Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Sdr16c6-201ENSMUST00000095151 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Gm5796-201ENSMUST00000096184 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Btbd35f1-201ENSMUST00000178070 1955 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Plcz1-201ENSMUST00000032356 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Zfp759-201ENSMUST00000052716 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Ermn-201ENSMUST00000090940 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
Rpl28P41105 Ssxb10-201ENSMUST00000103003 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Igkv4-92-201ENSMUST00000103332 351 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Gm25422-201ENSMUST00000104219 129 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Mup-ps19-201ENSMUST00000120390 519 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Zfp783-203ENSMUST00000130463 537 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Gm11636-201ENSMUST00000152172 774 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Gm14216-202ENSMUST00000155334 492 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 AY512915-204ENSMUST00000162315 676 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Gm17669-201ENSMUST00000163749 465 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Gm20545-201ENSMUST00000174739 210 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Mir3572-201ENSMUST00000175549 86 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Obox4-ps23-201ENSMUST00000175738 1137 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Obox4-ps33-201ENSMUST00000176649 1139 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Gm20767-201ENSMUST00000179071 510 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Obox4-ps22-201ENSMUST00000179602 1137 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Obox4-ps13-201ENSMUST00000180123 1137 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Pafah1b1-ps1-201ENSMUST00000181263 1046 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Gm27602-201ENSMUST00000183861 111 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Mir7211-201ENSMUST00000184071 63 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Rhoay-ps2-201ENSMUST00000186362 581 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Gm2325-201ENSMUST00000186637 581 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Gm8241-201ENSMUST00000189286 816 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 2610509F24Rik-201ENSMUST00000193035 838 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Gm2147-201ENSMUST00000193588 639 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Ccl12-201ENSMUST00000000194 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Gm9480-201ENSMUST00000198038 616 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Mir6906-201ENSMUST00000198998 58 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Mir219c-201ENSMUST00000199860 60 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Chaer1-201ENSMUST00000201649 651 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Gm15754-202ENSMUST00000202846 758 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Gm34149-201ENSMUST00000203547 304 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Cers3-202ENSMUST00000208521 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 CT025665.1-201ENSMUST00000215251 1199 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Gm6477-201ENSMUST00000217098 764 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 AC132474.2-201ENSMUST00000217414 573 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Gm3942-201ENSMUST00000218495 666 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Gm5750-201ENSMUST00000218711 801 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Mrpl42-203ENSMUST00000218893 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 AC127242.4-201ENSMUST00000221242 470 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Gm16497-202ENSMUST00000223480 557 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 AC154840.1-201ENSMUST00000225216 408 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 AC102291.1-201ENSMUST00000227164 529 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Glod5-201ENSMUST00000033503 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Olfr720-201ENSMUST00000035250 1023 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Olfr816-201ENSMUST00000071605 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Olfr664-201ENSMUST00000072887 966 ntAPPRIS P5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Macf1-201ENSMUST00000082108 17331 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 BC061195-201ENSMUST00000088133 577 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 1700003E24Rik-201ENSMUST00000088134 577 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Defa31-201ENSMUST00000098896 377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Olfr1277-201ENSMUST00000099619 962 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Tenm1-203ENSMUST00000115059 12879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Gpr65-201ENSMUST00000075072 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 AC153532.3-201ENSMUST00000218660 3848 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Vmn1r213-203ENSMUST00000228031 3367 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Dync2h1-204ENSMUST00000140466 14264 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Fnbp1l-203ENSMUST00000162947 1830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Olfr1480-202ENSMUST00000207093 1819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Olfr1480-204ENSMUST00000207987 1804 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Gm2987-201ENSMUST00000187673 1693 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Akap6-201ENSMUST00000095737 14847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Gm13575-201ENSMUST00000142353 1520 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 4933403O08Rik-202ENSMUST00000152343 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Gm16513-201ENSMUST00000101023 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Fat3-205ENSMUST00000217308 18760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Ogt-202ENSMUST00000119299 3840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Vmn1r39-207ENSMUST00000228862 2398 ntAPPRIS P2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Vmn2r-ps11-201ENSMUST00000176568 2730 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Akr1c14-201ENSMUST00000041768 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 AC127371.2-201ENSMUST00000228108 1933 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Gm42397-205ENSMUST00000208692 1449 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Vmn2r83-201ENSMUST00000167976 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Dbi-202ENSMUST00000112648 504 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Fam107b-205ENSMUST00000115055 515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Gm14806-201ENSMUST00000116606 2110 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Olfr1274-ps-201ENSMUST00000120681 1035 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Gm12731-201ENSMUST00000120932 268 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Olfr1003-ps1-201ENSMUST00000122238 717 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Gm9428-201ENSMUST00000127214 769 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 4930556G01Rik-201ENSMUST00000128925 891 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Gm16220-201ENSMUST00000131874 405 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Gm26490-201ENSMUST00000157879 140 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Gm23030-201ENSMUST00000158004 273 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Gm23662-201ENSMUST00000158046 111 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Gm22518-201ENSMUST00000158267 68 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Gm25714-201ENSMUST00000158626 296 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Iltifb-201ENSMUST00000163808 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Gm3216-201ENSMUST00000166927 486 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Gm3141-201ENSMUST00000168726 499 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Naa60-210ENSMUST00000176224 501 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Gm5849-201ENSMUST00000180151 351 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rpl28P41105 Gm29532-201ENSMUST00000185593 622 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
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