Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Gm42610-201ENSMUST00000196557 650 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Obox4-ps4-201ENSMUST00000196934 397 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Igkv3-8-201ENSMUST00000197635 339 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 AC124542.1-201ENSMUST00000205588 908 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Gm4574-201ENSMUST00000207804 542 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Gm39154-201ENSMUST00000210257 560 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 AC162467.1-201ENSMUST00000220254 621 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Gm18940-201ENSMUST00000222518 871 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Gm7768-201ENSMUST00000222988 597 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
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Hoxa13Q62424 AC129085.4-201ENSMUST00000224536 570 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 AC133203.2-201ENSMUST00000226709 464 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Krtap31-2-201ENSMUST00000058761 935 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
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Hoxa13Q62424 Vmn1r80-201ENSMUST00000075053 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
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Hoxa13Q62424 Mir129-1-201ENSMUST00000083535 73 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Olfr878-201ENSMUST00000086061 1065 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Olfr390-201ENSMUST00000092919 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Olfr625-ps1-201ENSMUST00000098195 966 ntAPPRIS P5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Klhl4-202ENSMUST00000113371 3566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Klhl4-201ENSMUST00000040504 3584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 AC155634.1-201ENSMUST00000221687 2706 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Lrrtm4-203ENSMUST00000126399 3050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Skint5-204ENSMUST00000171627 1611 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Gm12289-201ENSMUST00000130860 2235 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Dtna-203ENSMUST00000220904 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Cyp4a12a-201ENSMUST00000084343 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Gm12784-202ENSMUST00000206001 3739 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Gm44584-201ENSMUST00000208395 2880 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Gm45520-201ENSMUST00000210109 2031 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Gm12667-201ENSMUST00000118299 1332 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Gm37598-201ENSMUST00000194506 1301 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Olfr1330-203ENSMUST00000106361 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 4931412I15Rik-201ENSMUST00000207844 1448 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Ktn1-223ENSMUST00000190999 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Vmn2r88-204ENSMUST00000228139 3227 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Gm9314-201ENSMUST00000199881 1528 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Tnip3-201ENSMUST00000114236 3769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Gm39321-201ENSMUST00000216597 2075 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Gm38081-201ENSMUST00000192680 1645 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 AC124516.1-201ENSMUST00000221845 3544 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Gm8700-201ENSMUST00000222187 3054 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Kcnip4-208ENSMUST00000176978 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
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Hoxa13Q62424 Slc7a12-202ENSMUST00000120484 1010 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Slc7a12-203ENSMUST00000120801 1069 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
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Hoxa13Q62424 Gm12735-201ENSMUST00000146218 651 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
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Hoxa13Q62424 Gm26652-201ENSMUST00000180592 373 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Trav12d-1-202ENSMUST00000183652 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
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Hoxa13Q62424 Gm37126-201ENSMUST00000195289 883 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
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Hoxa13Q62424 Gm7607-201ENSMUST00000214920 518 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Sult3a2-202ENSMUST00000223295 930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
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Hoxa13Q62424 Vmn1r12-201ENSMUST00000073384 924 ntAPPRIS P2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Mir337-201ENSMUST00000083592 97 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Mir449a-201ENSMUST00000083641 91 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Ccl8-201ENSMUST00000009329 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Ccdc66-201ENSMUST00000050480 2457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 D5Ertd577e-201ENSMUST00000094593 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Gm43891-201ENSMUST00000205132 3112 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Serpinb6e-201ENSMUST00000110275 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Zfp942-201ENSMUST00000074295 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Spam1-203ENSMUST00000202569 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Gm29502-201ENSMUST00000185979 3739 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Gm34069-201ENSMUST00000214060 2441 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Glmn-203ENSMUST00000100949 1759 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Gm37971-201ENSMUST00000193516 3391 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Rgs2-202ENSMUST00000127206 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Cab39l-201ENSMUST00000022553 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Gm13058-201ENSMUST00000117097 1435 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxa13Q62424 Gm42661-201ENSMUST00000202364 1442 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.1 ms