Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Gm23852-201ENSMUST00000158376 77 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Olfr756-ps1-201ENSMUST00000173450 928 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm21737-201ENSMUST00000178112 664 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm20874-201ENSMUST00000178356 663 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm21744-201ENSMUST00000178403 662 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm20901-201ENSMUST00000180177 664 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm6055-201ENSMUST00000180532 378 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Mir6337-201ENSMUST00000184194 105 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Mir7093-201ENSMUST00000184195 101 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm18667-201ENSMUST00000186523 484 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 1700064J06Rik-201ENSMUST00000187551 386 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm29284-201ENSMUST00000188363 255 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm28090-201ENSMUST00000189458 664 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm21647-201ENSMUST00000189755 664 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 1700031M16Rik-206ENSMUST00000191037 711 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm31887-201ENSMUST00000197661 501 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm2142-201ENSMUST00000197899 589 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm44989-201ENSMUST00000204749 217 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm30790-201ENSMUST00000208256 958 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm44861-201ENSMUST00000208325 1220 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm19033-201ENSMUST00000208516 964 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm30694-201ENSMUST00000209278 1230 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 AC153357.1-201ENSMUST00000219190 482 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm32172-201ENSMUST00000220029 633 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 CT025611.2-201ENSMUST00000220475 879 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm4263-202ENSMUST00000221392 667 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 1700024I08Rik-203ENSMUST00000222372 754 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 AC123705.4-201ENSMUST00000222411 493 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 AC156576.2-202ENSMUST00000222525 411 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 AC154816.1-201ENSMUST00000222688 634 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 AC154808.1-201ENSMUST00000223156 730 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm46401-202ENSMUST00000223425 803 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 AC124433.2-201ENSMUST00000223867 291 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 CT573085.1-201ENSMUST00000224279 1197 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 AC174797.3-202ENSMUST00000224578 587 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 2310030G06Rik-201ENSMUST00000034564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm25079-201ENSMUST00000082529 203 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm24454-201ENSMUST00000083349 132 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Klkb1-201ENSMUST00000026907 5249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Abca6-201ENSMUST00000044003 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Pomp-202ENSMUST00000201120 3850 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 AC117232.2-201ENSMUST00000219469 2917 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Grik2-202ENSMUST00000105484 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Rs1-201ENSMUST00000033650 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 March1-208ENSMUST00000110259 3181 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Olfr947-ps1-202ENSMUST00000214936 2168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Nsun6-202ENSMUST00000076435 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Mctp1-205ENSMUST00000126960 1780 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm6337-201ENSMUST00000168088 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Olfr11-202ENSMUST00000205631 3265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Ctsq-201ENSMUST00000021888 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm37206-201ENSMUST00000195512 3069 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Fcgr2b-201ENSMUST00000027966 3544 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 9330111N05Rik-201ENSMUST00000180409 1407 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm44045-201ENSMUST00000204906 2520 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 AC126549.1-201ENSMUST00000225044 3687 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Vmn2r-ps34-202ENSMUST00000204750 1671 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Mdga2-210ENSMUST00000222167 2871 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Fam122c-201ENSMUST00000114835 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm15087-201ENSMUST00000117465 1172 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm15175-201ENSMUST00000117629 132 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm12717-201ENSMUST00000118427 983 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm11719-201ENSMUST00000119399 351 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Vmn1r-ps135-201ENSMUST00000120909 595 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm8317-201ENSMUST00000121261 471 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm7931-201ENSMUST00000121537 271 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Olfr377-ps1-201ENSMUST00000134011 1136 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm25434-201ENSMUST00000158278 167 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Smim9-203ENSMUST00000165080 414 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Vmn1r88-201ENSMUST00000171783 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm4076-201ENSMUST00000179230 965 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 1700010L04Rik-203ENSMUST00000179662 1015 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm26923-201ENSMUST00000182615 996 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm27428-201ENSMUST00000184289 110 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 1700016L21Rik-201ENSMUST00000187497 394 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 1700023F02Rik-202ENSMUST00000188279 412 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 1700120K04Rik-201ENSMUST00000191038 546 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm37103-201ENSMUST00000191830 115 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm43370-201ENSMUST00000196437 284 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 4930512P04Rik-201ENSMUST00000197000 424 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm42999-201ENSMUST00000198049 786 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Cx3cl1-205ENSMUST00000211947 377 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm46102-201ENSMUST00000217005 731 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 AC154718.1-201ENSMUST00000226676 250 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Klrc1-202ENSMUST00000032271 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 1110032A03Rik-202ENSMUST00000042576 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Defb42-201ENSMUST00000067990 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Olfr919-201ENSMUST00000071425 948 ntAPPRIS P2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm10862-201ENSMUST00000193956 3350 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm44215-201ENSMUST00000204910 2711 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Birc6-223ENSMUST00000183224 14562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Vmn1r84-205ENSMUST00000228653 2769 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm15232-201ENSMUST00000146929 2318 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Fundc2-201ENSMUST00000033541 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Utp20-201ENSMUST00000004470 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Gm39465-201ENSMUST00000213810 9813 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Ift80-201ENSMUST00000029347 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Dclre1c-201ENSMUST00000061852 7075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps4Q99KG7 Ate1-208ENSMUST00000216011 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.9 ms