Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Sptssb-201ENSMUST00000051239 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Clip3B9EHT4 1700017N19Rik-201ENSMUST00000041162 1691 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Clip3B9EHT4 Olfr532-203ENSMUST00000213801 4232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Clip3B9EHT4 Ppig-202ENSMUST00000090858 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Clip3B9EHT4 Gm44039-201ENSMUST00000204192 2246 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Clip3B9EHT4 AC154573.1-201ENSMUST00000225913 4659 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Clip3B9EHT4 Olfr947-ps1-201ENSMUST00000214075 2165 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Clip3B9EHT4 Vmn1r52-206ENSMUST00000228385 2769 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Clip3B9EHT4 Sspn-202ENSMUST00000111701 4512 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Clip3B9EHT4 AC151971.5-202ENSMUST00000215946 3188 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Clip3B9EHT4 Vmn2r117-201ENSMUST00000171996 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Clip3B9EHT4 Gm28928-201ENSMUST00000187286 1443 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Clip3B9EHT4 Gm29114-201ENSMUST00000187100 2508 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Clip3B9EHT4 Eps8-202ENSMUST00000100841 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Clip3B9EHT4 Nlrp1b-201ENSMUST00000094046 3525 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Clip3B9EHT4 Gm12388-201ENSMUST00000119112 1887 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Clip3B9EHT4 8430419K02Rik-201ENSMUST00000128654 1870 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Clip3B9EHT4 Kcnma1-202ENSMUST00000074983 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Clip3B9EHT4 Gm23739-201ENSMUST00000102295 108 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Clip3B9EHT4 Gm17146-201ENSMUST00000108464 372 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Clip3B9EHT4 Gm11146-201ENSMUST00000114231 96 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Clip3B9EHT4 Gm12643-201ENSMUST00000116078 374 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Clip3B9EHT4 Gm11212-201ENSMUST00000118337 618 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Clip3B9EHT4 Gm12099-201ENSMUST00000118660 750 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Clip3B9EHT4 Hspe1-ps4-201ENSMUST00000119538 286 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Clip3B9EHT4 Gm11484-201ENSMUST00000119808 338 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Clip3B9EHT4 Olfr1177-ps-201ENSMUST00000137895 921 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Clip3B9EHT4 Gm13189-201ENSMUST00000138462 252 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Clip3B9EHT4 Gm15787-206ENSMUST00000141008 585 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Clip3B9EHT4 Gm14710-201ENSMUST00000146082 1066 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Clip3B9EHT4 Crem-236ENSMUST00000154715 1167 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Clip3B9EHT4 Gm25246-201ENSMUST00000175476 69 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Clip3B9EHT4 Gm21809-201ENSMUST00000178495 468 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Clip3B9EHT4 Gm17467-201ENSMUST00000178553 468 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Clip3B9EHT4 Gm17412-201ENSMUST00000179261 468 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Clip3B9EHT4 Gm17577-201ENSMUST00000179916 468 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Clip3B9EHT4 Gm29576-201ENSMUST00000188020 678 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Clip3B9EHT4 1700124L16Rik-202ENSMUST00000189308 546 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Clip3B9EHT4 Gm28354-201ENSMUST00000190904 678 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Clip3B9EHT4 Gm29678-201ENSMUST00000193966 1134 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Clip3B9EHT4 Gm43619-201ENSMUST00000197267 914 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Clip3B9EHT4 Asb17os-202ENSMUST00000200329 497 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Clip3B9EHT4 Olfr1479-ps1-201ENSMUST00000207752 382 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Clip3B9EHT4 Olfr1498-ps1-201ENSMUST00000208721 991 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Clip3B9EHT4 AC159896.3-201ENSMUST00000215904 3835 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Clip3B9EHT4 AC167222.2-201ENSMUST00000220014 295 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Clip3B9EHT4 Gm5176-202ENSMUST00000220267 583 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Clip3B9EHT4 AC116465.1-201ENSMUST00000220324 235 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Clip3B9EHT4 AC159256.1-201ENSMUST00000224298 1039 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Clip3B9EHT4 AC154747.1-201ENSMUST00000225265 239 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Clip3B9EHT4 