Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Olfr801-201ENSMUST00000072063 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Olfr871-201ENSMUST00000073122 1147 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Vmn1r216-201ENSMUST00000080253 1059 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Mir31-201ENSMUST00000083474 106 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm37140-201ENSMUST00000192914 1684 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Pja2-203ENSMUST00000172733 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Cul3-202ENSMUST00000164108 2442 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Mfn1-202ENSMUST00000118286 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Kynu-203ENSMUST00000112826 1587 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Ttn-202ENSMUST00000099980 16891 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Stk3-205ENSMUST00000226555 2730 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Olfr1152-202ENSMUST00000213308 6201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Olfr387-ps1-201ENSMUST00000134773 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Phyhipl-206ENSMUST00000162251 1540 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm37911-201ENSMUST00000193099 1545 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Olfr906-202ENSMUST00000214344 3775 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Pum2-209ENSMUST00000168361 6226 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 AC151971.5-201ENSMUST00000214422 3254 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm37124-201ENSMUST00000192140 1992 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 H3f3c-201ENSMUST00000119459 411 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm12281-201ENSMUST00000119536 298 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm13610-201ENSMUST00000128298 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Tmem216-206ENSMUST00000154383 927 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm17063-201ENSMUST00000168135 456 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm8256-201ENSMUST00000169178 453 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm17086-201ENSMUST00000171346 484 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Vmn1r139-202ENSMUST00000173668 753 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps75-201ENSMUST00000174316 920 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm16456-201ENSMUST00000174431 920 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm26731-201ENSMUST00000180683 543 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 C920009B18Rik-203ENSMUST00000181643 1004 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm29474-201ENSMUST00000187688 379 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm29540-201ENSMUST00000188207 337 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 1700072G22Rik-201ENSMUST00000189460 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm40190-201ENSMUST00000196570 471 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm31026-201ENSMUST00000198762 821 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm43531-201ENSMUST00000200676 1114 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm45215-201ENSMUST00000206407 395 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Olfr1480-203ENSMUST00000207904 1209 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm45721-201ENSMUST00000212267 607 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 AC183268.2-201ENSMUST00000214513 446 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 AC155808.1-201ENSMUST00000219288 409 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm26861-206ENSMUST00000222633 1039 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 AC153153.2-201ENSMUST00000223572 411 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 AC131100.2-201ENSMUST00000227701 998 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 BC028528-201ENSMUST00000036360 752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Olfr884-201ENSMUST00000077732 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm24706-201ENSMUST00000082806 137 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 n-R5s88-201ENSMUST00000083173 118 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Olfr640-201ENSMUST00000084799 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Zbed4-ps1-201ENSMUST00000186734 3466 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm21693-202ENSMUST00000186047 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm3376-202ENSMUST00000186140 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm21704-202ENSMUST00000187277 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm10352-202ENSMUST00000187842 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm21677-202ENSMUST00000189592 1576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Olfr1444-202ENSMUST00000213606 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Olfr328-203ENSMUST00000215717 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Ube2u-202ENSMUST00000133493 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Vmn1r61-201ENSMUST00000164880 1818 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Oog4-202ENSMUST00000073641 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 A830019P07Rik-201ENSMUST00000178904 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Cyp2c70-201ENSMUST00000051846 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Serpinb5-201ENSMUST00000086701 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Lrrtm4-203ENSMUST00000126399 3050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Vmn2r34-201ENSMUST00000173459 3616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Olfr183-205ENSMUST00000214916 2249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Lingo2-210ENSMUST00000164772 3562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Vmn2r5-201ENSMUST00000170270 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Fam26d-201ENSMUST00000048052 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm14886-201ENSMUST00000117208 2629 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Ktn1-209ENSMUST00000187262 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm19113-201ENSMUST00000217552 1828 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Mir466i-201ENSMUST00000116924 121 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm14930-201ENSMUST00000118864 652 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm12372-201ENSMUST00000121654 768 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm25176-201ENSMUST00000122640 125 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm11846-201ENSMUST00000155156 515 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Scarna13-201ENSMUST00000158164 275 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm26170-201ENSMUST00000158419 148 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm22326-201ENSMUST00000158897 351 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm16571-201ENSMUST00000159112 291 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm20523-201ENSMUST00000174340 1124 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Mir3473c-201ENSMUST00000175262 81 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm6882-201ENSMUST00000177741 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 5730522E02Rik-208ENSMUST00000179180 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm37996-201ENSMUST00000191859 367 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm37700-201ENSMUST00000192617 965 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm37560-201ENSMUST00000194289 1000 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm37882-201ENSMUST00000195254 196 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm2053-201ENSMUST00000195671 631 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Il6-202ENSMUST00000195978 651 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm22897-202ENSMUST00000197782 127 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm43444-201ENSMUST00000198123 291 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Il6-204ENSMUST00000199765 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Nts-201ENSMUST00000020040 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm42723-202ENSMUST00000200561 1254 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm31510-202ENSMUST00000206795 239 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms