Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Gm3257-201ENSMUST00000207217 675 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 AC160966.1-201ENSMUST00000217147 933 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Pln-204ENSMUST00000219491 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 AC164164.2-201ENSMUST00000221809 785 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm10037-204ENSMUST00000222626 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Dppa3-201ENSMUST00000049644 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Olfr729-201ENSMUST00000061020 972 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Olfr911-ps1-201ENSMUST00000074987 940 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Ankrd36-202ENSMUST00000109856 4491 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Lipk-203ENSMUST00000225505 2083 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Cul5-202ENSMUST00000120122 5945 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm43019-201ENSMUST00000196948 2863 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm3696-201ENSMUST00000167923 1814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Vmn2r113-201ENSMUST00000170322 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Nsun6-203ENSMUST00000114713 2420 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Cx3cr1-202ENSMUST00000177637 3156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm10256-203ENSMUST00000189964 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm38156-201ENSMUST00000194601 2260 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 AU041133-201ENSMUST00000105314 1494 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm20655-202ENSMUST00000181428 2946 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Iigp1-202ENSMUST00000066912 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm14391-202ENSMUST00000109055 965 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm16400-201ENSMUST00000116523 1029 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm7421-201ENSMUST00000119298 639 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm7365-201ENSMUST00000120877 639 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm11344-201ENSMUST00000122011 335 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm15265-201ENSMUST00000133494 551 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm14419-203ENSMUST00000156844 752 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 4930558K02Rik-202ENSMUST00000162676 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Prl3d2-202ENSMUST00000164964 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
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Hdac6Q9Z2V5 Gm23164-201ENSMUST00000175084 111 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Mir6986-201ENSMUST00000184483 58 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm28353-201ENSMUST00000186482 570 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm28533-201ENSMUST00000186741 570 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 AV026068-209ENSMUST00000189143 517 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm28902-201ENSMUST00000191531 215 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Rpl23a-ps5-201ENSMUST00000194566 466 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
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Hdac6Q9Z2V5 AC119892.1-201ENSMUST00000217997 384 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm35558-202ENSMUST00000221819 499 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
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Hdac6Q9Z2V5 Gm29687-201ENSMUST00000223022 879 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 4930455B14Rik-203ENSMUST00000223613 640 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
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Hdac6Q9Z2V5 Gm10220-201ENSMUST00000088236 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
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Hdac6Q9Z2V5 Olfr15-202ENSMUST00000214238 6135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Abcb11-202ENSMUST00000102710 4893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
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Hdac6Q9Z2V5 Ptbp3-212ENSMUST00000174586 6640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Pax6os1-202ENSMUST00000149133 1464 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Sirpb1a-203ENSMUST00000192700 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Kif15-201ENSMUST00000040717 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Adam21-201ENSMUST00000008582 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Rasgrp3-202ENSMUST00000164192 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm38077-201ENSMUST00000193657 3245 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
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Hdac6Q9Z2V5 Pcdh15-204ENSMUST00000105426 6802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
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Hdac6Q9Z2V5 Olfr381-202ENSMUST00000119863 1065 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
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Hdac6Q9Z2V5 Gm13335-201ENSMUST00000129994 471 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 1700046C09Rik-201ENSMUST00000139973 543 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm25979-201ENSMUST00000157177 138 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
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Hdac6Q9Z2V5 Rpl9-ps9-201ENSMUST00000173020 573 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Olfr758-ps1-201ENSMUST00000173901 841 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r-ps11-201ENSMUST00000176097 853 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm21241-201ENSMUST00000179551 934 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
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Hdac6Q9Z2V5 Gm28188-201ENSMUST00000190483 236 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm18407-201ENSMUST00000192126 790 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm43724-201ENSMUST00000197516 226 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm38670-201ENSMUST00000199248 77 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm8039-201ENSMUST00000204758 712 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm19761-201ENSMUST00000205372 391 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm45820-201ENSMUST00000212068 362 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 4930545L08Rik-201ENSMUST00000215688 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Lilr4b-211ENSMUST00000219661 1143 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 AC151730.2-201ENSMUST00000224027 475 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 AC130823.2-201ENSMUST00000226169 290 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 AC123061.2-201ENSMUST00000226234 802 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 AC102603.1-201ENSMUST00000227481 584 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
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