Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Pkd1l3-202ENSMUST00000109242 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PtprmP28828 AC163032.1-201ENSMUST00000220671 2970 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Kcnma1-202ENSMUST00000074983 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Zfp933-201ENSMUST00000105718 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PtprmP28828 AC160029.1-201ENSMUST00000219628 2678 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Gm43210-201ENSMUST00000196743 6152 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Gm37018-201ENSMUST00000192441 3869 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Gm43229-201ENSMUST00000201812 1850 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PtprmP28828 AC120347.1-201ENSMUST00000223326 1639 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Map2-202ENSMUST00000077355 5125 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Cntnap3-201ENSMUST00000091554 6344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Arfgef3-202ENSMUST00000215836 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Slc17a3-201ENSMUST00000039721 4276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Olfr107-203ENSMUST00000215947 3954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Olfr819-202ENSMUST00000216322 3930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Gm14909-201ENSMUST00000117853 351 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Gm11833-201ENSMUST00000118393 853 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Gm23046-201ENSMUST00000158369 284 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PtprmP28828 AL645522.1-201ENSMUST00000197692 104 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Fbxw15-203ENSMUST00000198397 927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Gm45081-201ENSMUST00000206281 572 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Gm45870-201ENSMUST00000211269 601 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Gm18507-201ENSMUST00000218855 525 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PtprmP28828 AC132384.6-201ENSMUST00000218976 1206 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Samd8-202ENSMUST00000119430 6801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Pcdh15-234ENSMUST00000191854 9104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PtprmP28828 AC131667.1-201ENSMUST00000214665 2175 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Fam13a-201ENSMUST00000089860 5786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Kdm4c-202ENSMUST00000077851 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PtprmP28828 C87977-204ENSMUST00000105757 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Gm44695-201ENSMUST00000205567 1631 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Gm5444-201ENSMUST00000065956 2468 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Nmd3-201ENSMUST00000029358 9135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Gm37834-201ENSMUST00000194517 3035 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Gm30332-201ENSMUST00000204221 2345 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Mapre1-201ENSMUST00000028981 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PtprmP28828 AC159002.2-201ENSMUST00000228843 4874 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Rprd2-202ENSMUST00000197449 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Gm27162-201ENSMUST00000185169 2478 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Gm24124-201ENSMUST00000104103 132 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Gm25169-201ENSMUST00000104190 129 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Gm12852-201ENSMUST00000119478 719 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Gm15390-201ENSMUST00000120323 738 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Gm23391-201ENSMUST00000157579 104 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Gm3091-201ENSMUST00000163408 484 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Gm6337-202ENSMUST00000170613 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Gm28957-201ENSMUST00000190174 373 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Gm34716-201ENSMUST00000194060 621 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Gm10048-201ENSMUST00000194196 372 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Gm30353-202ENSMUST00000195486 622 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Gm38832-201ENSMUST00000205674 400 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Olfr562-ps1-201ENSMUST00000210779 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Gm31786-202ENSMUST00000212428 676 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Ifngas1-201ENSMUST00000220034 1121 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PtprmP28828 AC154742.1-201ENSMUST00000223477 573 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Olfr564-201ENSMUST00000061096 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Ube2dnl2-201ENSMUST00000062695 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Ssxb5-201ENSMUST00000089370 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Cd59b-201ENSMUST00000090429 796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Slc9c1-201ENSMUST00000159945 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Gm42551-201ENSMUST00000197701 1573 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Gm45885-202ENSMUST00000211520 1383 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Myt1l-202ENSMUST00000049784 7202 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Cdh7-209ENSMUST00000172005 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Zscan4-ps2-201ENSMUST00000091440 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Arpp19-203ENSMUST00000166549 1747 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Ncoa7-203ENSMUST00000213836 2989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Stx17-202ENSMUST00000107720 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Sulf1-202ENSMUST00000177608 5598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PtprmP28828 Zfp708-202ENSMUST00000109743 2536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Gm42994-201ENSMUST00000195964 2549 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Sytl2-202ENSMUST00000107210 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtprmP28828 AC139754.3-201ENSMUST00000220444 1627 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Olfr75-ps1-201ENSMUST00000135477 938 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PtprmP28828 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Gm17546-201ENSMUST00000168960 733 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Mir7022-201ENSMUST00000183749 61 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Gm28304-201ENSMUST00000185977 312 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Gm29256-201ENSMUST00000189094 312 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Gm28484-201ENSMUST00000190606 312 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Gm44214-201ENSMUST00000204153 606 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PtprmP28828 AC134439.1-201ENSMUST00000220923 600 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Tas2r102-201ENSMUST00000069268 1044 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Gm24031-201ENSMUST00000083930 131 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Olfr33-201ENSMUST00000084817 957 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Olfr1259-202ENSMUST00000214846 4325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Gm2832-201ENSMUST00000172412 1760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Gm43426-201ENSMUST00000197287 2597 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Zranb3-203ENSMUST00000112538 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Celf2-214ENSMUST00000170438 8856 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Olfr390-204ENSMUST00000215161 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Olfr922-202ENSMUST00000213164 4028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Vmn2r117-201ENSMUST00000171996 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Homez-201ENSMUST00000081162 5609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Zbbx-201ENSMUST00000039269 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Yae1d1-201ENSMUST00000099735 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Cenpe-201ENSMUST00000062893 7910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Olfr3-201ENSMUST00000100151 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PtprmP28828 Lrrc69-202ENSMUST00000108276 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
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