Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gm12077-201ENSMUST00000117049 364 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Gm13087-201ENSMUST00000118298 256 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Gm12442-201ENSMUST00000118372 338 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 A730017C20Rik-203ENSMUST00000118510 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
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Usp48Q3V0C5 Gm14238-201ENSMUST00000120227 323 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Gm15801-201ENSMUST00000120920 522 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Gm15237-201ENSMUST00000122104 469 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Gm12368-201ENSMUST00000122251 434 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
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Usp48Q3V0C5 Gm4128-201ENSMUST00000154338 461 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Gm23228-201ENSMUST00000157296 270 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Gm22724-201ENSMUST00000158091 127 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Gm8783-201ENSMUST00000159764 522 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Gm3111-201ENSMUST00000167426 490 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
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Usp48Q3V0C5 Gm29563-201ENSMUST00000187249 496 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
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Usp48Q3V0C5 Gm28502-201ENSMUST00000189781 476 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Gm28777-201ENSMUST00000191402 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Gm38084-201ENSMUST00000193488 437 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Gm37865-201ENSMUST00000194996 437 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Gm9632-201ENSMUST00000195934 643 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Gm43007-201ENSMUST00000197618 291 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
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Usp48Q3V0C5 Gm44813-201ENSMUST00000207921 361 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
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Usp48Q3V0C5 AC158392.2-201ENSMUST00000225402 969 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 AC113198.1-201ENSMUST00000226353 832 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Olfr459-201ENSMUST00000050412 1109 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Gm5341-201ENSMUST00000058881 489 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Zfp993-201ENSMUST00000070932 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
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Usp48Q3V0C5 Gm28392-201ENSMUST00000077630 393 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Ifitm6-201ENSMUST00000081924 663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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Usp48Q3V0C5 Gm10256-202ENSMUST00000188114 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Gm21708-203ENSMUST00000190283 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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Usp48Q3V0C5 5830405F06Rik-201ENSMUST00000192753 1755 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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Usp48Q3V0C5 Spin2d-201ENSMUST00000114517 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
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Usp48Q3V0C5 Il2ra-202ENSMUST00000150890 1013 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
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Usp48Q3V0C5 Sult2a6-202ENSMUST00000184731 664 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
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Usp48Q3V0C5 Olfr1509-203ENSMUST00000206100 1161 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
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Usp48Q3V0C5 Gm36843-201ENSMUST00000209303 627 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Olfr929-ps1-201ENSMUST00000216338 585 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 AC161245.1-201ENSMUST00000217207 740 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 Gm19599-201ENSMUST00000218898 358 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Usp48Q3V0C5 CT010456.3-201ENSMUST00000221210 523 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
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