Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Cnep1r1-202ENSMUST00000117775 728 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Gm12985-201ENSMUST00000118376 183 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Ogt-202ENSMUST00000119299 3840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Gm12007-201ENSMUST00000120978 597 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Gm13007-201ENSMUST00000121866 365 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 2010013B24Rik-201ENSMUST00000126922 747 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Gm22804-201ENSMUST00000158052 101 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Gm3594-201ENSMUST00000169152 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Mir3062-201ENSMUST00000174986 105 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Obox4-ps9-201ENSMUST00000176927 1136 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Gm8890-202ENSMUST00000177727 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Gm8926-202ENSMUST00000178158 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Gm8879-202ENSMUST00000178863 465 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Gm8922-202ENSMUST00000178989 465 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Speer1-202ENSMUST00000179482 465 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Gm8897-202ENSMUST00000179679 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 BC065403-201ENSMUST00000180997 1022 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Gm8321-201ENSMUST00000181691 980 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Gm27985-201ENSMUST00000185112 378 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Gm18728-201ENSMUST00000186155 753 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Igkv15-101-201ENSMUST00000195917 299 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Tmem243-203ENSMUST00000198935 849 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Chaer1-201ENSMUST00000201649 651 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Gm44992-209ENSMUST00000209680 1083 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Gm45608-201ENSMUST00000210948 389 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Gm45494-201ENSMUST00000211167 545 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Olfr589-202ENSMUST00000218483 966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Gm4928-201ENSMUST00000219622 850 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 AC162467.1-201ENSMUST00000220254 621 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 4930480M12Rik-201ENSMUST00000221084 550 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Gm6474-201ENSMUST00000223250 699 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 A930023M06Rik-201ENSMUST00000223270 1093 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 AC129085.4-201ENSMUST00000224536 570 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 BC028528-201ENSMUST00000036360 752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Olfr589-201ENSMUST00000061055 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 n-R5s173-201ENSMUST00000082620 119 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Gm6300-201ENSMUST00000192393 1498 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Olfr1049-202ENSMUST00000216185 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Gm29666-201ENSMUST00000189185 8038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Gm42436-201ENSMUST00000198804 3656 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 9330159M07Rik-201ENSMUST00000180712 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Zfp995-201ENSMUST00000106026 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 D7Ertd443e-202ENSMUST00000106129 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Gm43282-201ENSMUST00000201848 2157 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Samd3-202ENSMUST00000164660 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Samd3-203ENSMUST00000218301 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Ascc3-206ENSMUST00000219226 1357 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Btf3l4-204ENSMUST00000102742 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Gm14569-204ENSMUST00000169499 5181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Kcnj2-201ENSMUST00000042970 5444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Mpeg1-201ENSMUST00000081035 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 BC018473-204ENSMUST00000156293 4753 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Olfr479-203ENSMUST00000214599 3248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Ceacam1-201ENSMUST00000098666 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Olfr1537-202ENSMUST00000213472 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Ahnak-202ENSMUST00000092956 18099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Sirpb1a-203ENSMUST00000192700 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Tsga10-207ENSMUST00000155852 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Gm18852-201ENSMUST00000184149 3593 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Gm2539-201ENSMUST00000180720 2411 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Rmi1-204ENSMUST00000225815 2447 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Naip6-202ENSMUST00000118574 6827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 B130006D01Rik-201ENSMUST00000100534 3124 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Igkv6-17-201ENSMUST00000103391 377 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Gm16205-201ENSMUST00000117720 1027 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Gm14576-201ENSMUST00000118073 1111 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Mup-ps19-201ENSMUST00000120390 519 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Gm11894-201ENSMUST00000121579 328 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Ufm1-202ENSMUST00000122330 637 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Gm26254-201ENSMUST00000122491 118 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Gm12205-201ENSMUST00000133940 575 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Gm22895-201ENSMUST00000157508 308 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Gm24854-201ENSMUST00000158025 98 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Gm24940-201ENSMUST00000158326 108 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Gm25603-201ENSMUST00000158361 105 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 1700129C05Rik-203ENSMUST00000162271 325 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Rpl9-ps9-201ENSMUST00000173020 573 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Mir3080-201ENSMUST00000175010 79 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Gm5849-201ENSMUST00000180151 351 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Mir6539-201ENSMUST00000183732 110 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Mir6994-201ENSMUST00000198985 73 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 1700065J11Rik-201ENSMUST00000201560 424 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Gm35648-201ENSMUST00000202304 475 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Gm17984-201ENSMUST00000205286 859 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Lrrc72-201ENSMUST00000020853 660 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 BC023105-201ENSMUST00000073997 1227 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Vmn1r216-201ENSMUST00000080253 1059 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Gm22456-201ENSMUST00000082578 125 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Mir412-201ENSMUST00000083636 80 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Defa23-201ENSMUST00000098899 411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 4921529L05Rik-201ENSMUST00000203047 1997 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Gm5444-201ENSMUST00000065956 2468 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Nsa2-201ENSMUST00000073456 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Cav1-201ENSMUST00000007799 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Vmn1r37-203ENSMUST00000226886 1308 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Nlrp9b-201ENSMUST00000073151 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Olfr1286-203ENSMUST00000213210 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Usp49Q6P9L4 Cntn3-202ENSMUST00000203619 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
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