Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Gm21122-201ENSMUST00000191548 3452 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Scn2a-202ENSMUST00000100067 8690 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Gm37717-201ENSMUST00000192647 3027 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Dhrs9-201ENSMUST00000063690 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Mme-205ENSMUST00000194134 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Slc9a9-201ENSMUST00000033463 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Olfr250-202ENSMUST00000216168 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Gm39043-201ENSMUST00000207602 2081 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 AC160028.2-201ENSMUST00000218937 2519 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Gm26563-202ENSMUST00000181152 1931 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Gm5891-202ENSMUST00000186212 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Gm10662-202ENSMUST00000186928 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Cyp2c65-201ENSMUST00000087236 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Tmem67-201ENSMUST00000050686 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Gm42492-201ENSMUST00000195780 2915 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Slc7a2-203ENSMUST00000117077 7626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Vmn1r84-202ENSMUST00000226408 2898 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Igkv10-95-201ENSMUST00000103329 287 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Igkv6-17-201ENSMUST00000103391 377 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Gm3267-201ENSMUST00000118671 473 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Gm12638-201ENSMUST00000119531 298 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Gm11759-201ENSMUST00000121742 464 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Gm6081-201ENSMUST00000134472 489 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Gm16345-201ENSMUST00000146065 158 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Gm26310-201ENSMUST00000157766 117 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Spink10-206ENSMUST00000162511 684 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Gm6872-201ENSMUST00000165001 700 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Vmn1r-ps25-201ENSMUST00000173545 799 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Gm9457-201ENSMUST00000180176 372 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 2310031A07Rik-201ENSMUST00000181212 990 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Hmgn3-205ENSMUST00000187193 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Ighv5-21-201ENSMUST00000191935 295 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Ighv1-3-201ENSMUST00000192764 302 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Gm43774-201ENSMUST00000196327 878 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Mir703-201ENSMUST00000197105 109 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Gm43408-201ENSMUST00000198263 440 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Gm43967-201ENSMUST00000203787 301 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Gm6145-201ENSMUST00000209522 710 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Olfr854-202ENSMUST00000212872 939 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 AC069561.4-201ENSMUST00000215291 572 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 AC123064.1-201ENSMUST00000218950 406 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 AC159619.1-201ENSMUST00000219118 318 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Gm35615-201ENSMUST00000221255 719 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 AC211878.2-201ENSMUST00000222486 488 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 AC154576.2-203ENSMUST00000224736 253 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 AC161609.1-201ENSMUST00000225878 474 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 AC125405.1-201ENSMUST00000226406 589 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Olfr1323-201ENSMUST00000057071 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Vmn1r52-201ENSMUST00000079832 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Xlr4b-203ENSMUST00000081827 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Gm22741-201ENSMUST00000083438 165 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Ssxb3-201ENSMUST00000089374 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Gm10540-201ENSMUST00000097581 276 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Olfr1056-201ENSMUST00000099893 1079 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Gm3526-201ENSMUST00000164544 1750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Gm3182-201ENSMUST00000167902 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Slc24a2-203ENSMUST00000107157 10531 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Rad21l-201ENSMUST00000096439 1650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Neb-201ENSMUST00000028320 10298 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 St18-210ENSMUST00000150761 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Olfr1246-204ENSMUST00000217254 5411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Ireb2-201ENSMUST00000034843 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Zfp937-201ENSMUST00000073782 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Olfr983-202ENSMUST00000213087 6196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Zfhx4-203ENSMUST00000175866 11287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Gm14367-201ENSMUST00000119214 1497 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Btbd35f9-201ENSMUST00000178219 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Btbd35f22-201ENSMUST00000178747 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Btbd35f30-201ENSMUST00000179069 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Btbd35f25-201ENSMUST00000179086 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Btbd35f29-201ENSMUST00000179532 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Btbd35f8-201ENSMUST00000180004 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Btbd35f26-201ENSMUST00000180197 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Gm42662-201ENSMUST00000202539 1431 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Slamf6-207ENSMUST00000195656 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Cc2d2b-203ENSMUST00000207801 3730 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Xcr1-201ENSMUST00000182350 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Olfr726-208ENSMUST00000217422 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Gm16513-201ENSMUST00000101023 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Gm22266-201ENSMUST00000104011 138 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Gm24160-201ENSMUST00000104594 126 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Olfr800-201ENSMUST00000104903 940 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Ceacam13-202ENSMUST00000108488 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Swi5-204ENSMUST00000113400 522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Olfr990-ps1-201ENSMUST00000120485 904 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Gm11797-201ENSMUST00000121336 754 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Gm25179-201ENSMUST00000122632 128 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Gm11381-201ENSMUST00000138574 420 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Gm15056-202ENSMUST00000167686 314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Olfr772-201ENSMUST00000169800 1004 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Gm20389-201ENSMUST00000174217 1006 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Gm21909-201ENSMUST00000178260 439 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Gm19200-201ENSMUST00000182579 1001 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Mir7028-201ENSMUST00000185016 64 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Gm27427-201ENSMUST00000185134 193 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Gm28926-201ENSMUST00000191063 680 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Gm29478-201ENSMUST00000191272 688 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Gm42625-201ENSMUST00000198611 922 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Gm43629-201ENSMUST00000201782 704 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Spata18Q0P557 Gm44830-201ENSMUST00000207667 584 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.6 ms