Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Mmp1a-202ENSMUST00000217651 2011 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm43313-201ENSMUST00000201398 2235 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps102-201ENSMUST00000222577 2203 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Pou2f1-208ENSMUST00000160260 13022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Slamf7-203ENSMUST00000192195 3975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Vmn2r112-201ENSMUST00000097381 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Evi2-202ENSMUST00000170422 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Fat1-206ENSMUST00000215588 13938 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm29506-201ENSMUST00000191045 2078 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Olfr391-ps-201ENSMUST00000214485 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Olfr181-204ENSMUST00000205986 1891 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 C130073E24Rik-202ENSMUST00000211313 14112 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm19301-201ENSMUST00000174283 2210 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Ino80d-205ENSMUST00000165066 13529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm28394-201ENSMUST00000186805 1495 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm28570-201ENSMUST00000188300 1495 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Olfr738-203ENSMUST00000214853 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm20342-201ENSMUST00000185480 9720 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Cldn34b4-201ENSMUST00000101419 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm24230-201ENSMUST00000104313 129 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm14560-201ENSMUST00000118672 375 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm7657-201ENSMUST00000118851 666 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm11805-201ENSMUST00000121238 600 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 n-R5s174-201ENSMUST00000122638 121 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 n-R5s21-201ENSMUST00000122692 117 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Mir1963-201ENSMUST00000158594 59 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 B230216N24Rik-204ENSMUST00000161661 719 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm20523-201ENSMUST00000174340 1124 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm4221-201ENSMUST00000181538 1232 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Serpinb10-202ENSMUST00000182198 1265 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm34882-201ENSMUST00000193245 974 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm37173-201ENSMUST00000194498 1017 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm32051-201ENSMUST00000196818 709 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm31510-202ENSMUST00000206795 239 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm45524-201ENSMUST00000211374 1250 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 AC157515.1-201ENSMUST00000220953 450 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 CT485612.3-201ENSMUST00000222179 408 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Trmt2b-201ENSMUST00000087540 822 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Mir199a-2-201ENSMUST00000093618 110 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Foxr2-201ENSMUST00000096265 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Fmo2-201ENSMUST00000045902 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Olfr1191-ps1-202ENSMUST00000217379 5933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Btf3l4-204ENSMUST00000102742 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Rmi1-204ENSMUST00000225815 2447 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Vmn1r197-203ENSMUST00000227017 5158 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Acer3-201ENSMUST00000033020 11340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Phyhipl-206ENSMUST00000162251 1540 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Olfr1286-203ENSMUST00000213210 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Abcg3-201ENSMUST00000031239 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Zfand6-201ENSMUST00000069537 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Nlrp9b-201ENSMUST00000073151 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Hgf-201ENSMUST00000030683 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Olfr1138-202ENSMUST00000214573 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm45324-201ENSMUST00000211193 5638 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm21637-201ENSMUST00000105124 778 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Ppih-202ENSMUST00000106317 613 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Spin2d-201ENSMUST00000114517 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm8595-201ENSMUST00000118250 630 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm14601-201ENSMUST00000120892 236 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm14302-201ENSMUST00000122806 382 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gtsf1-202ENSMUST00000123724 747 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 1700007M16Rik-201ENSMUST00000129075 435 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gtsf1-204ENSMUST00000136480 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm5699-201ENSMUST00000152491 723 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm23115-201ENSMUST00000158480 108 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm22326-201ENSMUST00000158897 351 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Rpl9-ps9-201ENSMUST00000173020 573 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Mir3080-201ENSMUST00000175010 79 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm27688-201ENSMUST00000183634 91 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm18728-201ENSMUST00000186155 753 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm28863-201ENSMUST00000186888 431 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm28567-201ENSMUST00000190270 693 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm28467-201ENSMUST00000190981 318 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm37381-201ENSMUST00000192427 899 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm37700-201ENSMUST00000192617 965 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm9134-201ENSMUST00000193186 551 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm37044-201ENSMUST00000193531 693 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm38369-201ENSMUST00000195101 693 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Tprkb-208ENSMUST00000200680 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Olfr588-ps1-202ENSMUST00000210115 912 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm45422-201ENSMUST00000211476 246 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm21041-201ENSMUST00000214829 823 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 AC164576.1-201ENSMUST00000218783 693 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 AC165164.1-202ENSMUST00000219324 649 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm3800-201ENSMUST00000221086 554 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 AC174797.2-203ENSMUST00000224017 716 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Lcn4-201ENSMUST00000028283 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Dppa3-201ENSMUST00000049644 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Map9-206ENSMUST00000195640 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Gm13919-202ENSMUST00000140238 1552 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Dsc1-201ENSMUST00000038710 3775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Mageb16-202ENSMUST00000114016 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Tinag-201ENSMUST00000034911 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 1700022I11Rik-201ENSMUST00000030163 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Fam26d-201ENSMUST00000048052 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Vmn1r204-202ENSMUST00000228195 2936 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Cpa2-201ENSMUST00000096066 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Ncoa7-202ENSMUST00000092610 2590 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 CT025710.1-201ENSMUST00000222949 2533 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc47Q9D024 Glcci1-206ENSMUST00000162567 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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