Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Mir7037-201ENSMUST00000184414 65 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 4930519F24Rik-201ENSMUST00000185764 579 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Gm29395-201ENSMUST00000188551 1049 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Gm37173-201ENSMUST00000194498 1017 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Igkv12-40-201ENSMUST00000199208 347 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Gm21461-201ENSMUST00000200382 863 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Gm18007-201ENSMUST00000205019 844 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Gm45083-201ENSMUST00000205216 712 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Gm6145-201ENSMUST00000209522 710 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 AC161114.1-201ENSMUST00000218223 474 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 AC153800.1-201ENSMUST00000219212 365 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 AC153936.1-201ENSMUST00000219874 395 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Gm40692-201ENSMUST00000220411 491 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 4930583I09Rik-201ENSMUST00000024896 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1020-201ENSMUST00000055840 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Cox6b2-201ENSMUST00000063324 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Olfr39-201ENSMUST00000071725 1098 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Gm10112-201ENSMUST00000075226 354 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Olfr248-201ENSMUST00000075329 1010 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Mir188-201ENSMUST00000083464 68 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Mir133b-201ENSMUST00000083546 119 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Gm9314-201ENSMUST00000199881 1528 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Amy1-201ENSMUST00000067980 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Olfr495-202ENSMUST00000215215 2460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Tmem72-201ENSMUST00000056623 17152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 4933439N06Rik-201ENSMUST00000203062 1365 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Jchain-201ENSMUST00000087033 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Ugt2b1-201ENSMUST00000031183 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Slc6a15-202ENSMUST00000179636 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Postn-204ENSMUST00000117373 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Prrc2c-202ENSMUST00000182149 11289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Tcp1-ps1-201ENSMUST00000120941 1466 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Olfr586-204ENSMUST00000215304 6169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Gm26753-201ENSMUST00000181938 2731 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Epha7-201ENSMUST00000029964 6746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Trim30a-201ENSMUST00000076922 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Spaca1-203ENSMUST00000108148 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Gm7312-201ENSMUST00000118798 469 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Gm14175-201ENSMUST00000119835 241 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Gm23250-201ENSMUST00000157444 267 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r10-201ENSMUST00000176073 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 1500004A13Rik-206ENSMUST00000184170 576 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r82-202ENSMUST00000191002 918 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Gm30043-201ENSMUST00000196689 733 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Gm8189-203ENSMUST00000211159 1225 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Ormdl2-202ENSMUST00000217685 666 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 AC121137.1-201ENSMUST00000225272 602 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Cst12-201ENSMUST00000028932 644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Gm4963-201ENSMUST00000072718 378 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Mir337-201ENSMUST00000083592 97 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Olfr894-201ENSMUST00000093866 949 ntAPPRIS P2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Ros1-202ENSMUST00000218452 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 AC122382.2-201ENSMUST00000225128 3602 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 2700089I24Rik-201ENSMUST00000190204 1827 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Epha7-203ENSMUST00000108191 6615 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Cr2-208ENSMUST00000195120 6212 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Olfr364-ps1-202ENSMUST00000214905 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Gm37140-201ENSMUST00000192914 1684 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Ctsj-202ENSMUST00000224224 1421 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1026-203ENSMUST00000219615 1465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Mcmdc2-202ENSMUST00000118098 2072 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Zfp26-203ENSMUST00000159569 11276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Mmp13-201ENSMUST00000015394 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Ptgs2-201ENSMUST00000035065 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 4933403O08Rik-203ENSMUST00000164272 1517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Gm4759-201ENSMUST00000183414 6622 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Dnah8-201ENSMUST00000170651 14583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Gm14575-201ENSMUST00000117210 560 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Gm11822-201ENSMUST00000119177 415 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Gm13489-201ENSMUST00000121234 971 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Gm12854-201ENSMUST00000128518 297 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Gm16180-201ENSMUST00000128662 312 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 9030622O22Rik-201ENSMUST00000129082 1245 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Gm15265-201ENSMUST00000133494 551 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 C030037F17Rik-201ENSMUST00000155211 406 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Gm23673-201ENSMUST00000157474 298 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Skint1-204ENSMUST00000162158 1260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Skint1-205ENSMUST00000162885 603 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Gm20647-201ENSMUST00000176396 857 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 1700027A15Rik-201ENSMUST00000185768 321 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Gm29454-201ENSMUST00000190805 393 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Gm37123-201ENSMUST00000192994 1171 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Gm37640-201ENSMUST00000195407 300 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 AC136146.1-201ENSMUST00000196180 91 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Gm42952-201ENSMUST00000196393 731 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Gm43794-201ENSMUST00000200971 692 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Gm44795-201ENSMUST00000205496 319 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Olfr856-ps1-201ENSMUST00000212177 948 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Desi2-202ENSMUST00000069568 1193 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r214-201ENSMUST00000074252 1227 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Ear6-201ENSMUST00000074477 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Gm7665-201ENSMUST00000076710 297 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 n-R5s173-201ENSMUST00000082620 119 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Slc5a12-201ENSMUST00000045972 3529 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ctdnep1Q3TP92 Gm15581-201ENSMUST00000131334 5640 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Ctdnep1Q3TP92 Olfr916-203ENSMUST00000214093 3685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Ctdnep1Q3TP92 Gm3675-201ENSMUST00000175904 1653 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Ctdnep1Q3TP92 Clvs1-202ENSMUST00000108348 3526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Ctdnep1Q3TP92 Fbxw24-201ENSMUST00000073962 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms