Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Gm11485-201ENSMUST00000120048 1175 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Gm5660-201ENSMUST00000197453 1149 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Gm45008-201ENSMUST00000206420 493 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Chd1P40201 AC153938.2-201ENSMUST00000218388 580 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Ifngas1-201ENSMUST00000220034 1121 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Chd1P40201 AC156576.3-201ENSMUST00000221940 452 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Gm23464-201ENSMUST00000083145 147 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Cdh7-209ENSMUST00000172005 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Nudt12-201ENSMUST00000025065 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Nlrp10-201ENSMUST00000055745 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Dock7-202ENSMUST00000075836 6704 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Klhl24-201ENSMUST00000023509 6683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Chd1P40201 AC142245.1-201ENSMUST00000226611 1505 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Olfr569-202ENSMUST00000217024 4741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Olfr1500-205ENSMUST00000216287 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Gm2832-201ENSMUST00000172412 1760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Chd1P40201 AC183268.1-201ENSMUST00000215753 2837 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Cxcl11-202ENSMUST00000122808 3794 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Platr27-201ENSMUST00000131365 629 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Gm3077-201ENSMUST00000165903 627 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Vmn1r113-201ENSMUST00000168794 894 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Gm28543-201ENSMUST00000188986 509 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Gm43144-201ENSMUST00000198256 485 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Gm3912-203ENSMUST00000211024 367 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Olfr510-203ENSMUST00000216331 3101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Olfr980-202ENSMUST00000216463 3050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Prickle2-204ENSMUST00000113447 7679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Dsc1-202ENSMUST00000224432 4085 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Zfp667-202ENSMUST00000108562 3498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Sntg1-210ENSMUST00000191683 4510 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Gm37936-201ENSMUST00000194647 1322 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Gm10310-202ENSMUST00000213667 4661 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Chd1P40201 AC158232.1-201ENSMUST00000217882 2071 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Med12l-204ENSMUST00000164225 10264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Gm26075-201ENSMUST00000104062 121 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Gm17546-201ENSMUST00000168960 733 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Gm26219-201ENSMUST00000175216 71 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Gm27805-201ENSMUST00000184513 79 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Gm7449-201ENSMUST00000194393 663 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Gm4734-201ENSMUST00000200117 777 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Gm44079-201ENSMUST00000204889 529 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Chd1P40201 4930470O06Rik-201ENSMUST00000209438 662 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Chd1P40201 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Art2b-201ENSMUST00000063920 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Olfr542-ps1-202ENSMUST00000218525 4039 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Zfp619-201ENSMUST00000108015 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Gm37764-201ENSMUST00000194664 2150 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Ryr1-208ENSMUST00000214374 15300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Frrs1-202ENSMUST00000195905 6823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Olfr726-206ENSMUST00000217025 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Olfr1160-202ENSMUST00000215457 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Chd1P40201 AC121870.1-201ENSMUST00000216279 4879 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Nfia-201ENSMUST00000052018 9249 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Kcnj16-202ENSMUST00000106636 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Olfr1081-ps1-201ENSMUST00000120210 945 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Gm14710-201ENSMUST00000146082 1066 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Gm24751-201ENSMUST00000157844 102 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Gm24931-201ENSMUST00000158324 107 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Vmn1r-ps21-201ENSMUST00000176891 925 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Gm37636-201ENSMUST00000193583 359 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Gm4574-201ENSMUST00000207804 542 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Chd1P40201 CT009600.2-201ENSMUST00000226638 481 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Apcs-201ENSMUST00000027824 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Prss58-201ENSMUST00000063523 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Chd1P40201 F13a1-201ENSMUST00000037491 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Akr1c19-202ENSMUST00000118663 5832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Gramd1b-204ENSMUST00000121357 7334 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Pramel3-201ENSMUST00000113176 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Chd1P40201 4930528J11Rik-201ENSMUST00000201689 3611 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Sult6b1-204ENSMUST00000169544 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Ugt2b5-201ENSMUST00000067790 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Gm44224-201ENSMUST00000204131 1463 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Gm45183-201ENSMUST00000207937 1497 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Chd1P40201 2900079G21Rik-202ENSMUST00000144424 2944 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Slc22a27-202ENSMUST00000182102 1801 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Gm23294-201ENSMUST00000104150 164 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Gm44474-201ENSMUST00000196525 127 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Gm43968-201ENSMUST00000203388 389 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Gm44871-201ENSMUST00000207821 497 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Olfr562-ps1-201ENSMUST00000210779 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Chd1P40201 AC164087.1-201ENSMUST00000215174 733 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Gm46998-201ENSMUST00000221444 330 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Chd1P40201 AC131997.2-201ENSMUST00000227452 362 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Olfr564-201ENSMUST00000061096 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Gm26330-201ENSMUST00000082817 104 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Impact-201ENSMUST00000025290 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Chd1P40201 St18-204ENSMUST00000131494 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Btbd35f12-201ENSMUST00000178827 1908 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Tulp4-201ENSMUST00000039655 9687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Gm42715-201ENSMUST00000189629 12746 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Kcnj15-201ENSMUST00000037154 5089 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Olfr860-201ENSMUST00000086482 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Etl4-209ENSMUST00000114627 7413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Onecut2-201ENSMUST00000115145 13389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Onecut2-202ENSMUST00000175965 13391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Dock7-205ENSMUST00000127417 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Gm16106-201ENSMUST00000119187 294 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Chd1P40201 Pagr1a-201ENSMUST00000162069 422 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
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