Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Olfr1337-201ENSMUST00000077247 951 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
TP20293 Olfr1359-201ENSMUST00000077843 991 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
TP20293 Magea1-201ENSMUST00000078193 1108 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
TP20293 Gm23407-201ENSMUST00000082538 91 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TP20293 Mir331-201ENSMUST00000083673 96 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TP20293 Defa23-201ENSMUST00000098899 411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TP20293 4930444F02Rik-201ENSMUST00000215429 6871 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TP20293 Adam5-205ENSMUST00000209935 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TP20293 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TP20293 Lrrc9-206ENSMUST00000162159 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TP20293 Clec4a2-202ENSMUST00000041779 2481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TP20293 Gm2099-202ENSMUST00000223310 3341 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TP20293 Zfp967-202ENSMUST00000178443 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
TP20293 Zfp969-203ENSMUST00000179061 1458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
TP20293 Gm13089-201ENSMUST00000073532 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TP20293 Pum2-210ENSMUST00000169089 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TP20293 Ktn1-216ENSMUST00000189533 3941 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TP20293 Tfec-201ENSMUST00000031533 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TP20293 Olfr684-202ENSMUST00000215552 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TP20293 Olfr684-204ENSMUST00000217136 3182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TP20293 AC155941.5-201ENSMUST00000218925 1505 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TP20293 Dctn4-201ENSMUST00000025505 3738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TP20293 Gm43567-201ENSMUST00000197581 1978 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TP20293 Olfr47-202ENSMUST00000215569 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TP20293 Gm22370-201ENSMUST00000102422 83 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TP20293 Igkv4-92-201ENSMUST00000103332 351 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TP20293 Ighv1-20-201ENSMUST00000103506 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TP20293 Gm13103-202ENSMUST00000105768 994 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TP20293 Macrod2-203ENSMUST00000110061 887 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TP20293 Cd200r3-204ENSMUST00000114612 731 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TP20293 Rps11-ps3-201ENSMUST00000117608 486 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TP20293 Gm13189-201ENSMUST00000138462 252 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TP20293 4930547E08Rik-201ENSMUST00000143559 541 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TP20293 Gm11636-201ENSMUST00000152172 774 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TP20293 Gm25430-201ENSMUST00000157614 289 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TP20293 Gm25432-201ENSMUST00000158284 66 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TP20293 Gm20519-201ENSMUST00000173684 359 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TP20293 Pkib-209ENSMUST00000177325 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TP20293 Esp38-201ENSMUST00000178880 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TP20293 Gm21971-201ENSMUST00000180187 337 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TP20293 Pafah1b1-ps1-201ENSMUST00000181263 1046 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TP20293 1700028M03Rik-201ENSMUST00000185938 476 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TP20293 Gm28943-201ENSMUST00000186187 615 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TP20293 Gm28736-201ENSMUST00000186257 615 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TP20293 Gm29401-201ENSMUST00000186690 615 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TP20293 Gm29178-204ENSMUST00000186784 615 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TP20293 Gm28589-201ENSMUST00000186991 615 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TP20293 Gm28936-201ENSMUST00000187153 615 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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TP20293 1700072G22Rik-201ENSMUST00000189460 548 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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TP20293 Gm44969-201ENSMUST00000207829 549 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TP20293 4930505K13Rik-201ENSMUST00000208641 546 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TP20293 Gm33178-201ENSMUST00000212090 257 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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TP20293 Gm272-201ENSMUST00000222073 919 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TP20293 AC159263.3-201ENSMUST00000223434 460 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TP20293 Serpinb3d-201ENSMUST00000023861 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TP20293 Lcn4-201ENSMUST00000028283 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TP20293 Cd200r3-201ENSMUST00000048479 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TP20293 Dppa3-201ENSMUST00000049644 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TP20293 2310079G19Rik-201ENSMUST00000052337 881 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TP20293 Tas2r130-201ENSMUST00000067597 1090 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TP20293 Olfr488-201ENSMUST00000072968 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TP20293 Cd200r3-202ENSMUST00000077178 767 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TP20293 n-R5s36-201ENSMUST00000082998 119 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TP20293 Defa-ps18-201ENSMUST00000098889 371 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TP20293 Gm10794-201ENSMUST00000099624 207 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TP20293 Zfp182-202ENSMUST00000115333 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TP20293 Nlgn1-202ENSMUST00000108308 4272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TP20293 Olfr578-202ENSMUST00000215606 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TP20293 Gm37268-201ENSMUST00000192254 2614 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TP20293 Btbd35f21-201ENSMUST00000105017 1943 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TP20293 Btbd35f27-201ENSMUST00000178143 1943 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TP20293 Btbd35f2-201ENSMUST00000179991 1949 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TP20293 Btbd35f16-201ENSMUST00000185755 1949 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TP20293 Olfr1000-203ENSMUST00000216571 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TP20293 Ank2-207ENSMUST00000182064 12413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TP20293 Olfr947-ps1-201ENSMUST00000214075 2165 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TP20293 Gm42600-201ENSMUST00000202081 3588 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TP20293 Lpar4-201ENSMUST00000060576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
TP20293 Gm19035-201ENSMUST00000193299 1742 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TP20293 Olfr372-202ENSMUST00000215324 3542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TP20293 Tsga10-207ENSMUST00000155852 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
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