AC154467.1-201ENSMUST00000227527 449 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Clip3B9EHT4 AC137902.2-201ENSMUST00000227989 576 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Clip3B9EHT4 1700007K09Rik-201ENSMUST00000033146 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Clip3B9EHT4 Olfr1461-201ENSMUST00000053772 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Clip3B9EHT4 Vmn1r12-201ENSMUST00000073384 924 ntAPPRIS P2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Clip3B9EHT4 D130040H23Rik-201ENSMUST00000078257 1218 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Clip3B9EHT4 Olfr347-201ENSMUST00000078761 943 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Clip3B9EHT4 Defa17-201ENSMUST00000079528 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Clip3B9EHT4 Vmn1r77-202ENSMUST00000226525 8252 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Clip3B9EHT4 Olfr684-204ENSMUST00000217136 3182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Clip3B9EHT4 Ros1-201ENSMUST00000020045 7401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Clip3B9EHT4 Stra6l-202ENSMUST00000107782 4009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Clip3B9EHT4 Gm13977-201ENSMUST00000133648 4049 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Clip3B9EHT4 Gm15457-201ENSMUST00000129513 3990 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Clip3B9EHT4 Mrgprb2-201ENSMUST00000052730 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Clip3B9EHT4 Cpxcr1-201ENSMUST00000101269 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Clip3B9EHT4 Cenpf-204ENSMUST00000171929 11130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Clip3B9EHT4 Iqub-201ENSMUST00000052277 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Clip3B9EHT4 AC168274.1-201ENSMUST00000218657 1864 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Clip3B9EHT4 Vmn1r71-203ENSMUST00000227003 5048 ntAPPRIS P2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Clip3B9EHT4 Vmn2r112-201ENSMUST00000097381 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Clip3B9EHT4 Olfr1242-202ENSMUST00000111540 2189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Clip3B9EHT4 9830004L10Rik-201ENSMUST00000185548 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Clip3B9EHT4 Glyat-202ENSMUST00000119960 3296 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Clip3B9EHT4 Gm21269-201ENSMUST00000206521 12456 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Clip3B9EHT4 Gm37181-201ENSMUST00000192513 1727 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Clip3B9EHT4 Wdr49-203ENSMUST00000204341 1344 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Clip3B9EHT4 Gm43085-201ENSMUST00000202859 3132 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Clip3B9EHT4 9330178D15Rik-201ENSMUST00000196033 3451 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Clip3B9EHT4 Nlrp5-202ENSMUST00000086341 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Clip3B9EHT4 Igkv4-70-201ENSMUST00000103348 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Clip3B9EHT4 Igkv6-23-201ENSMUST00000103386 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Clip3B9EHT4 Gm25917-201ENSMUST00000104267 130 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Clip3B9EHT4 Mup6-202ENSMUST00000107520 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Clip3B9EHT4 Gm16400-201ENSMUST00000116523 1029 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Clip3B9EHT4 Gm13193-201ENSMUST00000117275 225 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Clip3B9EHT4 Olfr1117-ps1-201ENSMUST00000118736 984 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Clip3B9EHT4 Gm15233-201ENSMUST00000118747 400 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Clip3B9EHT4 Gm16074-201ENSMUST00000119524 444 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Clip3B9EHT4 Gm12066-201ENSMUST00000123592 443 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Clip3B9EHT4 Gm14349-201ENSMUST00000137155 902 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Clip3B9EHT4 Gm24734-201ENSMUST00000158860 262 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Clip3B9EHT4 Olfr757-ps1-201ENSMUST00000172798 413 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Clip3B9EHT4 Olfr758-ps1-201ENSMUST00000173901 841 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Clip3B9EHT4 Gm20456-201ENSMUST00000174690 385 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Clip3B9EHT4 1110008L16Rik-203ENSMUST00000183654 943 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Clip3B9EHT4 1700064J06Rik-201ENSMUST00000187551 386 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Clip3B9EHT4 Gm6693-201ENSMUST00000189583 813 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Clip3B9EHT4 Gm5734-201ENSMUST00000189787 913 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Clip3B9EHT4 Gm8860-201ENSMUST00000193160 445 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
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