Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Cenpj-201ENSMUST00000065302 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
P20040 Gm37217-201ENSMUST00000194017 3521 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Cdh12-201ENSMUST00000075132 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 4933434E20Rik-201ENSMUST00000029551 3097 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Olfr1192-ps1-201ENSMUST00000120518 2738 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gabrg2-201ENSMUST00000070725 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Olfr365-202ENSMUST00000213969 5333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 AC159326.1-201ENSMUST00000219989 1302 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm43831-201ENSMUST00000200461 2598 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm11867-201ENSMUST00000133363 1909 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm11975-201ENSMUST00000118772 481 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm13532-201ENSMUST00000120373 240 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm14601-201ENSMUST00000120892 236 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm22804-201ENSMUST00000158052 101 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Mir1963-201ENSMUST00000158594 59 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gas5-209ENSMUST00000159663 346 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm17160-201ENSMUST00000170645 260 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm4134-201ENSMUST00000173244 563 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Vmn1r10-201ENSMUST00000176073 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Pafah1b1-ps1-201ENSMUST00000181263 1046 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm27153-201ENSMUST00000184492 407 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm21842-202ENSMUST00000185311 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm29285-201ENSMUST00000185500 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm21801-202ENSMUST00000185537 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm28312-201ENSMUST00000185976 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm29213-201ENSMUST00000186199 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm21428-201ENSMUST00000186550 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm29370-201ENSMUST00000186581 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm28604-201ENSMUST00000186629 484 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm21633-202ENSMUST00000186630 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm28890-201ENSMUST00000186686 173 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm28092-201ENSMUST00000186709 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm28566-201ENSMUST00000186714 484 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm21572-202ENSMUST00000186850 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm21916-202ENSMUST00000187044 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm29839-201ENSMUST00000187045 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm28442-201ENSMUST00000187052 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm21780-202ENSMUST00000187110 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm29656-201ENSMUST00000187236 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm21821-202ENSMUST00000187288 175 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm28886-201ENSMUST00000187350 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm21599-202ENSMUST00000187381 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm28128-201ENSMUST00000187403 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm21450-201ENSMUST00000187408 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm28194-201ENSMUST00000187412 484 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm28689-201ENSMUST00000187441 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm28851-201ENSMUST00000187800 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm28886-202ENSMUST00000187889 484 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm28554-201ENSMUST00000187964 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm28984-201ENSMUST00000188202 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm21529-202ENSMUST00000188473 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm28604-202ENSMUST00000188638 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm21588-202ENSMUST00000188721 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm21539-202ENSMUST00000188764 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm28216-201ENSMUST00000188785 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm29645-201ENSMUST00000189117 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm28554-202ENSMUST00000189175 484 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm21413-201ENSMUST00000189224 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm21723-202ENSMUST00000189444 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm36782-201ENSMUST00000189459 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm21419-201ENSMUST00000189495 173 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm28566-202ENSMUST00000189532 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm29213-202ENSMUST00000189703 484 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm21626-202ENSMUST00000189751 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm28851-202ENSMUST00000189757 484 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm28656-201ENSMUST00000190017 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm28461-201ENSMUST00000190023 484 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm21562-202ENSMUST00000190314 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm28517-201ENSMUST00000190343 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm8480-201ENSMUST00000190350 698 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm29531-201ENSMUST00000190569 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm21914-202ENSMUST00000190577 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm20978-201ENSMUST00000190688 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm20963-201ENSMUST00000190880 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm29316-201ENSMUST00000190953 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm29351-201ENSMUST00000191052 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm29466-201ENSMUST00000191077 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm20987-201ENSMUST00000191165 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm28194-202ENSMUST00000191217 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm28461-202ENSMUST00000191406 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm37927-201ENSMUST00000192238 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm37544-201ENSMUST00000192803 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm37635-201ENSMUST00000193129 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm21809-202ENSMUST00000194072 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm45721-201ENSMUST00000212267 607 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 AC138284.5-201ENSMUST00000214389 652 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 AC160863.2-201ENSMUST00000218392 858 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 AC153937.2-201ENSMUST00000218485 632 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 CT010575.2-201ENSMUST00000222876 496 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 AC102291.1-201ENSMUST00000227164 529 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 AC154846.2-201ENSMUST00000228805 424 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Prl3b1-201ENSMUST00000035273 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Rpl21-ps13-201ENSMUST00000072532 483 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Olfr459-203ENSMUST00000214976 3770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Acer3-201ENSMUST00000033020 11340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Olfr1457-203ENSMUST00000214561 1829 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Zfp934-203ENSMUST00000220648 2439 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Gm42548-201ENSMUST00000202669 3933 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
P20040 Olfr716-206ENSMUST00000215284 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.4 ms