Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gm22419-201ENSMUST00000178780 121 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm24802-201ENSMUST00000178897 121 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm25208-201ENSMUST00000178964 121 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm24567-201ENSMUST00000179294 121 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm23943-201ENSMUST00000179712 121 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm25228-201ENSMUST00000180121 121 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm23304-201ENSMUST00000180209 121 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm4707-202ENSMUST00000183937 276 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm28097-201ENSMUST00000187333 366 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm5066-201ENSMUST00000188479 822 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm29011-201ENSMUST00000191059 712 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm29736-201ENSMUST00000198189 385 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm4501-201ENSMUST00000207330 551 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm4558-201ENSMUST00000207886 521 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm45883-201ENSMUST00000210131 853 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm45246-201ENSMUST00000210820 367 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Zfand4-204ENSMUST00000221069 501 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm7093-201ENSMUST00000223004 581 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 1700028P14Rik-201ENSMUST00000035849 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Olfr1152-201ENSMUST00000051058 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Olfr955-201ENSMUST00000073946 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Rps27a-ps2-201ENSMUST00000078766 467 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Olfr875-201ENSMUST00000080634 1004 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r27-201ENSMUST00000095862 912 ntAPPRIS P2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Rfx3-202ENSMUST00000165566 9146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Adgrg2-202ENSMUST00000112400 4682 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Hspd1-ps2-201ENSMUST00000210003 1697 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm42697-201ENSMUST00000198992 4092 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Xrn1-209ENSMUST00000190665 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Dnah6-201ENSMUST00000064948 12652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Pik3c2a-204ENSMUST00000206219 5670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Oprk1-204ENSMUST00000160777 4675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm44424-201ENSMUST00000203438 1826 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Lgi1-206ENSMUST00000198045 1483 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Pcdh9-202ENSMUST00000192221 5161 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Vav3-202ENSMUST00000106576 3123 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm37943-201ENSMUST00000194053 3944 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm43466-201ENSMUST00000197836 5214 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Olfr51-202ENSMUST00000213415 2819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 AI987944-202ENSMUST00000205338 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Maoa-201ENSMUST00000026013 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm11874-201ENSMUST00000117437 130 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm15738-201ENSMUST00000131985 275 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm22792-201ENSMUST00000157225 133 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm26486-201ENSMUST00000158021 110 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r158-201ENSMUST00000174643 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm20643-201ENSMUST00000177284 322 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm27209-201ENSMUST00000183834 898 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm9443-201ENSMUST00000188406 816 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm44077-201ENSMUST00000203453 435 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm1715-201ENSMUST00000213681 1018 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 AC102603.1-201ENSMUST00000227481 584 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 AC133910.1-201ENSMUST00000228128 624 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm7808-201ENSMUST00000082002 387 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm14399-201ENSMUST00000099029 192 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm2245-201ENSMUST00000160698 3376 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Prom1-216ENSMUST00000197750 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Ranbp17-201ENSMUST00000037522 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Ccdc7a-205ENSMUST00000214889 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Abi3bp-201ENSMUST00000048471 4687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Nfatc3-206ENSMUST00000212742 3207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 9330159M07Rik-201ENSMUST00000180712 2702 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm44901-201ENSMUST00000208157 3977 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Muc15-202ENSMUST00000111016 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Zbed4-ps1-201ENSMUST00000186734 3466 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Naip5-201ENSMUST00000049789 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm44735-201ENSMUST00000206197 1752 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Dpp10-202ENSMUST00000112606 15297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Macrod2-203ENSMUST00000110061 887 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm11914-201ENSMUST00000117094 507 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm23465-201ENSMUST00000157134 262 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm22311-201ENSMUST00000158006 110 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 0610040B10Rik-201ENSMUST00000160231 501 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 B230216N24Rik-204ENSMUST00000161661 719 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Ear-ps9-201ENSMUST00000161963 460 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r82-202ENSMUST00000191002 918 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm37381-202ENSMUST00000194643 657 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm42912-201ENSMUST00000197195 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm44690-201ENSMUST00000207984 382 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm6988-201ENSMUST00000222676 375 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r36-202ENSMUST00000226635 918 ntAPPRIS P2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Ctsj-201ENSMUST00000071526 1271 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm37936-201ENSMUST00000194647 1322 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Cnot4-201ENSMUST00000044163 3337 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Spef2-204ENSMUST00000160236 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r201-203ENSMUST00000226965 4741 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Cbll1-205ENSMUST00000188326 1399 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Hormad1-204ENSMUST00000171191 1437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Ndst3-203ENSMUST00000132112 4460 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gnrhr-203ENSMUST00000113372 2265 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Ube2n-201ENSMUST00000099329 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Olfr527-203ENSMUST00000214858 3362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Rpgrip1l-201ENSMUST00000047783 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm37400-201ENSMUST00000193148 3605 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 A730081D07Rik-201ENSMUST00000153685 1804 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 A730017C20Rik-205ENSMUST00000165666 1911 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Pus10-203ENSMUST00000109525 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r12-203ENSMUST00000227581 6490 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r209-203ENSMUST00000227265 6550 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.8 ms