Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Olfr328-203ENSMUST00000215717 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RxraP28700 Esp31-201ENSMUST00000174742 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm42923-201ENSMUST00000198438 2896 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm7233-201ENSMUST00000168619 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RxraP28700 Olfr721-ps1-203ENSMUST00000215479 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RxraP28700 Lrrc39-201ENSMUST00000029573 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RxraP28700 AW046200-203ENSMUST00000211787 2479 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RxraP28700 Lin7c-201ENSMUST00000028583 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RxraP28700 Ptprq-201ENSMUST00000050702 7393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm15402-201ENSMUST00000114051 670 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm11826-201ENSMUST00000118781 438 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RxraP28700 H3f3c-201ENSMUST00000119459 411 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RxraP28700 Xlr3e-ps-201ENSMUST00000119644 682 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm14620-201ENSMUST00000120656 383 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm14383-201ENSMUST00000121637 386 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RxraP28700 Xlr3d-ps-201ENSMUST00000121687 658 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm26254-201ENSMUST00000122491 118 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm16126-201ENSMUST00000126025 589 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm26352-201ENSMUST00000158223 125 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm22326-201ENSMUST00000158897 351 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm25445-201ENSMUST00000158996 299 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm3170-201ENSMUST00000168753 850 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm3348-201ENSMUST00000177813 850 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm28238-201ENSMUST00000188102 383 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RxraP28700 1700031M16Rik-206ENSMUST00000191037 711 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RxraP28700 2610509F24Rik-201ENSMUST00000193035 838 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm37021-201ENSMUST00000195835 663 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RxraP28700 4930519L02Rik-202ENSMUST00000200254 452 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm42926-201ENSMUST00000200496 697 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm43501-201ENSMUST00000202513 107 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm44281-201ENSMUST00000203090 166 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm44615-201ENSMUST00000206548 358 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm45034-201ENSMUST00000206831 482 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RxraP28700 Olfr367-ps-203ENSMUST00000213819 541 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RxraP28700 CU024910.1-201ENSMUST00000214310 418 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RxraP28700 Camta1-213ENSMUST00000214673 243 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RxraP28700 1700048P04Rik-201ENSMUST00000219825 369 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm8613-201ENSMUST00000220383 1077 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RxraP28700 AL671874.1-201ENSMUST00000223746 1123 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RxraP28700 AC174797.4-201ENSMUST00000225510 347 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RxraP28700 AC154627.3-201ENSMUST00000228441 334 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RxraP28700 AC164295.2-201ENSMUST00000228539 757 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RxraP28700 Clec2d-201ENSMUST00000032260 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RxraP28700 Cd200r3-201ENSMUST00000048479 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm6863-201ENSMUST00000052882 636 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RxraP28700 Olfr714-201ENSMUST00000054629 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RxraP28700 Wfdc15a-201ENSMUST00000063251 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RxraP28700 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RxraP28700 2700062C07Rik-201ENSMUST00000097646 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RxraP28700 Olfr661-201ENSMUST00000098168 964 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RxraP28700 Tnfrsf26-201ENSMUST00000055723 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm45415-201ENSMUST00000209644 2074 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RxraP28700 Vmn1r71-210ENSMUST00000228561 4747 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm16185-201ENSMUST00000125071 3207 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RxraP28700 AC117608.2-201ENSMUST00000224124 1363 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RxraP28700 Olfr487-202ENSMUST00000216489 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm44000-201ENSMUST00000205038 1478 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RxraP28700 Olfr329-ps-203ENSMUST00000219448 4052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RxraP28700 Atf2-207ENSMUST00000112017 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RxraP28700 Pum2-201ENSMUST00000020915 3587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RxraP28700 Ktn1-207ENSMUST00000186761 3902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RxraP28700 Vmn1r185-209ENSMUST00000228133 5749 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RxraP28700 Dsc1-201ENSMUST00000038710 3775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RxraP28700 Wnk3-206ENSMUST00000184730 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RxraP28700 Erbin-204ENSMUST00000169083 5435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RxraP28700 Ssxb10-201ENSMUST00000103003 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RxraP28700 Igkv16-104-201ENSMUST00000103323 378 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm12788-201ENSMUST00000119090 308 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RxraP28700 Olfr1298-201ENSMUST00000119566 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm14472-201ENSMUST00000119815 282 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm12587-201ENSMUST00000120180 427 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm15044-201ENSMUST00000120703 598 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RxraP28700 1700019G24Rik-201ENSMUST00000130004 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RxraP28700 Platr27-201ENSMUST00000131365 629 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RxraP28700 Ptprtos-201ENSMUST00000151688 630 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm22339-201ENSMUST00000157718 62 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm23224-201ENSMUST00000158122 271 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm18199-201ENSMUST00000173820 835 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm22392-201ENSMUST00000177971 107 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm2877-201ENSMUST00000178248 1204 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm8324-201ENSMUST00000178911 1204 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm3696-202ENSMUST00000179898 612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RxraP28700 Tceanc-203ENSMUST00000180322 1080 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm29664-201ENSMUST00000191125 463 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm28792-201ENSMUST00000191482 419 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm18547-201ENSMUST00000192439 811 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm18553-201ENSMUST00000194152 634 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm18952-201ENSMUST00000194471 846 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RxraP28700 Asb17os-202ENSMUST00000200329 497 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm44091-201ENSMUST00000205212 649 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm19761-201ENSMUST00000205372 391 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm30928-202ENSMUST00000206881 271 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RxraP28700 Cers3-202ENSMUST00000208521 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm17988-201ENSMUST00000208796 535 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RxraP28700 Olfr1115-204ENSMUST00000217196 2109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RxraP28700 4930543I11Rik-201ENSMUST00000219006 959 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RxraP28700 3110043J17Rik-201ENSMUST00000219153 760 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RxraP28700 AC155922.1-201ENSMUST00000220100 373 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RxraP28700 Prl2c2-203ENSMUST00000221612 596 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms