Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Gm26715-201ENSMUST00000181676 1095 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Trav15d-1-dv6d-1-202ENSMUST00000186370 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Scgb1b4-ps-201ENSMUST00000186920 271 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Gm28501-201ENSMUST00000188729 421 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Gm28777-201ENSMUST00000191402 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Gm37979-201ENSMUST00000193065 712 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Gm7142-201ENSMUST00000194232 586 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Gm37477-201ENSMUST00000195215 884 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Ighv5-3-201ENSMUST00000195336 322 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Gm36985-201ENSMUST00000195595 379 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Gm42707-201ENSMUST00000196620 322 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Igkv12-67-201ENSMUST00000197806 354 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Gm3970-201ENSMUST00000198001 334 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Gm5284-201ENSMUST00000199053 903 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Gm44225-201ENSMUST00000203582 186 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Gm20426-202ENSMUST00000204789 399 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Gm44212-201ENSMUST00000205016 897 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 1700093K21Rik-201ENSMUST00000020527 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Gm44969-201ENSMUST00000207829 549 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Gm9375-201ENSMUST00000208899 903 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 AC112680.2-201ENSMUST00000213119 595 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 AC123944.2-201ENSMUST00000215290 382 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 AC157085.1-201ENSMUST00000216343 162 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Prl7d1-201ENSMUST00000021776 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 AC167222.2-201ENSMUST00000220014 295 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 AC134537.3-201ENSMUST00000220154 503 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Gm9088-201ENSMUST00000220237 508 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Gm33312-201ENSMUST00000222443 332 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Gm5160-201ENSMUST00000069552 444 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Olfr1014-201ENSMUST00000076250 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Mir3068-201ENSMUST00000083004 136 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Olfr859-201ENSMUST00000086480 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Olfr598-201ENSMUST00000098202 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Olfr568-201ENSMUST00000098216 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Bnip3l-202ENSMUST00000111115 3259 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Gm42507-201ENSMUST00000201187 2555 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 A830019P07Rik-201ENSMUST00000178904 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Gm37926-201ENSMUST00000191922 2424 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Olfr1226-203ENSMUST00000215562 2669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Cntn3-202ENSMUST00000203619 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Gm38142-201ENSMUST00000194093 3555 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Zfp35-201ENSMUST00000074941 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Gm10165-201ENSMUST00000217666 2380 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Cd200r3-208ENSMUST00000164007 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Gm44000-201ENSMUST00000205038 1478 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Ptprd-201ENSMUST00000050757 4698 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Olfr145-201ENSMUST00000086062 6796 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Dopey1-201ENSMUST00000034987 8933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Hrnr-201ENSMUST00000090856 10656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Olfr127-202ENSMUST00000217223 3733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Kcnma1-202ENSMUST00000074983 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Zfp850-202ENSMUST00000180024 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Gm26764-201ENSMUST00000181175 2596 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Homer1-203ENSMUST00000080127 3052 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Trmt10a-206ENSMUST00000162864 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Gm15478-201ENSMUST00000145914 2172 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Serpinb3c-201ENSMUST00000027565 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Trmt10a-201ENSMUST00000040321 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Gm9972-201ENSMUST00000069051 1533 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Adam7-201ENSMUST00000022640 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Prom1-205ENSMUST00000165909 4089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Olfr393-201ENSMUST00000102523 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Gm11914-201ENSMUST00000117094 507 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Gm15382-201ENSMUST00000118011 537 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Gm8855-201ENSMUST00000118888 878 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Olfr626-ps1-201ENSMUST00000121147 318 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Apol7d-203ENSMUST00000126516 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Gm6081-201ENSMUST00000134472 489 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Gm13189-201ENSMUST00000138462 252 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Gm12409-201ENSMUST00000147231 646 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Gm15956-201ENSMUST00000153352 502 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Gm23896-201ENSMUST00000158109 130 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Gm20506-201ENSMUST00000172952 589 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Gm21560-202ENSMUST00000177670 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Mup-ps7-201ENSMUST00000178292 545 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Mup-ps8-201ENSMUST00000178663 545 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Mup-ps9-201ENSMUST00000178847 545 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Gm3642-202ENSMUST00000179296 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Mup-ps6-201ENSMUST00000179564 545 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Il18-202ENSMUST00000180021 702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 D630011A20Rik-201ENSMUST00000180858 500 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Mir6238-201ENSMUST00000184140 129 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 1810053B23Rik-201ENSMUST00000185242 634 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Gm3605-201ENSMUST00000185858 440 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Gm21294-201ENSMUST00000186443 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 1700108F19Rik-203ENSMUST00000188798 619 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Gm29341-201ENSMUST00000190179 370 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Olfr625-ps1-202ENSMUST00000190218 927 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Olfr258-ps1-201ENSMUST00000192471 891 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Ighv1-41-201ENSMUST00000194414 329 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Gm42457-201ENSMUST00000197572 367 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Gm42865-201ENSMUST00000197981 613 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Gm18327-201ENSMUST00000202426 830 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Gm45240-201ENSMUST00000211437 674 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Gm45473-201ENSMUST00000211452 616 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Gm38574-201ENSMUST00000211855 640 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 CAAA01216754.4-202ENSMUST00000215276 610 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 4930567K20Rik-203ENSMUST00000220108 646 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
H2-M5A7VMS3 Gm18628-201ENSMUST00000220584 475 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
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