Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Prl5a1-201ENSMUST00000017208 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8214-201ENSMUST00000172123 351 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27688-201ENSMUST00000183634 91 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4412-201ENSMUST00000186660 433 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21856-201ENSMUST00000187547 696 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21735-201ENSMUST00000190360 696 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42452-201ENSMUST00000199749 617 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr859-201ENSMUST00000086480 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Spink13-201ENSMUST00000097557 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Nfyc-202ENSMUST00000097906 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r55-201ENSMUST00000098844 1284 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnj1-202ENSMUST00000172015 3075 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r-ps123-201ENSMUST00000176763 2410 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10727-201ENSMUST00000197107 1602 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr57-202ENSMUST00000203906 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 AC120347.1-201ENSMUST00000223326 1639 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 C130073E24Rik-202ENSMUST00000211313 14112 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Mga-203ENSMUST00000110773 13577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19514-201ENSMUST00000206856 4489 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Son-205ENSMUST00000122302 2449 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Sult1c1-201ENSMUST00000024738 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Nlrp5-202ENSMUST00000086341 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4914-201ENSMUST00000119757 459 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Skint1-205ENSMUST00000162885 603 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27690-201ENSMUST00000184596 126 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm36983-201ENSMUST00000192280 1102 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7045-201ENSMUST00000221466 605 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 AC161252.2-201ENSMUST00000224978 374 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr736-201ENSMUST00000058965 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Plcz1-201ENSMUST00000032356 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Zscan4-ps2-201ENSMUST00000091440 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6853-202ENSMUST00000211360 4375 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Chrnb3-203ENSMUST00000211104 3241 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Zgrf1-202ENSMUST00000195955 3804 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Fat4-201ENSMUST00000061260 16109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1192-ps1-201ENSMUST00000120518 2738 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Unc13c-201ENSMUST00000075245 6633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Cyp3a57-201ENSMUST00000079268 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3183-202ENSMUST00000201703 2048 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Trbv26-201ENSMUST00000103280 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm12224-202ENSMUST00000127107 726 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm3127-203ENSMUST00000178386 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3187-201ENSMUST00000178429 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3685-202ENSMUST00000179199 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Mir6344-201ENSMUST00000183462 104 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28782-201ENSMUST00000185980 414 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38250-201ENSMUST00000192691 766 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm37480-201ENSMUST00000194795 550 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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Ccdc88cQ6VGS5 Gnrhr-201ENSMUST00000031172 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Slc19a3-201ENSMUST00000045560 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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Ccdc88cQ6VGS5 Snora52-201ENSMUST00000082732 137 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr552-201ENSMUST00000098223 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Samd3-202ENSMUST00000164660 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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Ccdc88cQ6VGS5 1700129L04Rik-202ENSMUST00000189291 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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Ccdc88cQ6VGS5 Zp3r-202ENSMUST00000128128 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm29301-202ENSMUST00000189344 1502 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Bclaf1-202ENSMUST00000092678 5307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr55-203ENSMUST00000214891 4428 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Pof1b-201ENSMUST00000039887 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Maml2-203ENSMUST00000177755 2264 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Sgip1-205ENSMUST00000106882 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Speer5-ps1-203ENSMUST00000217649 7431 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Htr2a-201ENSMUST00000036653 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Rps12-ps26-201ENSMUST00000117751 333 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13172-201ENSMUST00000118685 256 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16213-201ENSMUST00000160076 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Mir7031-201ENSMUST00000183860 65 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Rps27a-ps1-201ENSMUST00000191424 463 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37908-201ENSMUST00000195828 470 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8891-201ENSMUST00000198546 832 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm34224-201ENSMUST00000204606 364 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Fxyd1-210ENSMUST00000206012 501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Jakmip1-216ENSMUST00000212997 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 AC160635.2-201ENSMUST00000216368 734 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4263-201ENSMUST00000220693 1101 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 AC165092.2-201ENSMUST00000224681 368 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 AC154527.3-201ENSMUST00000225519 989 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 AC113031.3-201ENSMUST00000226552 190 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Fam24a-201ENSMUST00000084505 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Cpne4-202ENSMUST00000077190 3409 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 4930435E12Rik-201ENSMUST00000122078 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r-ps117-201ENSMUST00000176899 2188 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Dock10-205ENSMUST00000187774 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ccdc88cQ6VGS5 Xrn1-209ENSMUST00000190665 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
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