Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Gm28840-205ENSMUST00000189320 615 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm28692-202ENSMUST00000189645 621 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 1700031M16Rik-204ENSMUST00000189724 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm28835-203ENSMUST00000190062 615 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm28490-202ENSMUST00000190946 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm29503-201ENSMUST00000191044 930 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 1700031M16Rik-207ENSMUST00000191513 847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 4930447N08Rik-201ENSMUST00000196290 497 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm44281-201ENSMUST00000203090 166 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm45215-201ENSMUST00000206407 395 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm4587-201ENSMUST00000209135 637 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Ormdl2-202ENSMUST00000217685 666 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 CT030182.2-201ENSMUST00000223569 620 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 AC154806.4-201ENSMUST00000227406 439 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Vmn1r89-201ENSMUST00000053008 951 ntAPPRIS P2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Olfr1537-201ENSMUST00000073248 945 ntAPPRIS P2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm23927-201ENSMUST00000082466 215 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm25818-201ENSMUST00000083282 164 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm24763-201ENSMUST00000083688 190 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Rmi1-204ENSMUST00000225815 2447 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Olfr1209-202ENSMUST00000213136 5611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Macc1-202ENSMUST00000221866 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Serpina1f-203ENSMUST00000118101 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Serpinb9f-201ENSMUST00000075515 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Olfr843-203ENSMUST00000214267 7071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 AC117769.3-201ENSMUST00000225814 1664 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 9230109A22Rik-202ENSMUST00000228644 1853 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Zfp78-201ENSMUST00000086323 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm37509-201ENSMUST00000194867 3169 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm9923-201ENSMUST00000217785 1836 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Vmn1r6-203ENSMUST00000227131 8330 ntAPPRIS P2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Mtm1-213ENSMUST00000171933 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 1700001G01Rik-201ENSMUST00000125117 1562 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Lpp-202ENSMUST00000078988 15440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Chrm3-201ENSMUST00000063093 1770 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm7298-201ENSMUST00000204124 4657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Olfr390-202ENSMUST00000120081 3604 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm43121-201ENSMUST00000199065 1305 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Akr1c20-201ENSMUST00000078239 1317 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm13928-201ENSMUST00000120326 1732 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Olfr147-202ENSMUST00000214648 5356 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Kynu-201ENSMUST00000028223 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Iqch-203ENSMUST00000163624 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Zbtb38-212ENSMUST00000152594 7406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Mga-201ENSMUST00000046717 11982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Zscan4a-201ENSMUST00000210573 2279 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Plcz1-201ENSMUST00000032356 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Olfr178-202ENSMUST00000206523 2095 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm25758-201ENSMUST00000103987 129 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm7657-201ENSMUST00000118851 666 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Hbb-bh3-201ENSMUST00000118954 266 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm2199-201ENSMUST00000119065 874 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm6305-201ENSMUST00000121027 1012 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm26490-201ENSMUST00000157879 140 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm23897-201ENSMUST00000158110 158 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm5139-201ENSMUST00000175943 249 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Vmn1r10-201ENSMUST00000176073 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm21959-201ENSMUST00000178439 452 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm26731-201ENSMUST00000180683 543 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm27201-201ENSMUST00000183818 416 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm20940-201ENSMUST00000197308 360 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Igkv4-56-201ENSMUST00000198436 349 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm17984-201ENSMUST00000205286 859 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm44733-202ENSMUST00000209063 582 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm45615-201ENSMUST00000210417 656 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 AC166323.1-201ENSMUST00000217756 367 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 AC164576.1-201ENSMUST00000218783 693 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm3213-201ENSMUST00000219296 441 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 AC164629.3-201ENSMUST00000219325 611 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Orm3-201ENSMUST00000006687 773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm23459-201ENSMUST00000083259 131 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm17229-201ENSMUST00000097355 1138 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm16513-201ENSMUST00000101023 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm37607-201ENSMUST00000194925 2623 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Ankar-202ENSMUST00000211837 4543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Obox5-201ENSMUST00000098802 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm38243-201ENSMUST00000194737 1567 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Tnpo1-201ENSMUST00000109399 8445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 AC154227.1-201ENSMUST00000228809 2467 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Ccdc66-202ENSMUST00000223689 4262 ntAPPRIS P2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Olfr620-201ENSMUST00000052152 3157 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Ino80d-205ENSMUST00000165066 13529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Nlrp1b-203ENSMUST00000108515 4131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Olfr303-204ENSMUST00000215733 3914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm5662-201ENSMUST00000101168 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Olfr1026-203ENSMUST00000219615 1465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm4922-201ENSMUST00000055107 1950 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm12789-202ENSMUST00000106915 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm13195-201ENSMUST00000117229 261 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm14576-201ENSMUST00000118073 1111 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm15687-201ENSMUST00000141440 269 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm14637-201ENSMUST00000156516 444 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm24944-201ENSMUST00000158330 128 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Prl-201ENSMUST00000018061 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 AV026068-202ENSMUST00000185793 486 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm38180-201ENSMUST00000192381 395 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm34882-201ENSMUST00000193245 974 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm18864-201ENSMUST00000194518 1051 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PdgfraP26618 Gm37882-201ENSMUST00000195254 196 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
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