Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 AC129935.1-201ENSMUST00000226302 873 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RxraP28700 Vmn1r80-201ENSMUST00000075053 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RxraP28700 Snord59a-201ENSMUST00000082844 74 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RxraP28700 Mir298-201ENSMUST00000083476 82 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RxraP28700 Tmem45a2-201ENSMUST00000067173 3073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RxraP28700 Nlrp5-203ENSMUST00000108441 3375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm14139-202ENSMUST00000109929 1485 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RxraP28700 Vmn1r173-203ENSMUST00000227987 9233 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RxraP28700 Lrrc4c-202ENSMUST00000135431 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RxraP28700 Malrd1-201ENSMUST00000146205 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RxraP28700 Med13-201ENSMUST00000043624 10546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm37226-201ENSMUST00000191644 3255 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RxraP28700 Piga-201ENSMUST00000033754 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RxraP28700 Pkhd1-201ENSMUST00000088448 12935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RxraP28700 AC154573.1-201ENSMUST00000225913 4659 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RxraP28700 Cyp2c50-201ENSMUST00000068094 1643 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RxraP28700 Olfr183-204ENSMUST00000214831 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm19301-201ENSMUST00000174283 2210 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RxraP28700 Il12rb2-202ENSMUST00000117441 2600 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm42702-201ENSMUST00000199515 4217 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RxraP28700 Usp25-201ENSMUST00000023580 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RxraP28700 Herc2-202ENSMUST00000164095 15261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RxraP28700 Tubal3-201ENSMUST00000021639 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RxraP28700 1700019J19Rik-202ENSMUST00000213583 1856 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RxraP28700 Olfr1305-203ENSMUST00000213737 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm19125-201ENSMUST00000188408 1383 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm24265-201ENSMUST00000101833 141 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RxraP28700 Zfp965-201ENSMUST00000109002 957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RxraP28700 Defb30-202ENSMUST00000111207 989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm8475-201ENSMUST00000118211 526 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm12448-201ENSMUST00000118852 655 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm9085-201ENSMUST00000119994 1072 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm13162-201ENSMUST00000121481 454 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm15959-201ENSMUST00000121724 368 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm16347-201ENSMUST00000131707 622 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm15892-201ENSMUST00000152627 439 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm26372-201ENSMUST00000157831 236 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm22519-201ENSMUST00000158270 178 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm17164-201ENSMUST00000169013 506 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm22122-201ENSMUST00000175147 200 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm23806-201ENSMUST00000175157 109 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm24407-201ENSMUST00000177864 141 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm3428-201ENSMUST00000183450 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RxraP28700 Mir7222-201ENSMUST00000183740 75 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm28228-201ENSMUST00000186880 632 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm9541-201ENSMUST00000188409 502 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RxraP28700 1700052I22Rik-201ENSMUST00000190431 379 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm37203-201ENSMUST00000191618 385 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm8325-202ENSMUST00000193411 182 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm43516-201ENSMUST00000196891 322 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RxraP28700 AI506816-203ENSMUST00000198461 503 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RxraP28700 Rrh-208ENSMUST00000200079 1106 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm45075-201ENSMUST00000208426 649 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm45750-201ENSMUST00000211966 354 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RxraP28700 AC123067.1-201ENSMUST00000217711 462 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm4510-201ENSMUST00000218265 427 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RxraP28700 CR974592.1-201ENSMUST00000220422 574 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm5457-201ENSMUST00000022260 333 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RxraP28700 AC154808.1-201ENSMUST00000223156 730 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RxraP28700 AC161586.1-201ENSMUST00000223232 547 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RxraP28700 AC165347.1-201ENSMUST00000224089 1025 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RxraP28700 AC124408.2-201ENSMUST00000228168 645 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RxraP28700 1700034E13Rik-201ENSMUST00000091904 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RxraP28700 Olfr570-201ENSMUST00000098215 1045 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm10801-201ENSMUST00000099684 504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RxraP28700 Ccr5-202ENSMUST00000111442 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RxraP28700 9230019H11Rik-201ENSMUST00000095874 2801 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RxraP28700 Scn1a-204ENSMUST00000112371 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RxraP28700 Olfr2-206ENSMUST00000216375 5828 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RxraP28700 Rfx6-201ENSMUST00000050455 3088 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RxraP28700 Olfr1480-204ENSMUST00000207987 1804 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RxraP28700 Ezh1-201ENSMUST00000100417 3636 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RxraP28700 Vmn2r117-201ENSMUST00000171996 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm43831-201ENSMUST00000200461 2598 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RxraP28700 Ryr3-211ENSMUST00000208290 15468 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm37589-201ENSMUST00000193609 3994 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RxraP28700 Olfr992-202ENSMUST00000213749 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RxraP28700 AC158115.2-201ENSMUST00000221804 5563 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RxraP28700 4933430A20Rik-201ENSMUST00000210943 1558 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RxraP28700 Olfr1080-201ENSMUST00000213185 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RxraP28700 Serpina1f-203ENSMUST00000118101 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RxraP28700 Ceacam15-201ENSMUST00000108498 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm26078-201ENSMUST00000104067 128 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RxraP28700 Rnf148-201ENSMUST00000104979 1239 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RxraP28700 Atp5l2-ps-201ENSMUST00000120130 312 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm14908-201ENSMUST00000120930 1286 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm12978-201ENSMUST00000121250 522 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RxraP28700 Tex35-204ENSMUST00000121911 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RxraP28700 Ftx-201ENSMUST00000123841 673 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RxraP28700 4930519D14Rik-201ENSMUST00000151471 1137 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm15790-201ENSMUST00000161109 1251 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm24417-201ENSMUST00000178123 79 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm24653-201ENSMUST00000178541 79 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm25934-201ENSMUST00000178642 79 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm10251-201ENSMUST00000178788 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm26554-201ENSMUST00000180801 845 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RxraP28700 Rps12-ps24-201ENSMUST00000182321 381 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm28967-201ENSMUST00000187351 281 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm28191-201ENSMUST00000189112 211 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm37098-201ENSMUST00000192290 244 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
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