Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Gm4724-202ENSMUST00000109046 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm4631-201ENSMUST00000109050 1494 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm14434-203ENSMUST00000122097 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm11007-202ENSMUST00000178120 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm2007-202ENSMUST00000178133 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm11007-203ENSMUST00000185834 1494 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm2007-203ENSMUST00000189494 1494 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm45762-201ENSMUST00000212863 2619 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm20276-201ENSMUST00000216122 2648 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Cd200r4-202ENSMUST00000176321 2005 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 A730009L09Rik-201ENSMUST00000209558 2512 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Phf6-202ENSMUST00000101587 3639 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm12292-201ENSMUST00000122911 2433 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Pcdh15-205ENSMUST00000105429 6719 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Olfr1444-202ENSMUST00000213606 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Soat1-201ENSMUST00000051396 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Tpm3-rs2-201ENSMUST00000116350 323 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm14580-201ENSMUST00000119122 718 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 4930448K20Rik-201ENSMUST00000120570 998 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm15750-201ENSMUST00000120970 616 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm23867-201ENSMUST00000122649 274 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 1700061F12Rik-201ENSMUST00000132414 876 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm14272-201ENSMUST00000133525 484 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm13598-201ENSMUST00000147939 625 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm22236-201ENSMUST00000157093 106 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm24901-201ENSMUST00000158125 110 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm25244-201ENSMUST00000178089 132 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm23619-201ENSMUST00000178411 94 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm25474-201ENSMUST00000179052 94 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm22047-201ENSMUST00000179176 94 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm25873-201ENSMUST00000180317 107 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Rian-214ENSMUST00000183026 596 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm27599-201ENSMUST00000183758 174 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Obox8-201ENSMUST00000184356 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 2310043O21Rik-201ENSMUST00000185323 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm44162-201ENSMUST00000203543 544 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Olfr717-ps1-201ENSMUST00000205589 556 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm45700-201ENSMUST00000205866 347 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm17780-201ENSMUST00000207142 612 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 AC158630.1-201ENSMUST00000214387 993 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 AC108846.4-201ENSMUST00000216783 341 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 AC131677.1-201ENSMUST00000218721 535 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 4930556N09Rik-202ENSMUST00000219466 1015 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 AC150661.1-201ENSMUST00000222563 495 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm2139-201ENSMUST00000222569 1075 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 AC155241.1-201ENSMUST00000222709 415 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 AC125539.2-201ENSMUST00000228339 753 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gmfg-201ENSMUST00000078845 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Olfr1024-201ENSMUST00000099912 984 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm38381-201ENSMUST00000193594 2275 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Zim1-201ENSMUST00000002336 7693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm12021-201ENSMUST00000121061 1746 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Meg3-209ENSMUST00000146701 14548 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Ezh1-203ENSMUST00000107285 4193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm37169-201ENSMUST00000195599 4161 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gbp3-202ENSMUST00000106221 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 4930595M18Rik-201ENSMUST00000080083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Mbd3l2-202ENSMUST00000213777 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm6818-201ENSMUST00000190556 2558 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Cylc2-201ENSMUST00000041392 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Olfr338-201ENSMUST00000072114 5780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Zfp748-202ENSMUST00000181892 5293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 D930016D06Rik-202ENSMUST00000181620 3805 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 4933430A20Rik-201ENSMUST00000210943 1558 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 AC129085.2-201ENSMUST00000223763 2800 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Igsf10-203ENSMUST00000194546 8393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm14929-201ENSMUST00000152079 1850 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm3772-201ENSMUST00000221404 1887 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Olfr1056-202ENSMUST00000216547 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm37685-201ENSMUST00000193507 2177 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Acpp-201ENSMUST00000062723 4483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm20707-201ENSMUST00000176201 2516 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Ap1g1-201ENSMUST00000034171 3692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm12290-201ENSMUST00000145095 2112 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Taf1-201ENSMUST00000101341 8054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Pcsk1-201ENSMUST00000022075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm36660-201ENSMUST00000218323 3871 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm156-202ENSMUST00000118532 2000 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm15093-201ENSMUST00000179021 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm22374-201ENSMUST00000104583 132 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm14733-201ENSMUST00000117680 133 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm13983-201ENSMUST00000118018 865 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm14159-201ENSMUST00000119832 451 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm13483-201ENSMUST00000123699 664 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm13807-201ENSMUST00000137073 1295 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Rpl39-ps-201ENSMUST00000142604 355 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm13322-201ENSMUST00000152803 246 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm25722-201ENSMUST00000157498 279 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm25550-201ENSMUST00000158079 128 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm23891-201ENSMUST00000158114 138 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm25717-201ENSMUST00000158631 353 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Ear-ps9-201ENSMUST00000161963 460 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm20519-201ENSMUST00000173684 359 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm25451-201ENSMUST00000177832 121 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Gm2056J3QQ02 Gm28023-201ENSMUST00000184556 60 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms