Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Olfr703-202ENSMUST00000216254 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Olfr312-202ENSMUST00000216407 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Gm6288-201ENSMUST00000100778 1590 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Sult1c1-201ENSMUST00000024738 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Wnk3-206ENSMUST00000184730 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Mrgprb2-201ENSMUST00000052730 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Olfr1065-204ENSMUST00000217586 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Gm3020-201ENSMUST00000112801 450 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Gm8202-201ENSMUST00000117682 310 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Gm11633-201ENSMUST00000118176 444 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Gm12281-201ENSMUST00000119536 298 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Gm4852-201ENSMUST00000121202 729 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Gm13209-201ENSMUST00000138492 494 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Gm13617-201ENSMUST00000155350 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Gm27016-201ENSMUST00000183294 715 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Gm27387-201ENSMUST00000184583 116 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 1700010I02Rik-201ENSMUST00000187729 438 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Gm20561-201ENSMUST00000188131 292 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Olfr416-ps1-201ENSMUST00000192734 804 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Gm43685-201ENSMUST00000198876 706 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Gm19617-201ENSMUST00000202977 308 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Olfr1077-ps1-201ENSMUST00000213225 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Gm7045-201ENSMUST00000221466 605 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 9530050K03Rik-201ENSMUST00000221663 1299 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Olfr1020-201ENSMUST00000055840 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Ano5-202ENSMUST00000207044 3311 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Zfp867-201ENSMUST00000057799 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 2700099C18Rik-204ENSMUST00000183133 1333 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Jchain-201ENSMUST00000087033 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Gm10352-201ENSMUST00000166474 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Gm36963-201ENSMUST00000193506 2324 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 4921539E11Rik-203ENSMUST00000168664 2356 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Cfap97-201ENSMUST00000034048 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Gm43386-201ENSMUST00000199654 4001 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 AC158779.2-201ENSMUST00000227902 1947 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Olfr800-201ENSMUST00000104903 940 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Olfr328-202ENSMUST00000108824 1199 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Magea9-ps-201ENSMUST00000140655 732 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Gm12195-201ENSMUST00000144990 469 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Gm15600-201ENSMUST00000153522 856 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Gm6542-201ENSMUST00000153606 772 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Gm22804-201ENSMUST00000158052 101 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Gm26034-201ENSMUST00000158154 116 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Speer4cos-201ENSMUST00000162113 1083 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Gm16285-201ENSMUST00000162999 347 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Magea9-ps-202ENSMUST00000167328 899 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Prl5a1-201ENSMUST00000017208 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Obox1-205ENSMUST00000173443 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Obox2-204ENSMUST00000174305 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Gm27762-201ENSMUST00000183417 109 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Gm37884-201ENSMUST00000191857 818 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Gm38046-201ENSMUST00000192733 550 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Gm37223-202ENSMUST00000193592 490 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Gm37719-201ENSMUST00000194615 292 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Gm43391-201ENSMUST00000196145 883 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Gm32554-201ENSMUST00000196310 970 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Gm21847-202ENSMUST00000198681 883 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Gm19921-201ENSMUST00000210505 703 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Gm17999-201ENSMUST00000211568 542 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Olfr858-ps1-201ENSMUST00000212591 930 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 AC241593.2-201ENSMUST00000225099 510 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 AC137117.1-201ENSMUST00000226912 441 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 AC131997.2-201ENSMUST00000227452 362 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Fam24a-201ENSMUST00000084505 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Setd2-201ENSMUST00000153838 8350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Emcn-201ENSMUST00000119475 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Zfp871-201ENSMUST00000057501 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Gm44668-201ENSMUST00000207911 3265 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Enpp3-201ENSMUST00000020169 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Angptl3-201ENSMUST00000030280 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Gm43490-201ENSMUST00000197593 2652 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Gm10558-201ENSMUST00000147494 1661 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Ktn1-216ENSMUST00000189533 3941 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Syt14-205ENSMUST00000215093 9274 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Ccna2-205ENSMUST00000196316 2001 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 AC162467.3-201ENSMUST00000219716 2172 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Gm14569-204ENSMUST00000169499 5181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Olfr390-204ENSMUST00000215161 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 AC121997.2-201ENSMUST00000228095 2294 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Mir99ahg-201ENSMUST00000068704 2858 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Trbv12-1-201ENSMUST00000103267 389 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Gm15390-201ENSMUST00000120323 738 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Gm15227-201ENSMUST00000121844 399 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Gm13632-201ENSMUST00000150119 384 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Aste1-207ENSMUST00000176940 1151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Gm28692-202ENSMUST00000189645 621 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Gm45236-201ENSMUST00000208632 229 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Gm45579-201ENSMUST00000209367 887 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 AC125190.2-201ENSMUST00000221160 497 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Gm7822-201ENSMUST00000222433 581 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 AC123061.2-201ENSMUST00000226234 802 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 AC161269.1-201ENSMUST00000228426 318 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 AC154627.3-201ENSMUST00000228441 334 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Defa26-201ENSMUST00000074343 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Cntnap5c-201ENSMUST00000076038 3931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 AC190403.1-201ENSMUST00000224515 1325 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Skint5-204ENSMUST00000171627 1611 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Clrn2B2RVW2 Wac-217ENSMUST00000172018 1965 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms