Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Vmn1r201-203ENSMUST00000226965 4741 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pramef12Q9D2F1 Cldn34b4-201ENSMUST00000101419 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pramef12Q9D2F1 Gm23274-201ENSMUST00000104056 130 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pramef12Q9D2F1 Gm15018-201ENSMUST00000117090 633 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pramef12Q9D2F1 Gm12131-201ENSMUST00000117479 359 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pramef12Q9D2F1 Gm11270-201ENSMUST00000117685 471 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pramef12Q9D2F1 Vmn1r-ps95-201ENSMUST00000118641 903 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pramef12Q9D2F1 Gm11699-201ENSMUST00000119016 401 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pramef12Q9D2F1 Gm15103-201ENSMUST00000119893 871 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pramef12Q9D2F1 Olfr637-ps1-201ENSMUST00000120386 471 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pramef12Q9D2F1 n-R5s24-201ENSMUST00000122518 117 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pramef12Q9D2F1 Gm12127-201ENSMUST00000123278 706 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pramef12Q9D2F1 Gm25655-201ENSMUST00000158465 290 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pramef12Q9D2F1 1700006F04Rik-201ENSMUST00000188582 441 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pramef12Q9D2F1 1700074H08Rik-201ENSMUST00000189831 555 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pramef12Q9D2F1 Gm37533-201ENSMUST00000193848 545 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pramef12Q9D2F1 Gm17952-201ENSMUST00000193914 747 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pramef12Q9D2F1 Gm42567-201ENSMUST00000199268 352 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pramef12Q9D2F1 Tsg101-ps-201ENSMUST00000201023 1170 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pramef12Q9D2F1 Gm18193-201ENSMUST00000210017 772 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pramef12Q9D2F1 4930401A07Rik-201ENSMUST00000214657 746 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pramef12Q9D2F1 2010107E04Rik-201ENSMUST00000021719 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pramef12Q9D2F1 AC153505.2-201ENSMUST00000217741 277 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pramef12Q9D2F1 AC153840.1-201ENSMUST00000219685 313 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pramef12Q9D2F1 AC161252.2-201ENSMUST00000224978 374 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pramef12Q9D2F1 Stfa2-201ENSMUST00000023619 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pramef12Q9D2F1 Glipr1l1-201ENSMUST00000073617 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pramef12Q9D2F1 Vaultrc5-201ENSMUST00000083211 143 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pramef12Q9D2F1 Olfr640-201ENSMUST00000084799 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pramef12Q9D2F1 Gm10471-201ENSMUST00000094946 2967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pramef12Q9D2F1 Ralgapa2-202ENSMUST00000109986 11030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pramef12Q9D2F1 Ezh1-201ENSMUST00000100417 3636 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pramef12Q9D2F1 Gm14886-201ENSMUST00000117208 2629 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pramef12Q9D2F1 Jade3-201ENSMUST00000043693 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pramef12Q9D2F1 Olfr380-202ENSMUST00000121209 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pramef12Q9D2F1 Rsrc2-210ENSMUST00000182489 1665 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pramef12Q9D2F1 9630002D21Rik-202ENSMUST00000222033 2345 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pramef12Q9D2F1 Angel2-201ENSMUST00000027947 3562 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pramef12Q9D2F1 Slc22a29-201ENSMUST00000113298 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pramef12Q9D2F1 Kynu-203ENSMUST00000112826 1587 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pramef12Q9D2F1 Rbm41-201ENSMUST00000033810 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pramef12Q9D2F1 Ktn1-203ENSMUST00000185940 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pramef12Q9D2F1 Ktn1-208ENSMUST00000187039 3875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pramef12Q9D2F1 6820402A03Rik-201ENSMUST00000194648 2654 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pramef12Q9D2F1 Zfp280d-201ENSMUST00000098576 4387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pramef12Q9D2F1 Setd2-201ENSMUST00000153838 8350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pramef12Q9D2F1 Gm13544-201ENSMUST00000131189 2940 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pramef12Q9D2F1 Cpne4-202ENSMUST00000077190 3409 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pramef12Q9D2F1 Impg1-201ENSMUST00000085289 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pramef12Q9D2F1 Trbv3-201ENSMUST00000103264 455 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pramef12Q9D2F1 Gm22488-201ENSMUST00000116811 127 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pramef12Q9D2F1 Gm11366-201ENSMUST00000119279 429 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pramef12Q9D2F1 Gm6884-201ENSMUST00000119318 615 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pramef12Q9D2F1 Gm14434-201ENSMUST00000120521 559 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pramef12Q9D2F1 Gm12978-201ENSMUST00000121250 522 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pramef12Q9D2F1 Gm24628-201ENSMUST00000122761 289 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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Pramef12Q9D2F1 Vmn1r60-201ENSMUST00000173782 1007 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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Pramef12Q9D2F1 C130060C02Rik-201ENSMUST00000181731 1142 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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Pramef12Q9D2F1 Gm19029-201ENSMUST00000189923 564 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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Pramef12Q9D2F1 RMST_1.1-205ENSMUST00000218060 997 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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Pramef12Q9D2F1 AC123534.1-201ENSMUST00000224060 656 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pramef12Q9D2F1 Vmn1r54-201ENSMUST00000058039 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pramef12Q9D2F1 Gm23626-201ENSMUST00000082458 133 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pramef12Q9D2F1 Olfr328-203ENSMUST00000215717 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pramef12Q9D2F1 Zfp606-205ENSMUST00000209403 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pramef12Q9D2F1 Olfr635-202ENSMUST00000209473 8565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pramef12Q9D2F1 Hnmt-201ENSMUST00000051416 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pramef12Q9D2F1 Tbl1xr1-201ENSMUST00000063988 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pramef12Q9D2F1 Sh2d1b1-201ENSMUST00000179976 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pramef12Q9D2F1 Gm17101-201ENSMUST00000169520 1588 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Pramef12Q9D2F1 AC115910.1-201ENSMUST00000221188 4275 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Pramef12Q9D2F1 Gm43000-201ENSMUST00000198482 3343 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Pramef12Q9D2F1 Mrgprb1-201ENSMUST00000094384 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Pramef12Q9D2F1 Gm43567-201ENSMUST00000197581 1978 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Pramef12Q9D2F1 Med13-201ENSMUST00000043624 10546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Pramef12Q9D2F1 Hspa9-ps1-201ENSMUST00000119602 1933 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Pramef12Q9D2F1 Gm5946-202ENSMUST00000182652 2724 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pramef12Q9D2F1 Dram2-201ENSMUST00000029507 1891 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pramef12Q9D2F1 Pirb-201ENSMUST00000078451 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pramef12Q9D2F1 Olfr390-202ENSMUST00000120081 3604 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pramef12Q9D2F1 Ankar-203ENSMUST00000212573 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pramef12Q9D2F1 Nusap1-201ENSMUST00000028771 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pramef12Q9D2F1 Nlrp9a-203ENSMUST00000117252 2796 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms