Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 AL590616.1-201ENSMUST00000223339 574 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
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Znf48Q3US17 AC154592.1-201ENSMUST00000225784 574 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Znf48Q3US17 AC166369.1-201ENSMUST00000228126 351 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
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Znf48Q3US17 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Znf48Q3US17 Gm12290-201ENSMUST00000145095 2112 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
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Znf48Q3US17 Fbxw16-201ENSMUST00000084984 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
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Znf48Q3US17 Cyp4a14-201ENSMUST00000030487 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
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Znf48Q3US17 Frg1-201ENSMUST00000033999 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Znf48Q3US17 Art2b-201ENSMUST00000063920 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Znf48Q3US17 Rapgef6-201ENSMUST00000094536 3372 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Znf48Q3US17 AC122346.1-201ENSMUST00000225266 3732 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Znf48Q3US17 Cmah-208ENSMUST00000224819 9482 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Znf48Q3US17 Gpr22-203ENSMUST00000176710 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Znf48Q3US17 Vmn1r235-201ENSMUST00000060603 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
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