Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Gm10662-202ENSMUST00000186928 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gli1P47806 D5Ertd577e-201ENSMUST00000094593 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Olfr527-202ENSMUST00000214143 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Gm42531-201ENSMUST00000201648 4048 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Gtdc1-203ENSMUST00000112810 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Gm2223-201ENSMUST00000112099 1350 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Tbpl2-201ENSMUST00000080453 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Gm38128-201ENSMUST00000192085 3250 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Skap2-205ENSMUST00000204778 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Gm42715-201ENSMUST00000189629 12746 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Akap5-202ENSMUST00000154078 6685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Akap5-201ENSMUST00000095610 6687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Gm28322-201ENSMUST00000185627 1475 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Gm37721-202ENSMUST00000194673 1498 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Larp4-201ENSMUST00000057632 6527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Olfr535-204ENSMUST00000214296 5120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Gm43921-201ENSMUST00000204296 1792 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Olfr99-202ENSMUST00000216328 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gli1P47806 4930402F11Rik-204ENSMUST00000208612 1405 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Olfr537-ps1-201ENSMUST00000209871 2792 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Ccdc186-201ENSMUST00000076085 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Aftph-205ENSMUST00000146722 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gli1P47806 2610203C20Rik-206ENSMUST00000181814 2996 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Gm44901-201ENSMUST00000208157 3977 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Gm20826-202ENSMUST00000185348 4605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Igkv16-104-201ENSMUST00000103323 378 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Gm23440-201ENSMUST00000104299 130 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Gm17132-201ENSMUST00000109542 1158 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Gm16400-201ENSMUST00000116523 1029 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Gm13428-201ENSMUST00000117540 365 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Olfr1159-ps1-201ENSMUST00000117651 913 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Gm11624-201ENSMUST00000118579 1041 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Cabyr-203ENSMUST00000119108 818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Gm14294-201ENSMUST00000119749 751 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Gm12873-201ENSMUST00000119988 422 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Gm13593-201ENSMUST00000121329 692 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Gm13508-201ENSMUST00000121639 775 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Gm4789-201ENSMUST00000121708 1216 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Gm15959-201ENSMUST00000121724 368 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Gm13335-201ENSMUST00000129994 471 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Gm15218-201ENSMUST00000131006 618 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Gm7580-201ENSMUST00000132826 497 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Med9os-202ENSMUST00000139794 446 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gli1P47806 1700071G01Rik-201ENSMUST00000146728 367 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gli1P47806 A930041C12Rik-201ENSMUST00000149156 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Mir1945-201ENSMUST00000157919 78 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Gm16132-201ENSMUST00000159296 598 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Gm17085-201ENSMUST00000165425 502 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Mir5107-201ENSMUST00000175586 88 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Vmn2r-ps127-201ENSMUST00000175850 1029 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Vmn1r7-201ENSMUST00000176252 1219 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Gm20619-202ENSMUST00000176283 1085 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Gm21560-202ENSMUST00000177670 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Gm3642-202ENSMUST00000179296 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Gm5128-202ENSMUST00000180198 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Gm27252-201ENSMUST00000183782 689 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Ighv1-41-201ENSMUST00000194414 329 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Gm38039-201ENSMUST00000195328 443 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Gm43717-201ENSMUST00000198684 310 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Gm6657-204ENSMUST00000211288 1091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gli1P47806 AC140930.4-201ENSMUST00000220750 150 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Ctag2-201ENSMUST00000033524 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Sprr3-201ENSMUST00000058142 1222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Olfr732-201ENSMUST00000071208 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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Gli1P47806 Ear6-201ENSMUST00000074477 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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Gli1P47806 Olfr693-202ENSMUST00000215541 4015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Gm14781-201ENSMUST00000078469 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Mageb5-201ENSMUST00000082048 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Neto2-203ENSMUST00000209479 4936 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Gm14886-201ENSMUST00000117208 2629 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Tead1-202ENSMUST00000069256 9480 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Cd200r3-206ENSMUST00000114622 1339 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Sis-201ENSMUST00000094190 5887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Gria4-204ENSMUST00000212533 5207 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Olfr736-204ENSMUST00000215227 2485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gli1P47806 4930529C04Rik-201ENSMUST00000131367 3534 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Obox3-202ENSMUST00000095217 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Dclre1c-204ENSMUST00000115066 3828 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Olfr1305-202ENSMUST00000213405 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Gm9930-201ENSMUST00000066742 3151 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Vmn1r218-205ENSMUST00000227741 9624 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Gm44175-201ENSMUST00000204863 4256 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Mir711-201ENSMUST00000102188 82 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Ccdc7b-203ENSMUST00000108745 1047 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Gm14403-201ENSMUST00000108940 774 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Gm8424-201ENSMUST00000117716 988 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Gm13755-201ENSMUST00000118509 305 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Gm12387-201ENSMUST00000118573 955 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Gm11848-201ENSMUST00000121207 973 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Vmn1r-ps12-201ENSMUST00000176946 502 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Gm5947-201ENSMUST00000179156 714 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Rpl23a-ps12-201ENSMUST00000179178 468 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gli1P47806 Gm5645-201ENSMUST00000179597 714 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
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