Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Igkv4-73-201ENSMUST00000199760 358 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm5-202ENSMUST00000202386 420 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm43941-201ENSMUST00000203303 1073 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm44312-201ENSMUST00000203536 469 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm44162-201ENSMUST00000203543 544 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm7890-201ENSMUST00000204877 601 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm44237-201ENSMUST00000205183 936 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Olfr723-202ENSMUST00000206058 1078 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm45236-201ENSMUST00000208632 229 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm45261-201ENSMUST00000211023 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm45850-201ENSMUST00000212536 338 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 AC069561.1-201ENSMUST00000213750 424 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm46311-201ENSMUST00000217971 203 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 AL513022.1-201ENSMUST00000220489 504 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm34719-201ENSMUST00000222231 382 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Pglyrp3-201ENSMUST00000047660 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Olfr273-201ENSMUST00000051520 1059 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Ear6-201ENSMUST00000074477 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Olfr724-201ENSMUST00000075030 1006 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Defb35-201ENSMUST00000076786 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Nms-201ENSMUST00000088029 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Olfr606-201ENSMUST00000098200 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 4930562D21Rik-201ENSMUST00000123894 1750 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Cyp3a25-201ENSMUST00000068317 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm37345-201ENSMUST00000193062 3138 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Olfr47-202ENSMUST00000215569 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Olfr612-203ENSMUST00000215663 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm18852-201ENSMUST00000184149 3593 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm7416-201ENSMUST00000117448 1487 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm14552-201ENSMUST00000126906 2098 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm43188-201ENSMUST00000200180 2160 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm15394-201ENSMUST00000119656 1308 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Olfr32-204ENSMUST00000215153 3117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Ifi202b-201ENSMUST00000000266 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Tsga10-203ENSMUST00000114902 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm2123-201ENSMUST00000221476 2836 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm13477-201ENSMUST00000121620 2687 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm37686-201ENSMUST00000194099 2309 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm44860-201ENSMUST00000208473 2346 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm33843-201ENSMUST00000219313 1637 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s178-201ENSMUST00000104249 114 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm24886-201ENSMUST00000104384 123 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm42674-201ENSMUST00000107330 446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Glrb-202ENSMUST00000107743 1101 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm11409-201ENSMUST00000118621 403 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm16318-201ENSMUST00000162402 601 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm42421-201ENSMUST00000172367 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm20663-201ENSMUST00000176647 474 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm18728-201ENSMUST00000186155 753 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm9569-201ENSMUST00000187492 787 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 1810006J02Rik-202ENSMUST00000191060 523 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm18698-201ENSMUST00000192327 668 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm2979-201ENSMUST00000193442 463 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Ighv1-17-201ENSMUST00000194435 350 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 AC136146.1-201ENSMUST00000196180 91 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm42830-201ENSMUST00000196642 313 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 AC117240.1-201ENSMUST00000199436 61 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm32536-201ENSMUST00000205209 445 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm44822-201ENSMUST00000208559 6389 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm4587-201ENSMUST00000209135 637 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Olfr856-ps1-201ENSMUST00000212177 948 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 AC138284.2-201ENSMUST00000213982 567 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 AC113082.2-201ENSMUST00000215876 756 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 AC160635.2-201ENSMUST00000216368 734 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 AC142227.2-201ENSMUST00000220675 400 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 AV026068-216ENSMUST00000223874 328 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 AC102676.1-201ENSMUST00000228131 719 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r70-201ENSMUST00000055847 897 ntAPPRIS P2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Mir215-201ENSMUST00000083628 112 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm25821-201ENSMUST00000093657 133 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Mrgprb5-201ENSMUST00000094389 1037 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 2700062C07Rik-201ENSMUST00000097646 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Pfpl-201ENSMUST00000168148 3918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Erbin-204ENSMUST00000169083 5435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r174-202ENSMUST00000228331 9058 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm43658-201ENSMUST00000202348 4176 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Zfp808-201ENSMUST00000099449 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm3675-201ENSMUST00000175904 1653 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r200-205ENSMUST00000228726 5525 ntAPPRIS P2 BASIC3.96□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r172-201ENSMUST00000038694 9009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm1720-201ENSMUST00000135086 1503 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 S100a1-202ENSMUST00000107340 577 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Zfp972-202ENSMUST00000108934 561 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Csn1s2b-203ENSMUST00000113279 745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Rpl21-ps9-201ENSMUST00000119897 482 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Olfr337-ps1-201ENSMUST00000120380 456 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm12288-201ENSMUST00000121054 1282 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Prlr-212ENSMUST00000148257 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm14216-202ENSMUST00000155334 492 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm22596-201ENSMUST00000157601 316 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Naa60-210ENSMUST00000176224 501 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Cox6b2-208ENSMUST00000183971 401 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Mhrt-202ENSMUST00000185798 447 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm28873-201ENSMUST00000186130 667 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm28086-201ENSMUST00000191586 317 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm29745-201ENSMUST00000198005 687 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm43925-201ENSMUST00000203498 206 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm44169-201ENSMUST00000205133 359 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
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