Protein–RNA interactions for Protein: Q3USL1

Klhdc9, Kelch domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc9Q3USL1 Gm24469-201ENSMUST00000104487 131 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Gm22676-201ENSMUST00000116972 129 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Gm14985-201ENSMUST00000118693 786 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Defa-ps14-201ENSMUST00000121373 418 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 8030443G20Rik-201ENSMUST00000140919 903 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 1700123O12Rik-204ENSMUST00000146783 577 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Gm8374-201ENSMUST00000163826 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Vmn2r-ps23-201ENSMUST00000178719 571 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Gm28503-201ENSMUST00000185966 147 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Ly6e-215ENSMUST00000191436 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Olfr416-ps1-201ENSMUST00000192734 804 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Gm20177-201ENSMUST00000203705 334 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Gm8137-201ENSMUST00000218997 463 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 AC121599.1-201ENSMUST00000224276 449 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 AC154840.1-201ENSMUST00000225216 408 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 AC154283.1-201ENSMUST00000228417 389 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Olfr1323-201ENSMUST00000057071 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Ctsj-201ENSMUST00000071526 1271 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Gm5458-201ENSMUST00000096121 997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Nme7-202ENSMUST00000191947 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Cnot4-207ENSMUST00000202417 3296 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 9230109A22Rik-202ENSMUST00000228644 1853 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Amd1-201ENSMUST00000099945 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Olfr447-202ENSMUST00000216408 3185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Olfr312-202ENSMUST00000216407 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Vmn2r89-202ENSMUST00000159734 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Pls3-203ENSMUST00000114058 3032 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Stag2-203ENSMUST00000115073 6171 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 4930402F11Rik-204ENSMUST00000208612 1405 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Gm8878-201ENSMUST00000173552 1725 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Olfr417-203ENSMUST00000220394 6080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Gm29048-202ENSMUST00000190399 1601 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Olfr57-202ENSMUST00000203906 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Gm38368-201ENSMUST00000193181 1335 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Gm37087-201ENSMUST00000192966 3309 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Gm37752-201ENSMUST00000193494 3309 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Vmn1r6-202ENSMUST00000226689 8453 ntAPPRIS P2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Usp46-202ENSMUST00000119154 4738 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Gm43843-201ENSMUST00000202396 1587 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Olfr1232-202ENSMUST00000213860 2413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Klhl24-201ENSMUST00000023509 6683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Gm26300-201ENSMUST00000102282 94 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Gm22657-201ENSMUST00000104197 132 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Gm13491-201ENSMUST00000118267 235 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Gm12328-201ENSMUST00000118611 197 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Gm14831-201ENSMUST00000120253 409 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Olfr1274-ps-201ENSMUST00000120681 1035 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Gm13209-201ENSMUST00000138492 494 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 2310030A07Rik-201ENSMUST00000186460 610 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Hmgn3-205ENSMUST00000187193 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Gm33050-201ENSMUST00000198132 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Gm42663-201ENSMUST00000199883 351 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Gm42761-201ENSMUST00000201899 738 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Gm32308-201ENSMUST00000203053 280 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Gm8999-201ENSMUST00000204951 969 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Gm44603-201ENSMUST00000206820 367 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Gm20586-201ENSMUST00000210122 547 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Olfr489-ps1-201ENSMUST00000210404 967 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Gm31786-202ENSMUST00000212428 676 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 AC110816.1-201ENSMUST00000218559 980 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 AC131117.2-203ENSMUST00000225886 950 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Spata19-201ENSMUST00000034473 697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Olfr1093-201ENSMUST00000055273 969 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Vmn1r33-201ENSMUST00000079678 1036 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Snora52-201ENSMUST00000082732 137 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Gm25147-201ENSMUST00000083030 105 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 A630073D07Rik-201ENSMUST00000091791 484 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Lypd6-205ENSMUST00000169232 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 6720464F23Rik-201ENSMUST00000193946 3496 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Gnal-202ENSMUST00000076605 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Dnase2b-202ENSMUST00000200633 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Olfr93-203ENSMUST00000219235 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Gm26814-201ENSMUST00000181178 4149 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Psd3-205ENSMUST00000098696 11316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Zfp229-203ENSMUST00000182603 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Zfp280c-201ENSMUST00000072292 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Ceacam3-201ENSMUST00000108491 3261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Vmn1r52-208ENSMUST00000228665 3226 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Kmt2c-201ENSMUST00000045291 14967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Rbm44-201ENSMUST00000094698 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Sel1l2-202ENSMUST00000122367 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 4930444P10Rik-201ENSMUST00000115367 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Olfr1149-ps1-201ENSMUST00000118232 691 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Gm24382-201ENSMUST00000122698 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Gm16321-201ENSMUST00000155184 574 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Gm25907-201ENSMUST00000158486 125 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Vmn2r-ps66-201ENSMUST00000173203 1256 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Gm4412-201ENSMUST00000186660 433 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 B230110G15Rik-201ENSMUST00000190868 772 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Gm43237-201ENSMUST00000196835 1044 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Gm43309-201ENSMUST00000200837 458 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Gm32916-203ENSMUST00000208033 789 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Olfr1486-ps1-201ENSMUST00000208835 220 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Gm45261-201ENSMUST00000211023 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 AC137127.3-201ENSMUST00000213340 349 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Olfr114-201ENSMUST00000076914 1000 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Klhdc9Q3USL1 Olfr1321-201ENSMUST00000088876 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms