Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 9530003O04Rik-201ENSMUST00000192663 908 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm37070-201ENSMUST00000193272 460 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Klra14-ps-202ENSMUST00000203601 1104 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm44137-201ENSMUST00000203670 367 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm45690-201ENSMUST00000210775 246 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm7607-201ENSMUST00000214920 518 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Olfr844-201ENSMUST00000054106 930 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Olfr803-201ENSMUST00000056736 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Olfr1497-201ENSMUST00000061993 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Stxbp3-ps-201ENSMUST00000090527 758 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm43682-201ENSMUST00000202150 2090 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Olfr633-202ENSMUST00000216006 3915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Ireb2-201ENSMUST00000034843 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm38128-201ENSMUST00000192085 3250 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 St18-213ENSMUST00000163727 5604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm14857-201ENSMUST00000117862 3185 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Eif2s2-205ENSMUST00000166171 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Cpb2-201ENSMUST00000022576 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm44751-201ENSMUST00000208302 4387 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Zfp583-202ENSMUST00000108560 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm17175-201ENSMUST00000172117 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 S100pbp-201ENSMUST00000049081 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm5890-201ENSMUST00000190145 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm6818-201ENSMUST00000190556 2558 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Hspa9-ps1-201ENSMUST00000119602 1933 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Cd200r3-204ENSMUST00000114612 731 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Ube2v2-204ENSMUST00000118236 893 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm14831-201ENSMUST00000120253 409 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm13808-201ENSMUST00000121353 184 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Olfr75-ps1-201ENSMUST00000135477 938 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Hnf1aos2-201ENSMUST00000138108 442 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Vmn1r5-201ENSMUST00000164307 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm3727-201ENSMUST00000168458 995 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Cd200r3-210ENSMUST00000171779 1223 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 1700121L03Rik-201ENSMUST00000187796 704 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm28438-201ENSMUST00000188299 345 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm37857-201ENSMUST00000191784 1199 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm38330-201ENSMUST00000192743 959 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm38360-201ENSMUST00000195130 454 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm38509-201ENSMUST00000197492 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm43464-201ENSMUST00000198003 317 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm42502-201ENSMUST00000198550 1089 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm43794-201ENSMUST00000200971 692 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm43262-201ENSMUST00000202970 1219 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm19921-201ENSMUST00000210505 703 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm7706-202ENSMUST00000211278 590 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 AC154264.1-201ENSMUST00000216064 386 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm46102-201ENSMUST00000217005 731 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 AC123830.1-201ENSMUST00000217156 609 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Gm6362-201ENSMUST00000217686 836 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 AC101709.1-201ENSMUST00000220276 909 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 AC134860.4-201ENSMUST00000223592 978 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Smr3a-201ENSMUST00000031211 635 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Cd200r3-201ENSMUST00000048479 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Olfr229-201ENSMUST00000076802 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Olfr196-201ENSMUST00000077027 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Cd200r3-202ENSMUST00000077178 767 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Olfr192-201ENSMUST00000080251 925 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 mt-Nd3-201ENSMUST00000082411 348 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Defb25-201ENSMUST00000099203 293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Clca3a1-202ENSMUST00000059091 3524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Tmc1-201ENSMUST00000039500 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim71Q1PSW8 Olfr828-202ENSMUST00000215380 1689 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Iqch-203ENSMUST00000163624 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm44695-201ENSMUST00000205567 1631 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Uty-204ENSMUST00000139365 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm17791-201ENSMUST00000185660 1501 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 AC169985.1-201ENSMUST00000223648 2439 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm37018-201ENSMUST00000192441 3869 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 AC158115.2-201ENSMUST00000221804 5563 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Maoa-201ENSMUST00000026013 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Wdr17-209ENSMUST00000150488 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Glmn-203ENSMUST00000100949 1759 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Fbxw14-203ENSMUST00000198844 1786 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 A330087D11Rik-201ENSMUST00000187265 1334 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm42798-201ENSMUST00000200853 3972 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Atad2-208ENSMUST00000228783 3472 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Hbb-bh2-201ENSMUST00000106866 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm16089-201ENSMUST00000117679 336 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm12110-201ENSMUST00000121601 579 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Nr6a1os-202ENSMUST00000151229 525 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 G630016G05Rik-201ENSMUST00000152412 796 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm25383-201ENSMUST00000157810 144 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm17202-201ENSMUST00000171723 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Mir6400-201ENSMUST00000184870 92 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 2010005H15Rik-202ENSMUST00000187183 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm18117-201ENSMUST00000187720 742 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm2979-201ENSMUST00000193442 463 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 4930590L20Rik-201ENSMUST00000193820 553 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 1700016F12Rik-201ENSMUST00000198159 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm7298-201ENSMUST00000204124 4657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm45701-201ENSMUST00000212049 235 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Spata19-202ENSMUST00000214158 627 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 CT025665.1-201ENSMUST00000215251 1199 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 4933411E02Rik-201ENSMUST00000216779 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Gm34719-201ENSMUST00000222231 382 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 AC156576.2-202ENSMUST00000222525 411 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Prl3b1-201ENSMUST00000035273 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim71Q1PSW8 Olfr655-201ENSMUST00000057385 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.3 ms