Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 4933417A18Rik-201ENSMUST00000160279 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm16563-201ENSMUST00000162673 423 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm6872-201ENSMUST00000165001 700 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm9027-201ENSMUST00000165914 661 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm20523-201ENSMUST00000174340 1124 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm20826-201ENSMUST00000179256 758 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RxraP28700 1110046J04Rik-203ENSMUST00000181800 777 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RxraP28700 1700111N16Rik-201ENSMUST00000188663 1133 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm37719-201ENSMUST00000194615 292 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm37215-201ENSMUST00000194927 1259 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm38360-201ENSMUST00000195130 454 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm17967-201ENSMUST00000195319 647 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm19060-201ENSMUST00000201959 421 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm44088-201ENSMUST00000204595 237 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm44954-201ENSMUST00000208513 227 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm34096-201ENSMUST00000211296 530 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm38574-201ENSMUST00000211855 640 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm45721-201ENSMUST00000212267 607 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm45722-201ENSMUST00000213075 466 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RxraP28700 AC123944.2-201ENSMUST00000215290 382 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm10037-204ENSMUST00000222626 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RxraP28700 AC154556.1-201ENSMUST00000224587 885 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm5087-204ENSMUST00000225820 645 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RxraP28700 AC132833.3-201ENSMUST00000227472 866 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RxraP28700 CT025525.3-201ENSMUST00000228858 366 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RxraP28700 Vmn1r177-201ENSMUST00000073967 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RxraP28700 n-R5s205-201ENSMUST00000083149 125 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm4070-202ENSMUST00000176467 9007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gvin1-202ENSMUST00000183409 9005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RxraP28700 Ehf-201ENSMUST00000090475 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RxraP28700 Akr1e1-201ENSMUST00000091848 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RxraP28700 E330014E10Rik-201ENSMUST00000071182 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RxraP28700 Tbpl2-201ENSMUST00000080453 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm2832-201ENSMUST00000172412 1760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RxraP28700 Chrm3-201ENSMUST00000063093 1770 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm15675-201ENSMUST00000130486 3681 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RxraP28700 Trim5-202ENSMUST00000098179 3655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm32592-201ENSMUST00000205146 3124 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RxraP28700 Ugt2b35-201ENSMUST00000031186 3359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm37677-201ENSMUST00000194520 7634 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RxraP28700 Olfr59-201ENSMUST00000143976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RxraP28700 Ktn1-203ENSMUST00000185940 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RxraP28700 Ktn1-208ENSMUST00000187039 3875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm43437-201ENSMUST00000198535 3955 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm44562-201ENSMUST00000207194 1347 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RxraP28700 Slfn4-201ENSMUST00000000208 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
RxraP28700 Olfr733-204ENSMUST00000216195 3669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RxraP28700 Ptprd-204ENSMUST00000102834 8084 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
RxraP28700 Zfp607a-203ENSMUST00000205715 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RxraP28700 Lrif1-203ENSMUST00000106736 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
RxraP28700 Fat1-203ENSMUST00000189017 14651 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RxraP28700 Fat1-201ENSMUST00000098796 14627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RxraP28700 Igkv8-26-201ENSMUST00000103382 371 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RxraP28700 Olfr475-ps1-201ENSMUST00000117982 932 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm16200-201ENSMUST00000120385 331 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm25459-201ENSMUST00000157953 114 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RxraP28700 Adgrg4-206ENSMUST00000168724 531 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RxraP28700 Pfdn5-208ENSMUST00000170627 330 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm22111-201ENSMUST00000178010 79 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm23687-201ENSMUST00000178664 79 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm24566-201ENSMUST00000179286 79 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm23305-201ENSMUST00000179342 79 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm26389-201ENSMUST00000179819 79 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm22130-201ENSMUST00000179979 79 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm22393-201ENSMUST00000180153 79 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm25085-201ENSMUST00000180298 79 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm27148-201ENSMUST00000185086 160 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm27985-201ENSMUST00000185112 378 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm8419-201ENSMUST00000189886 412 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm29478-201ENSMUST00000191272 688 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RxraP28700 Igkv4-75-201ENSMUST00000197204 359 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm7733-201ENSMUST00000199038 919 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm9245-201ENSMUST00000200528 983 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RxraP28700 1700019F05Rik-201ENSMUST00000202487 533 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm44134-202ENSMUST00000204777 545 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm44580-201ENSMUST00000206333 877 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm5176-201ENSMUST00000218244 1227 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RxraP28700 AC116724.1-201ENSMUST00000227900 972 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RxraP28700 Olfr697-201ENSMUST00000050541 1047 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RxraP28700 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RxraP28700 Olfr875-201ENSMUST00000080634 1004 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gml2-201ENSMUST00000096399 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
RxraP28700 Olfr598-201ENSMUST00000098202 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm2016-201ENSMUST00000110147 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm42540-201ENSMUST00000200319 2008 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RxraP28700 Olfr738-203ENSMUST00000214853 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RxraP28700 Vmn2r95-201ENSMUST00000166327 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RxraP28700 Nlrp1b-202ENSMUST00000108514 3541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RxraP28700 Elavl4-201ENSMUST00000102722 4107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
RxraP28700 Elavl4-203ENSMUST00000106597 4149 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm42686-201ENSMUST00000199172 4108 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm37049-201ENSMUST00000194356 1983 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RxraP28700 Btbd35f14-201ENSMUST00000105117 1701 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RxraP28700 Gm16294-201ENSMUST00000070382 1459 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RxraP28700 Kcnma1-204ENSMUST00000112423 3664 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RxraP28700 Trim30b-201ENSMUST00000106831 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
RxraP28700 Pot1a-203ENSMUST00000115330 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
RxraP28700 Serpina3b-201ENSMUST00000085052 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
RxraP28700 Zfp583-202ENSMUST00000108560 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.3 ms