201ENSMUST00000175181 83 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
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VdrP48281 Gm17786-201ENSMUST00000182000 427 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
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VdrP48281 Sprr2g-202ENSMUST00000189634 651 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
VdrP48281 Smpx-208ENSMUST00000190091 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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VdrP48281 Gm7270-201ENSMUST00000195818 1128 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
VdrP48281 Gm43436-201ENSMUST00000199308 147 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
VdrP48281 Igkv4-77-201ENSMUST00000199410 352 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
VdrP48281 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
VdrP48281 A530021J07Rik-203ENSMUST00000208111 308 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
VdrP48281 Gm45868-201ENSMUST00000210247 473 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
VdrP48281 5430437J10Rik-201ENSMUST00000211750 1234 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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VdrP48281 Gm3678-201ENSMUST00000218888 492 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
VdrP48281 AC155941.1-201ENSMUST00000220223 529 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
VdrP48281 Gm36501-201ENSMUST00000221857 745 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
VdrP48281 AC132239.1-201ENSMUST00000223157 773 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
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VdrP48281 Sprr2g-201ENSMUST00000056590 650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
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VdrP48281 Sval3-201ENSMUST00000080742 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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VdrP48281 n-R5s89-201ENSMUST00000083532 104 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
VdrP48281 Scgb2b27-201ENSMUST00000085620 512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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VdrP48281 Gm27008-201ENSMUST00000182400 1360 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
VdrP48281 2900079G21Rik-204ENSMUST00000163302 2764 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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VdrP48281 Gm12535-201ENSMUST00000121025 484 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
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VdrP48281 Gm11216-201ENSMUST00000125240 354 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
VdrP48281 Gm16274-201ENSMUST00000139251 592 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VdrP48281 C230035I16Rik-201ENSMUST00000141543 623 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
VdrP48281 Nudt7-205ENSMUST00000147605 966 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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VdrP48281 Gm24781-201ENSMUST00000157636 117 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VdrP48281 Mir1930-201ENSMUST00000158799 84 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
VdrP48281 Gm765-201ENSMUST00000164491 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
VdrP48281 Zfp426-208ENSMUST00000166005 1653 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
VdrP48281 4933416M07Rik-201ENSMUST00000181424 624 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
VdrP48281 Gm28993-201ENSMUST00000186236 1499 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
VdrP48281 Tgif1-211ENSMUST00000186358 1455 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
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